WikiDer > SroB РНК

SroB RNA
sroB РНК
RF00368.jpg
Идентификаторы
СимволsroB
РфамRF00368
Прочие данные
РНК типГен; мРНК
Домен (ы)Бактерии
ТАКТАК: 0000655
PDB структурыPDBe

В sroB РНК (также известный как MicM, rybC или ChiX) - это некодирующая РНК ген длиной 90 нуклеотидов. sroB обнаружен у нескольких видов энтеробактерий, но его функция неизвестна.[1][2]SroB находится в межгенной области на противоположной нити по отношению к ybaK и гены ybaP.[1] SroB выражается в стационарной фазе.[1]Эксперименты показали, что SroB - это Hfq-связывающая мРНК.[2][3]

Дополнительные данные показали, что SroB негативно регулирует белок внешней мембраны. YbfM секвестрируя сайт связывания рибосомы мРНК ybfM посредством антисмыслового взаимодействия.[4] SroB также регулирует DpiA / DpiB двухкомпонентная система.[5]Кроме того, сам SroB, по-видимому, является целью некодирующей транскрипции из chbBC межгенный регион.[6][7][8]

Рекомендации

  1. ^ а б c Vogel J, Bartels V, Tang TH и др. (2003). «RNomics в Escherichia coli обнаруживает новые виды мРНК и указывает на параллельный выход транскрипции у бактерий». Нуклеиновые кислоты Res. 31 (22): 6435–6443. Дои:10.1093 / нар / gkg867. ЧВК 275561. PMID 14602901.
  2. ^ а б Zhang A, Wassarman KM, Rosenow C, Tjaden BC, Storz G, Gottesman S (ноябрь 2003 г.). «Глобальный анализ малых РНК и мРНК-мишеней Hfq». Мол. Микробиол. 50 (4): 1111–1124. Дои:10.1046 / j.1365-2958.2003.03734.x. PMID 14622403. Архивировано из оригинал на 2013-01-05.
  3. ^ Ситтка А., Луккини С., Папенфорт К. и др. (2008). Буркхолдер WF (ред.). «Глубокий анализ секвенирования малых некодирующих РНК и мРНК-мишеней глобального посттранскрипционного регулятора Hfq». PLoS Genet. 4 (8): e1000163. Дои:10.1371 / journal.pgen.1000163. ЧВК 2515195. PMID 18725932.
  4. ^ Расмуссен А.А., Йохансен Дж., Нильсен Дж. С., Овергаард М., Каллиполитис Б, Валентин-Хансен П. (апрель 2009 г.). «Консервативная малая РНК способствует подавлению белка внешней мембраны YbfM». Мол. Микробиол. 72 (3): 566–577. Дои:10.1111 / j.1365-2958.2009.06688.x. PMID 19400782. Архивировано из оригинал на 2013-01-05.
  5. ^ Mandin, P .; Готтесман, С. (2009). «Генетический подход к поиску малых РНК-регуляторов интересующих генов идентифицирует RybC как регулирующий двухкомпонентную систему DpiA / DpiB». Молекулярная микробиология. 72 (3): 551–565. Дои:10.1111 / j.1365-2958.2009.06665.x. ЧВК 2714224. PMID 19426207.
  6. ^ Овергаард М., Йохансен Дж., Мёллер-Йенсен Дж., Валентин-Хансен П. (2009). «Отключение регуляции малых РНК с помощью ловушки-мРНК». Мол Микробиол. 73 (5): 790–800. Дои:10.1111 / j.1365-2958.2009.06807.x. PMID 19682266.
  7. ^ Фогель Дж (июль 2009 г.). «РНК-ловушка помогает бактериям максимально использовать хитосахар». Мол. Микробиол. 73 (5): 737–741. Дои:10.1111 / j.1365-2958.2009.06806.x. PMID 19659640. Архивировано из оригинал на 2013-01-05.
  8. ^ Фигероа-Босси Н., Валентини М., Маллерет Л., Фиорини Ф, Босси Л. (2009). «Пойманный собственной игрой: регуляторная малая РНК, инактивированная индуцибельным транскриптом, имитирующим свою цель». Genes Dev. 23 (17): 2004–2015. Дои:10.1101 / gad.541609. ЧВК 2751969. PMID 19638370.

дальнейшее чтение

  • Пламбридж Дж., Босси Л., Оберто Дж., Уэйд Дж. Т., Фигероа-Босси Н. (5 марта 2014 г.). «Взаимодействие транскрипционных и малых РНК-зависимых механизмов контроля регулирует поглощение хитосахара Escherichia coli и Salmonella». Молекулярная микробиология. 92 (4): 648–658. Дои:10.1111 / мм. 12573. PMID 24593230.

внешняя ссылка