WikiDer > Stemloc
Stemloc
| Разработчики) | Ян Холмс (Калифорнийский университет в Беркли) |
|---|---|
| Стабильный выпуск | 1 |
| Операционная система | UNIX, Linux, Mac, Cygwin на Windows XP |
| Тип | Инструмент биоинформатики |
| Лицензия | Открытый исходный код |
| Интернет сайт | Домашняя страница Stemloc |
Stemloc программа для попарного структурного выравнивания РНК на основе вероятностных моделей Структура РНК известный как Парные стохастические контекстно-свободные грамматики. Stemloc реализует ограниченные версии алгоритмов Санкоффа для одновременного предсказания структуры и выравнивание последовательностей множества РНК.
Stemloc можно скачать как часть Пакет программного обеспечения DART. Он принимает входные файлы в любом ФАСТА или же Стокгольмский формат.
Рекомендации
- Холмс И. (2005) Ускоренный вероятностный вывод эволюции структуры РНК. BMC Bioinformatics. 24 марта 2005 г .; 6:73.
внешняя ссылка
- Stemloc домашняя страница и руководство