WikiDer > Стигиелла - Википедия
| Стигиелла | |
|---|---|
Научная классификация  | |
| Домен: | Эукариоты |
| Учебный класс: | Jakobea |
| Заказ: | Якобида |
| Семья: | Стигиеллиды |
| Род: | Стигиелла Панек, Таборски и Чепичка 2015 ..[1] |
| Разновидность | |
Стигиелла /ˌStɪ.d͡ʒiˈɛ.lə/ это род свободноживущих морских жгутиконосцы принадлежность к семье Стигиеллиды в Якобиды (экскаватор)[1].
В настоящее время род включает четыре вида, все из которых являются вторичными. облигатные анаэробы.[1]. Все виды одноклеточные и имеют форму полумесяца.[1][2]. Все участники обладают гидрогеносомы, тип акристатных митохондрий органелла (MRO), который производит водород в качестве продукта метаболизма[1][3]. Стигиелла - это глубоко ветвящийся генов внутри раскопок, а гены гидрогеносом иногда демонстрируют механизмы, подобные эубактериям, которые были полезны для изучения эволюционной истории митохондрий эукариот[1][3]
Этимология
Стигиелла это недавно созданное уменьшительное, основанное на имени греческой богини реки Стикс, который в греческой мифологии образовывал границу между Землей и Подземным миром.[4]
История
Виды Stygiella incarcerata впервые был описан Бернардом и др. в 2000 г., образцы взяты из залива Квирбрей, Австралия, и залива Нива, Дания; но этот вид, возможно, был ранее замечен Фентелом и др. в 1995 году в Датском фьорде.[2][5]. Первоначально вид был отнесен к роду Якоба, с именем Jakoba incarcerata[2]. Позже анализ 18S рРНК Lara et al. показали сильную филогенетическую связь между J. incarcerata и Андалусия Годой- недавно описанный двухфлагеллированный якобид из почвы; поэтому исследователи переместили этот вид в новый род Андалусия в 2006 г.[6]
В 2015 году Панек и др. Проанализировали анаэробные клоны якобидов по ДНК SSU и шести генам, кодирующим белок.[1]. Результаты указывают на сильную кладу всех анаэробных якобид, образующих новое семейство Stygiellidae с двумя новыми родами: Велунделла и Стигиелла; A. incarcerata был таким образом классифицирован в Стигиеллавместе с тремя недавно открытыми видами[1]
Среда обитания
Все Стигиелла виды были обнаружены в бескислородных отложениях, богатых сульфидами и аммонием, на дне океана или в солоноватой воде.[1][2][3]. Стигиелла виды переносят засоление от 19 до 56 ppt[1]. Все четыре вида успешно культивировались в лабораторных условиях при комнатной температуре.[1][2]
Морфология
Все Стигиелла виды имеют аналогичную морфологию: они представляют собой латерально серповидные или яйцевидные, лепестковидные клетки с заостренными концамиS. incarcerata), а вентральная бороздка ромбовидной формы покрывает большую часть вентральной стороны до заднего конца.[1][2]. У каждого вида есть два различных типа тела: рифленые клетки с широко открытыми бороздками и плавучие клетки с укороченными и более узкими бороздками.[1]. Тела плавательных клеток обычно сужаются от середины к концу, тогда как бороздчатые клетки более яйцевидные.[1]. Сообщаемая длина ячейки обычно составляет от 6,0 до 9,0 мкм.[1][2]
Клетки раздвоены, жгутики берут начало рядом с передним концом бороздки и простираются к переднему и заднему концам клетки.[1][6][7]. Передние жгутики обычно короче, чем длина тела, а задние жгутики обычно более чем в два раза длиннее клетки; задние жгутики S. incarcerata обычно короче, обычно примерно в 1,5 раза больше длины ячейки[1]
Передний жгутик S. incarcerata имеет единый корень из двух слегка разделенных микротрубочки, который берет начало близко к переднему базальное тело в вентральном, заднем конце.[6][7]. Задний жгутик имеет два основных микротрубчатых корня: левый связан с тремя разными немикротрубочковыми волокнами, а также композитным волокном, а правый - одного типа.[6][7]. Кроме того, синглетный «корень» окружает заднюю базальную часть тела и поддерживает форму бороздки.[7]
Спинная лопасть прикрепляется к заднему жгутику, который поддерживается параксонемной пластинкой, которая берет начало около аксонема.[6][7]. Аксонема состоит из типичного эукариотического мотива 9 x 2.[6][7]. Пластинка поднимается над аксонемой и соединяется по крайней мере с двумя дублетами аксонемы примерно через 100 нм от аксонемы.[7]. Его ширина постепенно увеличивается примерно до 700 нм.[7]
Стигиелла виды в основном имеют грушевидное или иногда округлое ядро близко к переднему концу клетки с ядрышком диаметром 0,5 мкм.[1][7]. Одиночный Гольджи диктиосома, обычно от 3 до 8 цистерны расположен сразу за базальными телами[6][7]. Цитоскелет напоминает таковой из других раскопок.[7]. Концентрация рибосомы очень низко в цитозоль[3].
Все виды в Стигиелла обладать акристатом гидрогеносомы который может выполнять только анаэробный синтез АТФ и потерял большую часть своих белков для цепи переноса электронов.[3] Эти гидрогеносомы, обычно от 300 до 500 нм в диаметре и от 0,75 до 1 мкм в длину, лежат близко к ядру и часто связаны с основными корнями микротрубочек жгутиков.[3][7]
Поведение
Клетки могут прикрепляться к субстрату своими жгутиками (чаще всего передним жгутиком) или латеральным или дорсальным телом клетки через заднюю цитоплазматическую проекцию.[1]. Основные морфотипы в S. incarcerata и S. agilis являются плавающими клетками, которые движутся по спирали и лишь изредка прилипают к субстрату[1][7]. Рифленые морфотипы этих видов сначала прикрепляются к субстрату с помощью переднего жгутика, который тянет тело к субстрату и высвобождается, когда прикрепляется задний цитоплазматический выступ. S. adhaerens и S. cryptica представляют собой клетки с крупными бороздками, которые почти всегда прикрепляются к субстрату через передний или редко задний жгутик; у этих видов наблюдалось мало плавающих клеток.[1]
Метаболизм
Гидрогеносомы Стигиелла похоже, что у них отсутствует органелларный геном и большинство субъединиц Комплекса I для цепи переноса электронов, но они содержат белки для декарбоксилирования пирувата, подобные эубактериям, такие как пируват: ферредоксин оксидоредуктаза и [FeFe] -гидрогеназа, которые также существуют в других анаэробных раскопках различных линий.[3]. Эта конвергентная эволюция может быть результатом сходного латерального переноса генов.[3]
По сравнению с некоторыми паразитическими анаэробными раскопками, такими как Влагалищная трихомонада, гидрогеносомы S. incarcerata сохранить больше импортных белков и более функциональный аминокислотный механизм[3]. Кроме того, он имеет окислительный стресс реакция аналогична реакции других анаэробных протистов[3]. Кластеры железо-сера присутствуют в гидрогеносомах, что согласуется со всеми другими органеллами, происходящими из митохондрий.[3].
Список видов
Четыре вида Стигиелла признаются:[1]
- Stygiella incarcerata (Бернард, Симпсон и Паттерсон, 2000) Панек, Табоски и Чепичка, 2015.
- Stygiella adhaerens Панек, Таборски и Чепичка 2015
- Stygiella cryptica Панек, Таборски и Чепичка 2015
- Стигиелла агилис Панек, Таборски и Чепичка 2015
Рекомендации
- ^ а б c d е ж грамм час я j k л м п о п q р s т ты v ш Икс у z Панек, Т., Таборски, П., Пачиадаки, М. Г., Градова, М., Влчек, Ч, Эджкомб, В. П., и Чепичка, И. (2015). Комбинированный подход, основанный на культуре и независимый от культуры, дает представление о разнообразии якобид, чрезвычайно плезиоморфной эукариотической линии.. Frontiers in Microbiology, 6, 1288. Проверено 28 апреля 2020 г. doi: 10.3389 / 2Ffmicb.2015.01288.
- ^ а б c d е ж грамм Бернард, К., Симпсон, А. Г. Б. и Паттерсон, Д. Дж. (2000) Некоторые свободноживущие жгутиконосцы (протисты) из бескислородных местообитаний, Офелия, 52: 2, 113-142, DOI: 10.1080 / 00785236.1999.10409422.
- ^ а б c d е ж грамм час я j k Леже, М. М., Эме, Л., Хуг, Л. А., и Роджер, А. Дж. (2016). [Новые гидрогеносомы в микроаэрофильных якобидах Stygiella incarcerata]. Молекулярная биология и эволюция, 33 (9), 2318-2336. Проверено 28 апреля 2020 г. doi: doi.org/10.1093/2Fmolbev/2Fmsw103.
- ^ Панек, Т., Таборски, П., Пачиадаки, М. Г., Градова, М., Влчек, Ч, Эджкомб, В. П., и Чепичка, И. (2015). Комбинированный подход, основанный на культуре и независимый от культуры, дает представление о разнообразии якобид, чрезвычайно плезиоморфной эукариотической линии (лист данных 2). Frontiers in Microbiology, 6, 1288. Проверено 28 апреля 2020 г. doi: 10.3389 / 2Ffmicb.2015.01288.
- ^ Фенчел, Т., Бернар, К., Эстебан, Г., Финли, Б. Дж., Хансен, П. Дж., И Иверсен, Н. (1995). Разнообразие и активность микробов в датском фьорде с бескислородной глубокой водой. Офелия, 43 (1), 45-100.
- ^ а б c d е ж грамм Лара, Э., Чатзинотас, А., и Симпсон, А. Г. (2006). Андалусия (n. gen.) - самая глубокая ветвь внутри якобид (jakobida; excata), основанная на морфологическом и молекулярном изучении нового жгутиконосца из почвы. Журнал эукариотической микробиологии, 53 (2), 112-120. DOI: 10.1111 / j.1550-7408.2005.00081.x.
- ^ а б c d е ж грамм час я j k л м Симпсон, А. Г., и Паттерсон, Д. Дж. (2001). По керновым якобидам и таксонам из раскопок: ультраструктура Jakoba incarcerata. Журнал эукариотической микробиологии, 48 (4), 480-492. DOI: 10.1111 / j.1550-7408.2001.tb00183.x.