WikiDer > Сопротивление ионам теллура

Tellurium ion resistance

В Семейство сопротивлений к теллуру и ионам (TerC) (TC № 2.A.109) является частью Суперсемейство экспортеров лизина (LysE). Репрезентативный список белков, принадлежащих к семейству TerC, можно найти в База данных классификации транспортеров.[1]

TerC

Семья TerC (Pfam 03741) включает Кишечная палочка Белок TerC (ТК № 2.A.109.1.1), что было связано с сопротивлением теллуру.[2] Предполагается, что он катализирует отток ионов теллура.[2][3] TerC кодируется плазмидой pTE53 из клинического изолята E. coli. Он имеет 346 аминоацильных остатков (aas) и 9 предполагаемых трансмембранных сегментов (TMS) с большой гидрофильной петлей между TMS 5 и 6.[2]

Гомолог в Arabidopsis thaliana (ТК № 9.A.30.2.1) может функционировать в биогенизах протилакоидной мембраны во время раннего развития хлоропластов.[4] Он имеет 384 ААС и 7-8 предполагаемых ТМС. В Кишечная палочка, TerC образует мембранный комплекс с TerB, а также с DctA, PspA, HslU и RplK. Комплекс TerB / TerC может связывать различные функциональные модули с биохимической активностью транспорта C4-дикарбоксилата, стрессовой реакцией внутренней мембраны (регуляторный комплекс белка фагового шока), активностью АТФазы / шаперона и протеосинтезом.[5] Он может быть частью системы реагирования на стресс при обнаружении металла.[6] Совместное присутствие TerC и TerE, но не TerF, коррелирует с устойчивостью к теллуриту при анализе нескольких сотен бактериальных штаммов.[7]

Функция

Реакция, которую предлагается катализировать TerC:

ионы теллура (вход) → ионы теллура (выход).

Смотрите также

дальнейшее чтение

  • Тейлор, Д. Э. (1999). «Бактериальная устойчивость к теллуриту». Тенденции в микробиологии. 7 (3): 111–115. Дои:10.1016 / s0966-842x (99) 01454-7. PMID 10203839.
  • Казанов, д.м.н .; Витрещак, А.Г .; Гельфанд, М. (2007). «Изобилие и функциональное разнообразие рибопереключателей в микробных сообществах». BMC Genomics. 8: 347. Дои:10.1186/1471-2164-8-347. ЧВК 2211319. PMID 17908319.
  • Kwon, K.C .; Чо, М. (2008). «Делеция локализованного в хлоропласте генного продукта AtTerC у Arabidopsis thaliana приводит к потере тилакоидной мембраны и гибели проростков». Завод J. 55 (3): 428–442. Дои:10.1111 / j.1365-313X.2008.03523.x. PMID 18429937.
  • Мейер, M.M .; Hammond, M.C .; Salinas, Y .; Roth, A .; Sudarsan, N .; Брейкер, Р.Р. (2011). «Проблемы идентификации лиганда для кандидатов на рибосвитч». РНК Биол. 8 (1): 5–10. Дои:10.4161 / rna.8.1.13865. ЧВК 3142362. PMID 21317561.

Рекомендации

  1. ^ "2.A.109 Семейство сопротивлений ионам теллура (TerC)". База данных классификации транспортеров. Получено 2016-02-26.
  2. ^ а б c Burian, J .; Вт, Н .; Kl'ucár, L .; Guller, L .; Lloyd-Jones, G .; Stuchlík, S .; Fejdi, P .; Siekel, P .; Turna, J. (1998-01-01). «Клонирование in vivo и in vitro и фенотипическая характеристика детерминанты устойчивости к теллуриту, предоставляемой плазмидой pTE53 клинического изолята Escherichia coli». Folia Microbiologica. 43 (6): 589–599. Дои:10.1007 / bf02816374. ISSN 0015-5632. PMID 10069007. S2CID 44237747.
  3. ^ Кормутакова, Р .; Klucar, L .; Turna, J. (2000-06-01). «Анализ последовательности ДНК детерминанты устойчивости к теллуриту из клинического штамма Escherichia coli и идентификация основных генов». БиоМеталлы. 13 (2): 135–139. Дои:10.1023 / А: 1009272122989. ISSN 0966-0844. PMID 11016400. S2CID 22672098.
  4. ^ Квон, Кванг-Чул; Чо, Мён Хэн (2008-08-01). «Делеция локализованного в хлоропласте генного продукта AtTerC у Arabidopsis thaliana приводит к потере тилакоидной мембраны и гибели проростков». Журнал растений. 55 (3): 428–442. Дои:10.1111 / j.1365-313X.2008.03523.x. ISSN 1365-313X. PMID 18429937.
  5. ^ Турковичова, Л .; Смидак, Р .; Jung, G .; Turna, J .; Lubec, G .; Арадская, Дж. (09.01.2016). «Протеомный анализ взаимодействия TerC: новые ссылки на устойчивость к теллуриту и патогенность». Журнал протеомики. 136: 167–73. Дои:10.1016 / j.jprot.2016.01.003. ISSN 1876-7737. PMID 26778143.
  6. ^ Анантараман, Вивек; Айер, Лакшминараян М .; Аравинд, Л. (30.10.2012). «Тер-зависимые системы реакции на стресс: новые пути, связанные с чувствительностью к металлам, производством нуклеозидоподобного метаболита и процессингом ДНК». Молекулярные биосистемы. 8 (12): 3142–3165. Дои:10.1039 / c2mb25239b. ISSN 1742-2051. ЧВК 4104200. PMID 23044854.
  7. ^ Орт, Доротея; Гриф, Катарина; Dierich, Manfred P .; Вюрцнер, Рейнхард (2007-03-01). «Изменчивость устойчивости к теллуриту и кластера генов ter среди продуцирующих токсин Shiga Escherichia coli, выделенных от людей, животных и продуктов питания». Исследования в области микробиологии. 158 (2): 105–111. Дои:10.1016 / j.resmic.2006.10.007. ISSN 0923-2508. PMID 17317110.