WikiDer > Последовательность сигналов поглощения - Википедия

Uptake signal sequence - Wikipedia

Последовательности сигналов захвата (USS) короткие ДНК последовательности, предпочтительные для компетентных бактерии семьи Pasteurellaceae (например, Haemophilus influenzae). Подобные последовательности, называемые Последовательности захвата ДНК (DUS), встречаются у видов семейства Neisseriaceae (включая Neisseria meningitidis и Neisseria gonorrhoeae).[1]

Neisseria meningitidis

Генетическая трансформация это процесс, посредством которого бактериальная клетка-реципиент берет ДНК из соседней клетки и интегрирует эту ДНК в геном реципиента путем рекомбинация. В N. meningitidisТрансформация ДНК требует присутствия коротких DUS (10-12 меров, находящихся в кодирующих и межгенных областях) донорной ДНК. Специфическое распознавание DUS опосредуется типом IV пилин.[2] Davidsen et al.[3] сообщил, что в N. meningitidis DUS встречаются в значительно большей плотности в генах, участвующих в Ремонт ДНК и рекомбинация (а также в рестрикции-модификации и репликации), чем в других аннотированных группах генов. Эти авторы предположили, что чрезмерное представительство DUS в генах репарации и рекомбинации ДНК может отражать преимущество поддержания целостности механизма репарации и рекомбинации ДНК за счет предпочтительного использования генов поддержания генома, которые могли бы заменить их поврежденные аналоги в геноме клетки-реципиента. Поглощение таких генов могло бы обеспечить механизм для облегчения восстановления после повреждения ДНК. генотоксичный стресс.

Рекомендации

  1. ^ Фрай С.А., Нильсен М., Тёнджум Т., Амбур Огайо (2013). «Диалекты последовательности поглощения ДНК у Neisseriaceae». PLoS Genet. 9 (4): 3065–70. Дои:10.1371 / journal.pgen.1003458. ЧВК 3630211. PMID 23637627.
  2. ^ Сеховин А., Симпсон П.Дж., МакДауэлл М.А., Браун Д.Р., Ношезе Р., Паллетт М., Брэди Дж., Болдуин Г.С., Ли С.М., Мэтьюз С.Дж., Пеликич В. (2013). «Специфическое распознавание ДНК, опосредованное пилином типа IV». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 110 (8): 3065–70. Дои:10.1073 / pnas.1218832110. ЧВК 3581936. PMID 23386723.
  3. ^ Дэвидсен Т., Рёдланд Э.А., Лагесен К., Сиберг Э., Рогнес Т., Тоньюм Т. (2004). «Смещенное распределение последовательностей захвата ДНК по отношению к генам поддержания генома». Нуклеиновые кислоты Res. 32 (3): 1050–8. Дои:10.1093 / нар / гх255. ЧВК 373393. PMID 14960717.

внешняя ссылка