WikiDer > Атлас регуляторной деятельности UTR

Atlas of UTR Regulatory Activity
АУРА
Содержание
ОписаниеАтлас регуляторной деятельности UTR
Связаться с нами
Исследовательский центрCIBIO - Университет Тренто
ЛабораторияЛаборатория трансляционной геномики
АвторыЭрик Дасси, Андреа Малоссини, Анджела Ре, Томмазо Мацца, Тома Тебальди, Луиджи Капути и Алессандро Кваттроне
Дата выхода2014
Доступ
Интернет сайтаура.наука.unitn.Это

В Атлас регуляторной деятельности UTR (АУРА),[1] теперь во второй версии,[2] представляет собой составленный вручную всеобъемлющий каталог человеческих 5 'и 3' нетранслируемые последовательности (UTR) и нормативные аннотации UTR.

Он включает в себя базовую аннотацию, филогенетическую консервацию, сайты связывания для РНК-связывающих белков и миРНК, цис-элементы, данные метилирования и редактирования РНК и многое другое для человека и мыши. Кроме того, благодаря интуитивно понятному веб-интерфейсу он обеспечивает полный доступ к огромному количеству информации, которая объединяет данные о последовательности и структуре РНК, сайтах вариаций, синтении генов, экспрессии генов и белков и функциональные описания генов из научной литературы и специализированных баз данных. В конечном итоге он предоставляет несколько инструментов для пакетного анализа списков генов, позволяя отслеживать посттранскрипционные регуляторные сети.

Смотрите также

использованная литература

  1. ^ Дасси, Э; Малоссини А; Re A; Mazza T; Тебальди Т; Caputi L; Quattrone A (январь 2012 г.). «АУРА: Атлас регуляторной деятельности УТР». Биоинформатика. Англия. 28 (1): 142–143. Дои:10.1093 / биоинформатика / btr608. PMID 22057158.
  2. ^ Дасси, Э; Re A; Leo S; Тебальди Т; Pasini L; Peroni D; Quattrone A (январь 2014 г.). «AURA 2: открытие пост-транскрипционных сетей». Перевод. Англия: Тейлор и Фрэнсис. 2 (1): e27738. Дои:10.4161 / trla.27738. ЧВК 4705823. PMID 26779400.

внешние ссылки