WikiDer > Дискоидиновый домен

Discoidin domain
Домен F5 / 8 типа C
PDB 1fac EBI.jpg
Структура мембрансвязывающего C2 домена фактора VIII.[1]
Идентификаторы
СимволF5_F8_type_C
PfamPF00754
ИнтерПроIPR000421
PROSITEPDOC00988
SCOP21fac / Объем / СУПФАМ
OPM суперсемейство46
Белок OPM1sdd
CDDcd00057

Дискоидиновый домен (также известен как Домен F5 / 8 типа C, или C2-подобный домен) является основным белковый домен из многих факторы свертывания крови.

Факторы свертывания крови V и VIII содержат С-концевой, дважды повторяющийся, домен примерно из 150 аминокислот, который часто называют «С2-подобным доменом» (который не имеет отношения к C2 домен). в Dictyostelium discoideum (Слизистая плесень) белок адгезии клеток дискоидин, родственный домен, названный дискоидин-I-подобным доменом, DLD или DS, был обнаружен, который имеет общую C-концевую область из примерно 110 аминокислот с доменом FA58C, но чей N- концевые 40 аминокислот гораздо менее консервативны. Подобные домены были обнаружены в других внеклеточных и мембранных белках.[2][3][4] В факторах коагуляции V и VIII повторяющиеся домены составляют часть более крупного функционального домена, который способствует связыванию с анионными фосфолипидами на поверхности тромбоцитов и эндотелиальных клеток.[5] Было показано, что C-концевой домен второго повтора FA58C (C2) фактора свертывания VIII отвечает за связывание фосфатидилсерина и необходим для активности.[6][7] FA58C содержит два консервативных цистеина в большинстве белков, которые соединяют концы домена дисульфидной связью.[8][9][10] Еще одна дисульфидная связь расположена рядом с C-концом второго домена FA58C в MFGM. Q08431.[10]

Белки человека, содержащие этот домен

AEBP1; BTBD9; CASPR4; CNTNAP1; CNTNAP2; CNTNAP3; CNTNAP4; CNTNAP5; CPXM1; CPXM2; DCBLD1; DCBLD2; DDR1; DDR2; EDIL3;F5; F8; F8B; MFGE8; NRP1; NRP2; RS1; ССПО; UNC13A

использованная литература

  1. ^ Veeraraghavan S, Baleja JD, Gilbert GE (июнь 1998 г.). «Структура и топография мембрансвязывающего домена C2 фактора VIII в присутствии мицелл додецилфосфохолина». Biochem. J. 332 (Pt 2) (Pt 2): 549–55. Дои:10.1042 / bj3320549. ЧВК 1219512. PMID 9601086.
  2. ^ Дэви EW, Кейн WH (1986). «Клонирование кДНК, кодирующей человеческий фактор V, фактор свертывания крови, гомологичный фактору VIII и церулоплазмину». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 83 (18): 6800–6804. Дои:10.1073 / пнас.83.18.6800. ЧВК 386597. PMID 3092220.
  3. ^ Раттер WJ, Эдман JC, Джонсон JD (1993). «Рецепторная тирозинкиназа, обнаруженная в клетках карциномы груди, имеет внеклеточный дискоидин I-подобный домен». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 90 (12): 5677–5681. Дои:10.1073 / pnas.90.12.5677. ЧВК 46784. PMID 8390675.
  4. ^ Couto JR, Тейлор MR, Годвин SG, Ceriani RL, Peterson JA (1996). «Клонирование и анализ последовательности эпителиального антигена BA46 молочной железы человека выявляет последовательность адгезии RGD-клеток, представленную в домене, подобном эпидермальному фактору роста». ДНК клетки биол. 15 (4): 281–286. Дои:10.1089 / dna.1996.15.281. PMID 8639264.
  5. ^ Дэви EW, Кейн WH (1988). «Факторы свертывания крови V и VIII: структурные и функциональные сходства и их связь с геморрагическими и тромботическими нарушениями». Кровь. 71 (3): 539–555. Дои:10.1182 / кровь.V71.3.539.539. PMID 3125864.
  6. ^ Фостер PA, Fulcher CA, Houghten RA, Zimmerman TS (1990). «Синтетические пептиды фактора VIII с аминокислотными последовательностями, содержащимися в домене C2 фактора VIII, ингибируют связывание фактора VIII с фосфатидилсерином». Кровь. 75 (10): 1999–2004. Дои:10.1182 / blood.V75.10.1999.1999. PMID 2110840.
  7. ^ Кейн WH, Петерсон Дж. А., Ортель Т. Л., Куинн-Аллен М. А., Келлер Ф. Г., Ларокка Д. (1994). «Локализация функционально важных эпитопов во втором домене С-типа фактора свертывания крови V с использованием рекомбинантных химер». J. Biol. Chem. 269 (22): 15898–15905. PMID 7515064.
  8. ^ Манн К.Г., Сюэ Дж., Калафатис М. (1993). «Определение дисульфидных мостиков в легкой цепи фактора Va». Биохимия. 32 (22): 5917–5923. Дои:10.1021 / bi00071a002. PMID 8504111.
  9. ^ Фудзикава К., Макмаллен Б.А., Дэви Е.В., Хеднер Ю., Эзбан М. (1995). «Расположение дисульфидных связей и свободных цистеинов в тяжелой и легкой цепях рекомбинантного человеческого фактора VIII (антигемофильный фактор А)». Белковая наука. 4 (4): 740–746. Дои:10.1002 / pro.5560040413. ЧВК 2143093. PMID 7613471.
  10. ^ а б Петерсен Т.Э., Хваррегаард Дж., Андерсен М. Х., Берглунд Л., Расмуссен Дж. Т. (сентябрь 1996 г.). «Характеристика гликопротеина PAS-6/7 из мембран глобул жира коровьего молока». Евро. J. Biochem. 240 (3): 628–636. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1996.0628h.x. PMID 8856064.
Заметки
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR000421

дальнейшее чтение

Baumgartner, S .; Hofmann, K .; Chiquet-Ehrismann, P .; Бухер, Р. (1998). «Возвращение к семейству дискоидиновых доменов: новые члены от прокариот и предсказание складчатости на основе гомологии». Белковая наука. 7 (7): 1626–1631. Дои:10.1002 / pro.5560070717. ЧВК 2144056. PMID 9684896.