WikiDer > Фимбриальный белок-переводчик
| Фимбриальный белок Usher | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Конструкция монтажной платформы пилуса типа 1 FimD (25-139).[1] | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Usher | ||||||||
| Pfam | PF00577 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR000015 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00886 | ||||||||
| TCDB | 1.B.11 | ||||||||
| OPM суперсемейство | 187 | ||||||||
| Белок OPM | 4j3o | ||||||||
| |||||||||
В фимбриальный белок-переводчик участвует в биогенезе пилус в Грамотрицательные бактерии. Биогенез фимбрий (или пилей) требует двухкомпонентной сборки и транспортной системы, которая состоит из периплазматического шаперона и белка внешней мембраны, который был назван молекулярным «швейцаром».[2][3][4]
Белок-инициатор имеет молекулярную массу от 86 до 100 кДа и состоит из охватывающего мембрану 24-нитевого бета-бочкообразного домена, напоминающего пориныи четырех периплазматических растворимых доменов: N-концевой из примерно 120 остатков (NTD),[1] «средний» домен примерно из 80 остатков[5] расположен в виде растворимой вставки в бета-цилиндрической области последовательности (домен вставки) и двух IG-подобных доменов (каждый длиной около 80 остатков) на С-конце (CTD1 и CTD2).[6] Хотя степень сходства последовательностей этих белков не очень высока, они имеют ряд общих характеристик. Одним из них является наличие двух пар цистеинов, образующих дисульфидные связи, первая из которых расположена в NTD, а вторая - в CTD2. Наилучшая консервативная область последовательности соответствует домену вставки.
Рекомендации
- ^ а б Нишияма М., Хорст Р., Эйдам О. и др. (Июнь 2005 г.). «Структурные основы распознавания комплекса шаперон – субъединица платформой сборки пилуса 1 типа FimD». EMBO J. 24 (12): 2075–86. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600693. ЧВК 1150887. PMID 15920478.
- ^ Халтгрен С.Дж., Джейкоб-Дюбюиссон Ф., Нападающий Р. (1994). «Самосборка пилей с помощью шаперона независимо от клеточной энергии». J. Biol. Chem. 269 (17): 12447–12455. PMID 7909802.
- ^ Шифферли Д.М., Альруц М.А. (1994). «Пермиссивные линкерные сайты встраивания в белок внешней мембраны 987P фимбрий Escherichia coli». J. Bacteriol. 176 (4): 1099–1110. Дои:10.1128 / JB.176.4.1099-1110.1994. ЧВК 205162. PMID 7906265.
- ^ Сайер-младший MH, Ван Росмален M (1993). «Структурные и эволюционные отношения между двумя семействами бактериальных экстрацитоплазматических шапероновых белков, которые функционируют совместно в сборке фимбрий». Res. Микробиол. 144 (7): 507–527. Дои:10.1016 / 0923-2508 (93) 90001-И. PMID 7906046.
- ^ Capitani G, Eidam O, Grütter MG (2006). «Доказательства новой области бактериальных открывателей наружной мембраны». Белки. 65 (4): 816–23. Дои:10.1002 / prot.21147. PMID 17066380. S2CID 28766740.
- ^ Phan G, Remaut H, Wang T., Allen WJ, Pirker KF, Lebedev A, et al. (2011). «Кристаллическая структура помощника FimD, связанного с родственным ему субстратом FimC-FimH». Природа. 474 (7349): 49–53. Дои:10.1038 / природа10109. ЧВК 3162478. PMID 21637253.