WikiDer > HLA-DQ6

HLA-DQ6
HLA-DQ6
(MHC Класс II, DQ антиген клеточной поверхности)
DQ Illustration.PNG
Иллюстрация HLA-DQ со связанным пептидом
Цис-гаплотипГаплотип
изоформаподтипDQA1DQB1
DQ α1.3β6.1DQ6.1*0103*0601
DQ α1.2β6.2DQ6.2*0102*0602
DQ α1.3β6.3DQ6.3*0103*0603
DQ α1.2β6.4DQ6.4*0102*0604
редкие гаплотипы
DQ α1.2β6.3DQ6.3v*0102*0603
DQ α1.3β6.2DQ6.2v*0103*0602
DQ α1.2β6.9DQ6.9*0102*0609


HLA-DQ6 (DQ6) - это человеческий лейкоцитарный антиген серотип в HLA-DQ (DQ) группа серотипа. Серотип определяется по распознаванию антителом β6 подмножество β-цепей DQ. Β-цепь DQ изоформы закодированы HLA-DQB1 locus и DQ6 кодируются HLA-DQB1*06 группа аллелей. Эта группа в настоящее время содержит много общих аллелей, DQB1.*0602 самый распространенный. HLA-DQ6 и DQB1*06 почти синонимы по смыслу. Β-цепи DQ6 объединяются с α-цепями, кодируемыми генетически связанными HLA-DQA1 аллели, чтобы сформировать СНГ-гаплотип изоформы. Однако для DQ6 спаривание цис-изоформ происходит только с DQ1 α-цепи. Есть много гаплотипов DQ6.

Серология

Распознавание DQ6, DQ1 и DQ5 некоторых аллелей Some DQB1 *[1]
DQ6DQ1DQ5N
аллель%%%размер (N)
*06016423675
*0602673015151
*0603622322807
*0604592721592
*06057613358
*060948323149

Аллели

HLA DQB1 * 0601 частоты
частота
исх.численность населения(%)
[2]Индиг. Австралийский мыс Йорк31.3
Индиг. Австралийка Кимберли30.5
Науру28.4
Фиджи Вити-Леву26.3
Индия Бомбей26.3
Низменность Папуа-Новой Гвинеи26.0
Китай Гуйчжоу, пров. Мяо25.9
Папуа-Новая Гвинея Маданг23.1
Кирибати22.6
Япония22.0
Индонезия Нуса Тенгара19.2
Индия Северные индусы18.7
Япония Хоккайдо Ваджин17.0
Уттар-Прадеш индуистский15.1
PNG низменность Wosera14.1
Западное Самоа и Токелау13.7
Пакистанские калаши13.0
Индия Лакхнау12.9
Китай Ухань12.8
Южная Корея (4)11.4
PNG Хайленд10.9
Индия Дели9.0
Иран Белудж8.0
Монголия Халха5.5
Ливан Юхмур4.3
Тунис Ганнуш4.3
Польша Wielkopolska4.0
Мексика масатеканцы3.5
Испания Э. Андалусия2.0
Центральная Италия1.9
Юго-Восток Франции1.6
Англия европеоид1.1
Южная Ирландия0.2
Италия Сардиния0.1
Бразилия Гуарани Кайова0.0
Камерун Саа0.0

DQB1 * 0601

DQB1 * 0601 обычно связан с DQA1 * 0103 как 6.1 гаплотип. Этот гаплотип более распространен в Японии и других частях Восточной Азии.

HLA DQB1 * 0602 частоты
частота
исх.численность населения(%)
[2]Испания Пас Вэлли31.5
Камерун Саа30.8
Конго Киншаса Банту30.0
PNG Э. Хайлендс Горока29.8
Сибирь Кеть Нижний Енисей29.4
Испания Северный Кабуэрниго28.9
Россия Архангельск Поморы24.7
Испания Северная Кантабрия24.7
Южная Ирландия19.6
Бельгийский (2)19.4
Сибирь Кушун Бурятский18.0
Финляндия17.1
Сибирь Деревня Кец Суламай17.0
Польша Wielkopolska16.9
Немецкий Эссен16.7
Sp. Баскская долина Арратия16.7
Дания16.6
Франция Ceph15.7
Кения14.6
Англия европеоид14.4
Швеция14.1
Франция Ренн13.8
Тунис Матмата Бербер11.7
Иордания Амман10.7
Япония Хоккайдо Ваджин10.0
Саудовская Аравия Гураят и Хайль8.4
Япония Центральная8.2
Науру8.2
Грузия Сванети Сваны8.1
Юго-Восток Франции8.0
Эфиопия Амхара7.7
Алжир Оран7.6
Словения7.5
Южная Корея (1)7.4
Япония Фукуока6.4
Пакистанские калаши5.8
Китай Синьцзян-Уйгурский автономный округ5.4
Низменность Папуа-Новой Гвинеи5.2
Монголия Халх Улан-Батор4.9
Испания Мурсия4.8
Индия Бомбей4.2
Япония4.0
Греция (2)3.3
Израильские арабы2.3
Вьетнам Ханой Кинь2.0
Евреи Израиля1.5
Монголия Хотон Тариалан1.2
США Аляска коренные жители юпиков0.8
Мексика Mixtec Oaxaca0.5
Италия Сардиния pop20.1

DQB1 * 0602

DQB1 * 0602 обычно связан с DQA1 * 0102 для формирования 6.2 гаплотип. DQ6.2 распространен из Центральной Азии в Западную Европу, * 0602 также связан с DQA1 * 0103 в некоторых частях Азии.

HLA DQB1 * 0603 частоты
частота
исх.численность населения(%)
[2]Грузия Сванети Сваны14.4
Франция Запад11.0
Нидерланды10.6
Немецкий Эссен9.2
Чехия9.0
Испания Мурсия8.7
Словакия8.4
Дания8.3
Индия Лакхнау8.3
Иордания Амман8.3
Франция Ренн8.1
Польша Wielkopolska8.0
Саудовская Аравия Guraiat & Hail8.0
Тунис Джерба ​​Бербер7.8
Уганда Муганда Баганда7.4
Испания Северная Кантабрия7.2
Финляндия7.1
Франция Юг6.9
Китай Синьцзян-Уйгурский автономный округ6.5
Россия Северо-Запад славянский6.0
Ирландия Донегол5.3
Греция (3)5.2
Северная Ирландия (2)4.9
Италия Рим4.0
CAR или пигмеи3.6
Ливан Кафар Зубиан3.2
Швеция2.5
Таиланд2.1
Китай Ухань1.7
Япония (2)1.0
Южная Корея (3)0.9
Малайзия0.6

DQB1 * 0603

DQB1 * 0603 обычно связан с DQA1 * 0103 как 6.3 и распространен из Центральной Азии в Западную Европу, * 0603 также связан с DQA1 * 0102 в некоторых частях Азии. В Европе наиболее распространен в Нидерландах.

HLA DQB1 * 0604 частоты
частота
исх.численность населения(%)
[2]Эфиопия Амхара10.7
Руанда кигали хуту и ​​тутси10.7
Эфиопия Оромо10.2
Япония8.0
Саудовская Аравия Guraiat & Hail8.0
Иран Йезд зороастрийцы6.9
CAR или пигмеи6.5
Южная Корея (2)6.5
Швеция6.1
Нидерланды5.6
Уганда Муганда Баганда5.3
Ливан Ниха эль Шуфф4.9
Дания4.6
Франция Ренн4.6
Израиль Газа палестинцы3.9
Китай Синьцзян-Уйгурский автономный округ3.8
Алжир13.5
Россия Северо-Запад славянский3.5
Англия европеоид3.1
Немецкий Эссен2.6
Чехия2.4
Греция2.0
Индия Дели1.8
Науру1.5
Финляндия1.4
Гамбия0.7

DQB1 * 0604

DQB1 * 0604 встречается на более высоких частотах в некоторых частях Африки и Азии и связан почти исключительно с DQA1 * 0102 как 6.4. Этот гаплотип наиболее часто встречается в Евразии в Японии.

HLA DQB1 * 0609 частоты
частота
исх.численность населения(%)
[2]Руанда Кигали Хуту и ​​Тутси5.7
Кения5.3
Уганда Муганда Баганда5.3
Конго Киншаса Банту4.4
Гамбия4.4
Монголия Цаатан4.2
Южная Корея (3)3.7
Камерун Саа3.5
Словения3.0
Тунис3.0
Зимбабве Хараре Шона2.2
Вьетнам Ханой Кинь2.0
Нидерланды1.7
Саудовская Аравия Guraiat & Hail1.6
Алжир Оран1.5
Греция (2)1.2
Таиланд (2)1.2
Тунис Матмата Бербер1.2
Италия Рим1.0
Испания Гранада0.7
Италия Бергамо0.6
Южная Ирландия0.2
Китай Урумчи-Уйгурский0.0
США Аляска коренные жители юпиков0.0

DQB1 * 0609

DQB1 * 0609 встречается в Африке и ближайших регионах Евразии.

Гаплотипы и болезни

Восприимчивость к Лептоспироз Была обнаружена инфекция, связанная с недифференцированным DQ6.[3] В то время как DQ6 защищал от смерти (или необходимости трансплантации печени) в первичный склерозирующий холангит.[4]

DQ6.1

DQA1 * 0103: DQB1 * 0601 (DQ6.1) чаще встречается в Азии и почти отсутствует в Западной Европе. Он дает защиту от нарколепсия,[5] ювенильный диабет,[6][7] Синдром Фогта-Коянаги-Харады (ВКХ),[8] пузырчатка обыкновенная,[9] рассеянный склероз,[10] миастения.

DQ6.2

DQ6.2 (DQA1*0102 : DQB1*0602) обычно связан с DR15 и как таковой является частью HLA B7-DR15-DQ6 гаплотип. Этот гаплотип считается самым длинным мультигенным гаплотипом, известным в геноме человека, поскольку он охватывает более 4,7 миллионов нуклеотидов. Гаплотип DR15-DQ6.2 является наиболее распространенным гаплотипом DR-DQ в Европе, и примерно 30% американцев несут как минимум DQ6.2. Гаплотип еще более распространен в Средней Азии.

DQ6.2 ассоциации с болезнью

За миастения, узнавание α34-49 AChR увеличивалось с DQ6.2.[11] DQA1*0102 увеличивает риск рак шейки матки.[12][13] В рассеянный склероз DQA1*0102 был наиболее частым аллелем и DQB1*0602 значительно увеличился у пациентов с РС.[14][15][16]

Защитные эффекты DQ6.2

В первичный билиарный цирроз DQ6.2 имеет отрицательную связь с болезнью.[17] DQ6.2 также оказывает защитное действие на ювенильный диабет.[18][19] DQ6.2 также защищает от детских спазмов у метисов.[20]

DQ6.3

DQ6.3 (DQA1*0103 : DQB1*0603) встречается в северной части центральной Европы с умеренной частотой, он защищает от многих аутоиммунных заболеваний. Он также обеспечивает некоторую защиту от ВИЧ-инфекции.[21]

DQ6.4

DQ6.4 (DQA1*0102 : DQB1*0604) может быть связано с миастенией, вызванной тимомой.[22]

Рекомендации

  1. ^ Аллельная форма запроса IMGT / HLA - Европейский институт биоинформатики
  2. ^ а б c d е Миддлтон Д., Менчака Л., Руд Н., Комеровски Р. (2003). «Новая база данных частот аллелей». Тканевые антигены. 61 (5): 403–407. Дои:10.1034 / j.1399-0039.2003.00062.x. PMID 12753660.
  3. ^ Лингаппа Дж., Каффнер Т., Тапперо Дж. И др. (Май 2004 г.). «HLA-DQ6 и проглатывание загрязненной воды: возможное взаимодействие генов и окружающей среды при вспышке лептоспироза». Гены иммунной. 5 (3): 197–202. Дои:10.1038 / sj.gene.6364058. PMID 15014429.
  4. ^ Боберг К.М., Спуркленд А., Рокка Г. и др. (Август 2001 г.). «Гетерозиготный генотип HLA-DR3, DQ2 связан с ускоренным прогрессированием первичного склерозирующего холангита». Сканд. J. Гастроэнтерол. 36 (8): 886–890. Дои:10.1080/003655201750313441. PMID 11495087.
  5. ^ Hong SC, Lin L, Lo B и др. (2007). «DQB1 * 0301 и DQB1 * 0601 модулируют восприимчивость к нарколепсии у корейцев». Гм. Иммунол. 68 (1): 59–68. Дои:10.1016 / j.humimm.2006.10.006. PMID 17207713.
  6. ^ Sang Y, Yan C, Zhu C, Ni G (2001). «Связь между аллелями HLA-DRB1 и DQ и генетическая предрасположенность к диабету 1 типа». Подбородок. Med. J. 114 (4): 407–9. PMID 11780465.
  7. ^ Сарухан-Дирескенели Г., Уяр Ф.А., Бас Ф. и др. (2000). «Ассоциации HLA-DR и -DQ с инсулинозависимым сахарным диабетом у населения Турции». Гм. Иммунол. 61 (3): 296–302. Дои:10.1016 / S0198-8859 (99) 00182-2. PMID 10689119.
  8. ^ Ким М.Х., Сеонг М.К., Квак Н.Х. и др. (2000). «Ассоциация HLA с синдромом Фогта-Коянаги-Харада у корейцев». Являюсь. J. Ophthalmol. 129 (2): 173–177. Дои:10.1016 / S0002-9394 (99) 00434-1. PMID 10682969.
  9. ^ Нийзэки Х., Иноко Х., Мизуки Н. и др. (1994). «Генотипирование HLA-DQA1, -DQB1 и -DRB1 у пациентов с японской пузырчаткой обыкновенной методом ПЦР-ПДРФ». Тканевые антигены. 44 (4): 248–251. Дои:10.1111 / j.1399-0039.1994.tb02390.x. PMID 7871526.
  10. ^ Амирзаргар А., Митилинеос Дж., Юсефипур А. и др. (1998). «Связанная с HLA класса II (DRB1, DQA1 и DQB1) генетическая предрасположенность у пациентов с иранским рассеянным склерозом (РС)». Евро. J. Immunogenet. 25 (4): 297–301. Дои:10.1046 / j.1365-2370.1998.00101.x. PMID 9777330.
  11. ^ Deitiker PR, Oshima M, Smith RG, Mosier DR, Atassi MZ (2006). «Незначительные различия в HLA-DQ гаплотип-ассоциированной презентации пептидов альфа-цепи AChR могут быть достаточными для опосредования миастении». Аутоиммунитет. 39 (4): 277–288. Дои:10.1080/08916930600738581. PMID 16891216.
  12. ^ Гадери М., Никитина Л., Павлин С.С. и др. (Октябрь 2000 г.). «Фактор некроза опухоли а-11 и гаплотип DR15-DQ6 (B * 0602) увеличивают риск цервикальной интраэпителиальной неоплазии у женщин с серопозитивным вирусом папилломы 16 в Северной Швеции». Cancer Epidemiol. Биомаркеры Назад. 9 (10): 1067–70. PMID 11045789.
  13. ^ Шифф М.А., Эппл Р.Дж., Лин П., Нельсон Дж.Л., Уиллер С.М., Беккер TM (2005). «Аллели HLA и риск цервикальной интраэпителиальной неоплазии среди женщин юго-западных американских индейцев». Гм. Иммунол. 66 (10): 1050–1056. Дои:10.1016 / j.humimm.2005.09.002. PMID 16386646.
  14. ^ Колстад А., Ханнестад К., Вандвик Б., Вартдал Ф. (май 1989 г.). «Пациенты с рассеянным склерозом имеют высокую частоту эпитопа HLA-DQ бета, определяемого гибридомным антителом человека и человека». Тканевые антигены. 33 (5): 546–549. Дои:10.1111 / j.1399-0039.1989.tb01706.x. PMID 2477915.
  15. ^ Амирзаргар А.А., Табаси А., Хосрави Ф. и др. (2005). «Неврит зрительного нерва, рассеянный склероз и лейкоцитарный антиген человека: результаты последующего 4-летнего исследования». Евро. J. Neurol. 12 (1): 25–30. Дои:10.1111 / j.1468-1331.2004.00901.x. PMID 15613143.
  16. ^ Фернандес О, Фернандес В., Алонсо А. и др. (2004). «Аллель DQB1 * 0602 демонстрирует сильную связь с рассеянным склерозом у пациентов в Малаге, Испания». J. Neurol. 251 (4): 440–444. Дои:10.1007 / s00415-004-0350-2. PMID 15083289.
  17. ^ Малларки М.Э., Стивенс А.М., МакДоннелл В.М. и др. (2005). «Аллели человеческого лейкоцитарного антигена класса II у кавказских женщин с первичным билиарным циррозом». Тканевые антигены. 65 (2): 199–205. Дои:10.1111 / j.1399-0039.2005.00351.x. PMID 15713222.
  18. ^ Райнер М.Л., Келли М.А., Мийович С.Х., Барнетт А.Х. (март 2002 г.). «Секвенирование второго экзона аллелей MHC класса II DQ6 у пациентов с диабетом 1 типа». Аутоиммунитет. 35 (2): 155–157. Дои:10.1080/08916930290016637. PMID 12071438.
  19. ^ Посио Ф., Макдермотт М.Ф. (август 2002 г.). «Генетика сахарного диабета 1 типа». Гены иммунной. 3 (5): 235–249. Дои:10.1038 / sj.gene.6363875. PMID 12140742.
  20. ^ Суастеги Р.А., Де Ла Роса Дж., Карранса Дж. М., Гонсалес-Астиазаран А., Городецкий С. (февраль 2001 г.). «Вклад антигенов MHC класса II в этиологию инфантильного спазма у мексиканских метисов». Эпилепсия. 42 (2): 210–215. Дои:10.1046 / j.1528-1157.2001.22700.x. PMID 11240591.
  21. ^ Achord AP, Lewis RE, Brackin MN, Henderson H, Cruse JM (1996). «Связь заболевания ВИЧ-1 с антигенами HLA-DQ у афроамериканцев и кавказцев». Патобиология. 64 (4): 204–208. Дои:10.1159/000164049. PMID 9031330.
  22. ^ Виейра М., Кайлат-Цукман С., Гайдос П., Коэн-Камински С., Кастер А., Бах Дж. (1993). «Идентификация геномным типированием генов не-DR3 HLA класса II, связанных с миастенией гравис». J Нейроиммунол. 47 (2): 115–122. Дои:10.1016 / 0165-5728 (93) 90021-П. PMID 8370765.