WikiDer > Гаплогруппа R (Y-ДНК)

Haplogroup R (Y-DNA)
Гаплогруппа R
Возможное время происхожденияоколо 27000 лет BP[1][2]
Возможное место происхожденияВозможно Центральная Азия[3], Сибирь,[4] или Южная Азия[5]
ПредокP1 (P-M45), единственная первичная клада П* (P-P295)
ПотомкиR1 (R-M173), R2 (R-M479) (R2)
Определение мутацийM207 / страница37 / UTY2, CTS207 / M600 / PF5992, CTS2426 / M661 / PF6033, CTS2913 / M667, CTS3229 / M672 / PF6036 / YSC0001265, CTS3622 / PF6037, CTS5815 / M696, CTS647817 / M8725TS / Y480 PF6053, CTS8311 / M732, CTS9005 / M741, CTS10663 / M788, CTS11075 / M795 / P6078, CTS11647 / Y369, F33 / M603 / PF6013, F63 / M614 / PF6016, F82 / M620, F154 / M668 / M636, F154 / M636 / M703 / PF5919, F370 / M708 / Y479, F459 / Y482, F652 / M805, F765, FGC1168, L248.3 / M705.3, L747 / M702 / PF5918 / YSC0000287, L760 / M642 / PF5877 / YSC0000286, L89 YSC0000232, L1347 / M792 / PF6077 / YSC0000233, M613, M628 / PF5868, M651 / Y296, M718, M734 / PF6057 / S4 / YSC0000201, M760 / Y506, M764 / PF5953, M799, P224922 / PF60, PF60, P224 / PF60 P232, P280, P285, PF5938, PF6014 / S9 (ISOGG 2016)

Гаплогруппа R, или же R-M207, это Гаплогруппа ДНК Y-хромосомы. Он многочислен и широко распространен среди современного населения.

Некоторый потомок субклады были найдены с доисторических времен в Европа, Центральная Азия и Южная Азия. Другие уже давно присутствуют на более низких уровнях в некоторых частях Западная Азия и Африка. Некоторые власти предложили также, более спорно, что R-M207 уже давно присутствует среди Коренные американцы в Северная Америка - теория, которая еще не получила широкого распространения.

Карафет и др. (2014) и другие исследователи утверждают, что «быстрая диверсификация ... K-M526", также известный как K2, в K2a и K2b, с последующим K2b1 и п (также известный как K2b2) ", вероятно, произошло в Юго-Восточная Азия". За этим последовало относительно быстрое" расширение на запад " P1 - непосредственный предок обеих гаплогрупп Q и Р.[6][7]

Структура

Филогенетическое дерево Y-ДНК человека
Гаплогруппа R
M207 (R)
M173 (R1)
M420 (R1a)
M459

(R1a1)

(R1a *)

M343 (R1b)
L278

(R1b1)

(R1b *)

M479 (R2)
M124 (R2a)
L263

(R2a1)

F1092

(R2a2)

Y12100

(R2a3)

(R2 *)

Происхождение

Гаплогруппа P1 (P-M45), непосредственный предок гаплогруппы R, вероятно, возник в Юго-Восточная Азия.[6] В SNP Считается, что M207, который определяет гаплогруппу R, возник во время Верхний палеолит эра, около 27000 лет назад.[2][1]

Был обнаружен только один подтвержденный пример базального R * в останках возрастом 24000 лет, известный как MA1, найдено в Мальта-буретская культура возле озеро Байкал в Сибирь.[2] (Хотя о живом примере R-M207 (xM17, M124) сообщалось в 2012 году, он не тестировался на SNP M478; соответствующий мужчина - среди выборки из 158 этнических групп. Таджикский мужчины из Бадахшан, Афганистан - поэтому может принадлежать R2.)

Возможно, что ни одна из первичных ветвей R-M207, а именно R1 (R-M173) и R2 (R-M479), все еще не существует в своих основных исходных формах, то есть R1 * и R2 *. В научной литературе не было зарегистрировано ни одного подтвержденного случая, живого или мертвого. (Хотя в случае R2 * проведено относительно мало исследований.)

Несмотря на редкость R * и R1 *, часто отмечается относительно быстрое расширение - географически и численно - субкладов от R1: «и R1a, и R1b представляют собой молодые звездообразные расширения» (Карафет 2008).

В частности, отмечено широкое географическое распространение R1b. Hallast et al. (2014) упомянули, что живые примеры, найденные в Центральной Азии, включают:

  • «самый глубокий субклад» R-M269 (R1b1a1a2) - самая многочисленная ветвь R1b в Западной Европе, и;
  • редкий субклад R-PH155 (R1b1b) обнаружен только в одном Бутанский индивидуальный и один таджик.

(Хотя Халласт и др. Предположили, что R-PH155 был «почти таким же старым, как раскол R1a / R1b»,[6] Позже было обнаружено, что R-PH155 является субкладом R-L278 (R1b1) и получил филогенетическое название R1b1b.)

Распределение

Y-гаплогруппа R-M207 распространена повсюду. Европа, Южная Азия и Центральная Азия (Кайзер 2003). Это также происходит в Кавказ и Сибирь. Некоторые меньшинства в Африка также несут субклады R-M207 на высоких частотах.

Хотя некоторые коренные народы Северная и Южная Америка и Австралазия также содержат высокие уровни R-M207, неясно, имеют ли они глубокие корни или это результат европейской колонизации во время ранняя современная эпоха.

R (R-M207)

Гаплогруппа R * Y-ДНК (xR1, R2) была обнаружена в останках возрастом 24000 лет. Мальта в Сибирь возле озера Байкал.[4]В 2013 г. R-M207 был обнаружен у одного из 132 мужчин из Кыргызский народ Восточного Кыргызстана.[8]

R1 (R-M173)

R-M173, также известный как R1, был широко распространен Европа и Южная Азия с доисторических времен. Имеет много ответвлений (Семино 2000 и Россер 2000).

Это вторая по распространенности гаплогруппа в Коренные народы Америки следующий гаплогруппа Q-M242, особенно в Алгонкинские народы из Канада и Соединенные Штаты (Малхи 2008). Причины высоких уровней R-M173 среди коренных американцев являются предметом споров:

  • некоторые ученые утверждают, что это частично или полностью результат иммиграция колониальной эпохи из Европы (см., например, Малхи 2008), в то время как;
  • другие авторитетные источники указывают на большее сходство многих субкладов R-M173, обнаруженных в Северной Америке, с субкладами, обнаруженными в Сибири (например, Лелл 2002 и Рагхаван 2013), что предполагает доисторическую иммиграцию из Азии и / или Берингия.

R2 (R-M479)

Гаплогруппа R-M479 определяется наличием маркера M479. Парагруппа линии передачи R-M479 встречается преимущественно в Южной Азии, хотя глубоко укоренившиеся примеры также были обнаружены среди португальского, испанского, татарского (Башкортостан, Россия) и осетинского (Кавказ) населения (Майрес 2010).

Один редкий субклад может встречаться только среди Евреи ашкенази, возможно, в результате эффект основателя.

Смотрите также


Генетика

Субклады Y-ДНК R-M207

Основное дерево Y-ДНК

Филогенетическое древо человека Гаплогруппы ДНК Y-хромосомы [χ 1][χ 2]
"Y-хромосомный Адам"
A00A0-T [χ 3]
A0A1 [χ 4]
A1aA1b
A1b1BT
BCT
DECF
DECF
F1 F2 F3 GHIJK
граммHIJK
IJKЧАС
IJK
я  J    LT [χ 5]      K2 [χ 6]
L    Т   K2a [χ 7]       K2b [χ 8]    K2c    K2dK2e [χ 9]  
K-M2313 [χ 10]    K2b1 [χ 11]п [χ 12]
НЕТ  S [χ 13] M [χ 14]   P1    P2
NОQр

Рекомендации

  1. ^ а б ISOGG, Y-ДНК Гаплогруппа R и ее субклады - 2016 (12 декабря 2016 г.).
  2. ^ а б c Raghavan, M. et al. 2014. Верхний палеолит Сибирский геном показывает двойное происхождение коренных американцев, Природа, 505, 87–91.
  3. ^ Карафет и др. 2014.
  4. ^ а б Рагхаван М., Скоглунд П., Граф К.Е., Мецпалу М., Альбрехтсен А., Мольтке И. и др. (Январь 2014). «Верхний палеолитический геном Сибири показывает двойное происхождение коренных американцев». Природа. 505 (7481): 87–91. Bibcode:2014Натура.505 ... 87р. Дои:10.1038 / природа12736. ЧВК 4105016. PMID 24256729.
  5. ^ Hallast2014.
  6. ^ а б c Karafet TM, Mendez FL, Sudoyo H, Lansing JS, Hammer MF (март 2015 г.). «Улучшенное филогенетическое разрешение и быстрая диверсификация гаплогруппы Y-хромосомы K-M526 в Юго-Восточной Азии». Европейский журнал генетики человека. 23 (3): 369–73. Дои:10.1038 / ejhg.2014.106. ЧВК 4326703. PMID 24896152.
  7. ^ Смотрите также: Tumonggor MK, Karafet TM, Downey S, Lansing JS, Norquest P, Sudoyo H, Hammer MF, Cox MP (сентябрь 2014 г.). «Изоляция, контакты и социальное поведение сформировали генетическое разнообразие в Западном Тиморе». Журнал генетики человека. 59 (9): 494–503. Дои:10.1038 / jhg.2014.62. ЧВК 4521296. PMID 25078354., и Хейер Э, Жорж М, Пахнер М, Эндикотт П (2013). «Генетическое разнообразие четырех филиппинских популяций негрито из Лусона: сравнение эффективных размеров мужского и женского населения и дифференцированная интеграция иммигрантов в общины аета и агта». Человеческая биология. 85 (1–3): 189–208. Дои:10.3378/027.085.0310. PMID 24297226. S2CID 19479827.
  8. ^ Ди Кристофаро Дж., Пеннарун Э., Мазьер С., Майрес Н.М., Лин А.А., Темори С.А. и др. (18 октября 2013 г.). «Афганский Гиндукуш: там, где сходятся генные потоки Евразийского субконтинента». PLOS ONE. 8 (10): e76748. Bibcode:2013PLoSO ... 876748D. Дои:10.1371 / journal.pone.0076748. ЧВК 3799995. PMID 24204668.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

Обсуждение и проекты