WikiDer > Иерархическая близость

Hierarchical closeness

Иерархическая близость (HC) является структурным мера центральности используется в теория сети или теория графов. Он расширен от центральности близости до ранжирования того, насколько центрально расположен узел в направленной сети. В то время как исходная центральность близости направленной сети рассматривает наиболее важным узлом как узел с наименьшим общим расстоянием от всех других узлов, иерархическая близость оценивает наиболее важный узел как тот, который достигает наибольшего числа узлов кратчайшими путями. Иерархическая близость явно включает информацию о диапазоне других узлов, на которые может повлиять данный узел. В направленной сети где это набор узлов и набор взаимодействий, иерархическая близость узла называется был предложен Траном и Квоном[1] следующим образом:

где:

  • это достижимость узла определяется путь от к , и
  • это нормализованная форма исходной близости (Sabidussi, 1966).[2] Он может использовать вариант определения близости[3] следующим образом: где расстояние кратчайшего пути, если таковой имеется, от к ; в противном случае, указывается как бесконечное значение.

В формуле представляет количество узлов в что может быть достигнуто из . Он также может представлять иерархическое положение узла в направленной сети. Он отмечает, что если , тогда потому что является . В случаях, когда , достижимость является доминирующим фактором, потому что но . Другими словами, первый член указывает уровень глобальной иерархии, а второй член представляет уровень локальной центральности.

заявка

Иерархическая близость может использоваться в биологических сетях для ранжирования риска генов, несущих болезни.[1]

использованная литература

  1. ^ Тран, Т.-Д. и Квон, Ю.-К. Иерархическая близость эффективно предсказывает гены болезней в направленной сигнальной сети, вычислительной биологии и химии.
  2. ^ Сабидусси, Г. (1966) Индекс центральности графа, Psychometrika, 31, 581-603% G Английский
  3. ^ Опсал, Т., Агниссенс, Ф. и Скворец, Дж. (2010) Центральность узла в взвешенных сетях: степень обобщения и кратчайшие пути, Социальные сети, 32, 245-251.