WikiDer > Джон Кларди

Jon Clardy

Джон Кларди (родился 16 мая 1943 г., Вашингтон, округ Колумбия., США) в настоящее время является Сянь Ву и Дейзи Йен Ву профессор биологической химии и молекулярной фармакологии Гарвардской медицинской школы.[1] Его исследования сосредоточены на выделении и структурной характеристике натуральных продуктов, а в настоящее время изучает роль биологически активных малых молекул в опосредовании симбиотических взаимодействий и болезней.[2]

биография

Кларди вырос в Арлингтон, Вирджиния, США, старший из четырех детей. Он присутствовал Йельский университет где он получил B.S. в 1964 году и был избран Пхи Бета Каппа. Хотя его всегда увлекала биология, во время учебы в колледже он стал больше интересоваться химией. Он выполнил исследования в области органического синтеза под руководством Р. Стивен Берри, с упором на бензин.[3] После окончания Йельского университета он переехал в Гарвардский университет, где получил степень доктора философии. в химии в 1969 году. Затем он принял должность преподавателя на химическом факультете в Государственный университет Айовы, где он был связан с лабораторией Эймса. В 1978 г. перешел на химический факультет в г. Корнелл Университет где он оставался до 2002 года, когда перешел на факультет биологической химии и молекулярной фармакологии Гарвардской медицинской школы. В 2004 году он защитил докторскую диссертацию. Программа по химической биологии с Стюарт Шрайбер и Грег Вердин.[4] Он также создал и продолжает преподавать популярный курс под названием «Молекулы жизни» для студентов Гарварда, не специализирующихся в области естественных наук.

Во время работы над докторской диссертацией Кларди познакомился со своей женой Андреа Флек, которая Swarthmore College выпускник, писатель. Среди ее работ детская книга, две книги о северной части штата Нью-Йорк и пьесы, которые ставились по всей стране. У них двое сыновей.

Открытие натурального продукта

Ранние исследования Кларди были сосредоточены на выяснении структуры натуральных продуктов, главным образом с помощью Рентгеновская кристаллография. Вначале в Университете штата Айова Кларди наладил важное сотрудничество с Биллом Феникалом, Джоном Фолкнером и Полом Шойером,[5] что привело к выяснению структуры многих морских природных продуктов, таких как противораковое средство бриостатин,[6] инсектицидные и противогрибковые джаспамид, диазонамид А и B,[7] и много других. Некоторые из его наиболее заметных ранних работ были посвящены нейротоксинам, связанным с "красным приливом", что привело к определению трехмерных структур сакситоксин,[8] из гониаутоксин группа, и циклический полиэфир бреветоксин B.[9]После переезда в Корнельский университет исследования Кларди расширились и стали включать огромное количество неморских организмов, включая, помимо прочего, грибы, Актинобактерии и C. elegans. Его давний интерес к эндофитным грибам привел к открытию селективно цитотоксического хинона. торреановая кислота, структурно разнообразные гуанакастепены, антимикотическое средство криптоцин, и много других.

Недавно Кларди сосредоточился на симбиотических ассоциациях между бактериями и другими организмами как на богатых источниках новых малых молекул.[10] В сотрудничестве с Кэмероном Карри Кларди исследовал связи между актиномицетами и насекомыми, такими как южный сосновый жук, муравьи и термиты, что привело к открытию противогрибковых агентов, включая дентигерумицин[11][12] и микангимицин.[13][14] Изучение химического обмена в сложных экологических взаимодействиях остается в центре внимания лаборатории Clardy.[15]

Рентгеновская кристаллография взаимодействия малых молекул с белками

Кларди в сотрудничестве со Стюартом Шрайбером и его коллегами получил кристаллическую структуру как для FK506 /FKBP12 и рапамицин/ Комплексы ФКБП12.[16] Вскоре после этого Шрайбер и Кларди продолжили определение структуры комплекса FK506 / рапамицин / FRAP - новаторское исследование, которое выявило способность проницаемой для клеток небольшой молекулы способствовать димеризации белков.[17] Vertex, начинающая фармацевтическая компания, была основана для разработки нетоксичной версии FK506.[18]В сотрудничестве с Уолтером Лилом Кларди и его коллеги получили рентгеновскую кристаллическую структуру летучих насекомых феромонов бомбикола с его связывающим партнером, расположенным на антеннах самок тутового шелкопряда.[19] Помимо дальнейшего углубления понимания этого высокоспецифичного взаимодействия малых молекул с белками, это исследование обозначило первую трехмерную структуру белка, связывающего одорант.[20]

Эдна

Кларди также известен своей работой по изучению натуральных продуктов, созданных некультивируемыми бактериями, и ему приписывают наряду с Джо Хандельсман и Роберт М. Гудман, за новаторство в области метагеномика. Вместе с Шоном Брэди он разработал метод вставки ДНК непосредственно из окружающей ДНК (eDNA), такой как почва, в космидные библиотеки, поиск биосинтетических кластеры генов и идентифицировать продукты этих генов.[21] Используя этот метод, они выяснили структуры множества антибиотиков, ранее недостижимых традиционными лабораторными методами, таких как натуральные продукты, полученные из длинноцепочечных N-ацилтирозинов.[22]

Рекомендации

  1. ^ «BCMP | Кафедра биологической химии и молекулярной фармакологии». Bcmp.med.harvard.edu. Получено 2013-09-28.
  2. ^ "Джон Кларди | Лаборатория Кларди". Clardy.med.harvard.edu. Получено 2013-09-28.
  3. ^ Берри, Р. С., Кларди, Дж. И Шафер, М. Э. Бензин. Варенье. Chem. Soc. 86, 2738–2739 (1964).
  4. ^ "Химические биологи | Гарвардский журнал, март-апрель 2005 г.". Harvardmagazine.com. Получено 2013-09-28.
  5. ^ Информационный бюллетень Американского общества фармакогнозии. 1-3 (2004)
  6. ^ Петтит, Г. Р. и др. Выделение и структура бриостатина 1. J. Am. Chem. Soc. 104, 6846–6848 (1982).
  7. ^ Линдквист Н., Феникал В., Ван Дайн Г. Д. и Кларди Дж. Выделение и определение структуры диазонамидов А и В, необычных цитотоксических метаболитов морской асцидии Diazona chinensis. Варенье. Chem. Soc. 113, 2303–2304 (1991).
  8. ^ Schantz, E.J. et al. Состав сакситоксина. Варенье. Chem. Soc. 97, 1238–1239 (1975)
  9. ^ Линь, Ю.-Ю. и другие. Выделение и структура бреветоксина B из динофлагелляты «красного прилива» Ptychodiscus brevis (Gymnodinium breve). Варенье. Chem. Soc. 103, 6773–6775 (1981)
  10. ^ «Жуков и бактерий | Журнал Ученый». Архивировано из оригинал на 2013-10-02. Получено 2014-08-25.
  11. ^ О, Д.-К., Поулсен, М., Карри, С.Р. и Кларди, Дж. Дентигерумицин: бактериальный медиатор симбиоза муравьиного грибка. Nat Chem Biol 5, 391–393 (2009)
  12. ^ Уилсон, Э. и Ярнелл, А. В Cahoots: грибы, муравьи и бактерии. Новости химии и машиностроения 87, 15 (2009)
  13. ^ Скотт, Дж. Дж. И др. Бактериальная защита мутуализма жуков-грибов. Наука 322, 63 (2008)
  14. ^ Drahl, C. Beetle Бактерии обладают противогрибковым агентом. Новости химии и машиностроения 86, 47 (2008)
  15. ^ "Джон Кларди". Academy.asm.org. Архивировано из оригинал на 2013-04-25. Получено 2013-09-28.
  16. ^ Van Duyne, G.D., Standaert, R.F., Karplus, P.A., Schreiber. С.Л., Кларди Дж. Атомная структура FKBP-FK506, комплекса иммунофилин-иммунодепрессант. Science 252, 839-842 (1991).
  17. ^ Чой, Дж., Чен, Дж., Шрайбер С. Л., Кларди Дж. Структура комплекса FKBP12-рапамицин, взаимодействующего со связывающим доменом FRAP человека. Science 273, 239-242 (1996).
  18. ^ Молекула на миллиард долларов: В поисках идеального лекарства, Барри Верт, 1994
  19. ^ Сандлер, Б. Х., Никонова, Л., Леал, В. С. и Кларди, Дж. Сексуальное влечение у тутового шелкопряда: структура комплекса феромон-связывающий-белок-бомбыкол. Химия и биология 7, 143–151 (2000)
  20. ^ Сандлер, Б. Х., Никонова, Л., Леал, В. С. и Кларди, Дж. Сексуальное влечение у шелкопряда: структура комплекса феромон-связывающий белок-бомбикол. Химия и биология 7, 143–151 (2000)
  21. ^ Брэди, С. Ф., Чао, К. Дж. И Кларди, Дж. Новые семейства природных продуктов из кластера генов ДНК окружающей среды (еДНК). Варенье. Chem. Soc. 124, 9968–9969 (2002).
  22. ^ Брэди, С. Ф., Чао, К. Дж. И Кларди, Дж. Синтез длинноцепочечного N-ацилтирозина из окружающей ДНК. Appl. Environ. Microbiol. 70, 6865–6870 (2004).