WikiDer > Марк Уилкинс (генетик)

Marc Wilkins (geneticist)

Марк Р. Уилкинс
НациональностьАвстралия
Альма-матерУниверситет Маккуори
Известенпротеом
Научная карьера
УчрежденияУниверситет Нового Южного Уэльса
ДокторантКейт Уильямс
ВлиянияДенис Хохштрассер,Амос Байрох

Марк Р. Уилкинс австралийский ученый, которому приписывают определение концепции протеом.[1] Уилкинс - профессор Школы биотехнологии и биомолекулярных наук в Университет Нового Южного Уэльса, Сидней.

Уилкинс придумал термин протеом в 1994 году, когда он разрабатывал эту концепцию, будучи аспирантом в Университет Маккуори, Сидней, Австралия, описывая его как «комплемент PROTein, экспрессируемый геномом». [2] Этот термин является обобщением концепции геном чтобы охватить набор всех белков, которые могут быть произведены через геном через альтернативное сращивание и посттранскрипционная модификация из информационная РНК.[3]

Карьера

В 1995–1997 гг. Уилкинс стажировался в докторантуре. Женевский университет, Швейцария, работая с профессором Денисом Хохштрассером и Д-р Амос Байрох. Он стал соавтором многих инструментов анализа белков, доступных на ExPASy веб сервер. Впоследствии он работал старшим научным сотрудником в Австралийском центре анализа протеомов, который был основан правительством Австралии в 1995 году как первый в мире специализированный центр исследований протеома.[4]

В 1997 году он был соредактором первой книги по протеомика, «Proteome Research: New Frontiers in Functional Genomics» (Wilkins et al. (Eds), Springer Verlag), продано более 4000 экземпляров.[5]

Он был соучредителем протеомной компании Proteome Systems Ltd., которая была основана в январе 1999 года и зарегистрирована на Австралийской фондовой бирже в 2004 году. Доктор Уилкинс работал в Proteome Systems на постоянной основе в течение 6 лет в качестве руководителя ее биоинформатических исследований и Затем команда разработчиков возглавила протеомику. Был награжден IBM«Новичок года» для компаний Азиатско-Тихоокеанского региона в 2003 году. Proteome Systems была переименована в Tyrian Diagnostics.[6] и в конечном итоге лишился своего IP. В 2007 году Уилкинс стал соучредителем компании регенеративной медицины Regeneus.[7] Эта компания разработала методы лечения остеоартрита с использованием взрослых стволовых клеток, которые сейчас проходят клинические испытания.

Уилкинс в настоящее время является профессором системной биологии в Университет Нового Южного Уэльса,[8] и является директором Инициативы системной биологии[9] и Центр геномики Рамачотти.[10] Он опубликовал более 200 научных работ и глав книг.[11] Его текущие исследования касаются роли метилирования белков в эукариотической клетке, использования кросс-сшивающей масс-спектрометрии (XL-MS) для анализа протеомных сетей взаимодействия белков ( интерактом) и биоинформатический анализ данных секвенирования следующего поколения. В рамках консорциума генома коалы его команда выполнила все долгосрочное секвенирование PacBio, а затем сборку на основе Falcon, чтобы сгенерировать наиболее полный и непрерывный геном сумчатых на сегодняшний день. [12]

В 2012 году Уилкинс был награжден премией Beckman Coulter Discovery Science от Австралийского общества биохимии и молекулярной биологии.[13] Эта премия присуждается участнику за выдающийся вклад в области биохимии и молекулярной биологии. Университет Нового Южного Уэльса присудил Уилкинсу докторскую степень в 2018 году.

использованная литература

  1. ^ Wilkins, Marc R .; Санчес, Жан-Шарль; Гули, Эндрю А .; Аппель, Рон Д .; Хамфери-Смит, Ян; Hochstrasser, Denis F .; Уильямс, Кейт Л. (1996). «Прогресс в протеомных проектах: почему все белки, экспрессируемые геномом, должны быть идентифицированы и как это сделать». Обзоры биотехнологии и генной инженерии. 13 (1): 19–50. Дои:10.1080/02648725.1996.10647923.
  2. ^ Wilkins, Marc R .; Паскуали, Кристиан; Аппель, Рон Д .; Оу, Кели; Голаз, Оливье; Санчес, Жан-Шарль; Ян, июнь X .; Гули, Эндрю. А .; Хьюз, Грэм; Хамфери-Смит, Ян; Уильямс, Кейт Л .; Хохштрассер, Денис Ф. (1 января 1996 г.). «От белков к протеомам: крупномасштабная идентификация белков с помощью двумерного электрофореза и анализа арниновой кислоты». Природа Биотехнологии. 14 (1): 61–65. Дои:10.1038 / nbt0196-61. PMID 9636313.
  3. ^ Wasinger et al. Прогресс в картировании генного продукта Mollicutes: Mycoplasma genitalium
  4. ^ APAF - Австралийский исследовательский центр протеома
  5. ^ Wilkins et al (Eds.) Proteome Research: New Frontiers in Functional Genomics
  6. ^ "Tyrian Diagnostics Pty Ltd"
  7. ^ Regeneus Pty Ltd
  8. ^ Марк Уилкинс - профиль исследователя UNSW
  9. ^ Инициатива системной биологии
  10. ^ Центр геномики Рамачотти
  11. ^ Марк Уилкинс - список публикаций UNSW
  12. ^ Джонсон, Р. Н.; О'Милли, D; Чен, Z; Etherington, GJ; Хо, SYW; Нэш, WJ; Грюбер, CE; Cheng, Y; Уиттингтон, CM; Деннисон, S; Пил, E; Хэрти, Вт; О'Нил, Р.Дж.; Colgan, D; Russell, TL; Алькесар-Планас, Германия; Аттенброу, В; Брэгг, JG; Бренди, PA; Чонг, AY; Deakin, JE; Ди Пальма, Франция; Дуда, З; Элдридж, MDB; Юарт, КМ; Хогг, CJ; Frankham, GJ; Жорж, А; Gillett, AK; Говендир, М; Гринвуд, AD; Hayakawa, T; Helgen, KM; Хоббс, М; Холлели, CE; Хайдер, Теннесси; Джонс, EA; Король, А; Мэдден, Д; Graves, JAM; Моррис, К.М.; Neaves, LE; Патель, HR; Полкингхорн, А; Renfree, МБ; Робин, C; Salinas, R; Цангарас, К; Waters, PD; Waters, SA; Райт, B; Wilkins, MR; Timms, P; Белов, К (2018). «Идеи адаптации и сохранения генома коалы». Нат Жене. 50 (8): 1102–1111. Дои:10.1038 / s41588-018-0153-5. ЧВК 6197426. PMID 29967444.
  13. ^ Награды ASBMB

внешние ссылки