WikiDer > Михаил Грибсков

Michael Gribskov
Михаил Грибсков (слева) на ISMB конференция 2012 г.

Михаил Грибсков является профессором биологических и компьютерных наук в Университет ПердьюВ 1979 году Грибсков окончил Государственный университет ОрегонаИмеет степень бакалавра наук с отличием в области биохимии и биофизики. Позже, в 1985 году, он защитил докторскую диссертацию по молекулярной биологии. Университет Висконсина-Мэдисона.[1]

Он занимал пост президента Международное общество вычислительной биологии,[2] и его страница факультета утверждает, что он является председателем Информационный ресурс о белках Научный надзор и консультативный совет, а также в редакционных советах журналов Биоинформатика, Журнал вычислительной биологии и химии, и Журнал молекулярной микробиологии и биотехнологии.[1]

ГодПозиция
1979Б.С. с отличием в области биохимии и биофизики Государственный университет Орегона
1979–1984Грант NIH на преддипломную подготовку университет Висконсин-Мэдисон
1985Кандидат наук. в Университете молекулярной биологии Висконсин-Мэдисон
1985–1987Постдокторантура Американского онкологического общества Калифорнийский университет - Лос-Анджелес
1988–1992Научный сотрудник Национального института рака - FCRDC
1992Штатный научный сотрудник Суперкомпьютерного центра Сан-Диего
1993–1996Старший научный сотрудник Суперкомпьютерного центра Сан-Диего
1993–1999Адъюнкт-профессор биологии Калифорнийского университета, Сан-Диего
1994–1997Структурные запросы главного исследователя к базам данных нуклеиновых кислот
1999–2003Адъюнкт-профессор биологии Калифорнийского университета, Сан-Диего
2004 – настоящее времяПрофессор биологии и информатики Университета Пердью

Анализ профиля

Грибскова вместе с Дэвид Айзенберг и Эндрю Маклахлан представили анализ профиля метод 1987 г .; это метод обнаружения отдаленно родственных белков путем сравнения последовательностей. Профиль - это матрица оценок для конкретной позиции, и он создается из группы последовательностей ранее выровнен (зонд). Сходство любой другой последовательности (цели) (одной или нескольких) с зондом можно проверить, сравнив цель с файлом, используя динамическое программирование. Этот алгоритм состоит из двух шагов. Первым шагом является создание профиля с помощью программного обеспечения PROFWARE, которое использует существующее выравнивание (зонд) на основе сходства последовательностей или соответствующей трехмерной структуры для создания профиля. Второй шаг - это сравнение профиля с базой данных последовательностей или одной последовательности. На этом этапе на основе сгенерированного профиля целевая последовательность или группа последовательностей могут быть выровнены с помощью PROFINAL, при выравнивании используется динамическое программирование.[3]

Рекомендации

  1. ^ а б Профиль факультета Университета Пердью В архиве 2011-12-03 в Wayback Machine
  2. ^ История ISCB
  3. ^ Грибсков, М; Маклахлан, AD; Айзенберг, Д. (июль 1987 г.). «Профильный анализ: обнаружение отдаленно родственных белков». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 84 (13): 4355–8. Дои:10.1073 / пнас.84.13.4355. ЧВК 305087. PMID 3474607.
Предшествует
Филип Борн
Президент
Международное общество вычислительной биологии

2003 – 2007
Преемник
Буркхард Рост