WikiDer > Белки оттока через внешнюю мембрану

Outer membrane efflux proteins
Белок оттока через внешнюю мембрану
1yc9 opm.png
Идентификаторы
СимволOEP
PfamPF02321
ИнтерПроIPR003423
SCOP21ek9 / Объем / СУПФАМ
TCDB1.B.17
OPM суперсемейство34
Белок OPM1yc9

Белки в отток наружной мембраны белковая семья образуют тримерные (трехкомпонентные) каналы, которые позволяют экспортировать различные субстраты в грамотрицательные бактерии. Каждый член этого семейства состоит из двух повторов. Тримерный канал состоит из 12-нитевого бета-баррель что охватывает внешняя мембрана, и длинный винтовой ствол, охватывающий периплазма.

Примеры включают кишечная палочка Белок внешней мембраны TolC, который необходим для правильной экспрессии генов белка внешней мембраны; белок клубеньков Rhizobium; и белок Pseudomonas FusA, который участвует в устойчивости к фузариновая кислота.

Рекомендации

  • Джонсон JM, Church GM (апрель 1999 г.). «Выравнивание и предсказание структуры дивергентных семейств белков: периплазматических белков и белков внешней мембраны бактериальных насосов оттока». Журнал молекулярной биологии. 287 (3): 695–715. CiteSeerX 10.1.1.73.559. Дои:10.1006 / jmbi.1999.2630. PMID 10092468.