WikiDer > Мотив РНК STAXI - Википедия

STAXI RNA motif - Wikipedia
СТАКСИ РНК
STAXI-RNA.svg
Консенсусная вторичная структура РНК STAXI
Идентификаторы
СимволСТАКСИ
РфамRF01728
Прочие данные
РНК типмРНК
Домен (ы)Энтеробактерии
PDB структурыPDBe

В Ssbp, топоизомераза, антирестрикция, мотив РНК интегразы XerDC (Мотив РНК STAXI) является сохраняющимся РНК-подобная структура, идентифицированная с помощью биоинформатика.[1] РНК STAXI расположены рядом с гены кодирование белки которые взаимодействуют с ДНК (SSBP, топоизомераза, XerDC интегрировать) или связаны с такими белками (антиограничение белки, которые подавляют рестрикционные ферменты). Это наблюдение повысило вероятность того, что экземпляры мотива STAXI функционируют как одноцепочечные молекулы ДНК, возможно, во время Репликация ДНК или же Ремонт ДНК. С другой стороны, мотивы STAXI часто содержат концевые петли, соответствующие стабильному UNCG. тетрапетля, но ДНК-версия этой тетрапетли (TNCG) не особенно стабильна. Мотив STAXI состоит из простого псевдоузел структура, которая повторяется два или более раз (см. диаграмму).

В том же исследовании был идентифицирован ряд других РНК, в том числе:


Рекомендации

  1. ^ Вайнберг З., Ван Дж. Х, Бог Дж. И др. (Март 2010 г.). «Сравнительная геномика обнаруживает 104 кандидата структурированных РНК из бактерий, архей и их метагеномов». Геном Биол. 11 (3): R31. Дои:10.1186 / gb-2010-11-3-r31. ЧВК 2864571. PMID 20230605.

внешняя ссылка