WikiDer > SYBR Safe - Википедия

SYBR Safe - Wikipedia
SYBR Сейф
SYBR Safe.svg
Имена
Название ИЮПАК
(Z) -4 - ((3-Метилбензо [d] тиазол-2 (3ЧАС) -илиден) метил) -1-пропилхинолин-1-иум-4-метилбензолсульфонат
Идентификаторы
Характеристики
C28ЧАС28N2О3S2
Молярная масса504.66 г · моль−1
РастворимостьРастворим в диметилсульфоксид
Если не указано иное, данные для материалов приводятся в их стандартное состояние (при 25 ° C [77 ° F], 100 кПа).
проверитьY проверять (что проверитьY☒N ?)
Ссылки на инфобоксы

SYBR Сейф это цианиновый краситель[1] используется как нуклеиновая кислота пятно в молекулярная биология.[2] SYBR Safe - это один из ряда красителей SYBR, производимых Life Technologies Corporation. SYBR Safe связывается с ДНК. Образующийся комплекс ДНК-краситель поглощает синий свет (λМаксимум = 509 нм) и излучает зеленый свет (λМаксимум = 524 нм).

Безопасность

SYBR Safe позиционируется как более безопасная альтернатива этидиум бромид.[3] Однако, поскольку сама молекула немного больше, чем бромид этидия, она не так легко связывается с колонкой экстракции из геля, что делает ее менее эффективной при попытке клонирования фрагмента ДНК в плазмиду. SYBR Safe имеет очень похожую структуру. структура тиазолового апельсина,[4][5][6] который имеет метильную группу, присоединенную к заряженному азоту, тогда как SYBR Safe имеет N-пропильная группа. Было показано, что тиазоловый апельсин в три-четыре раза менее мутагенен, чем бромид этидия, тогда как SYBR Safe в четыре-пять раз менее мутагенный.[7] Кроме того, согласно веб-сайту Life Technologies, SYBR Safe не является смертельным для крыс при дозах до 5 г / кг, а у крыс не проявляются симптомы острой токсичности. Тиазоловый апельсин в этой дозе проявляет токсичность.

Похожие цианиновые красители

  • ТО (тиазоловый апельсин)
  • SYBR Зеленый I
  • SYBR Green II
  • SYBR Gold
  • YO (желтый оксазол)
  • PG (PicoGreen)

Смотрите также

  • GelGreen - конкурирующий продукт с другой молекулярной структурой и размером

Примечания и ссылки

  1. ^ Эвенсон В.Е.; Боден Л.М.; Музикар К.А.; О'Лири DJ (2012). «Назначение ЯМР 1H и 13C для цианиновых красителей SYBR Safe и Thiazole Orange». Журнал органической химии. 77 (23): 10967–10971. Дои:10.1021 / jo3021659. PMID 23137048.
  2. ^ это чаще всего используется как окраска ДНК в электрофорез в агарозном геле
  3. ^ Haines, Alicia M .; Tobe, Shanan S .; Кобус, Хилтон Дж .; Линакр, Адриан (март 2015). «Свойства красителей, окрашивающих нуклеиновые кислоты, используемых в гель-электрофорезе». Электрофорез. 36 (6): 941–944. Дои:10.1002 / elps.201400496.
  4. ^ О'Нил, Кейси С .; Beach, Jacie L .; Грубер, Тодд Д. (июнь 2018 г.). «Тиазоловый апельсин в качестве повседневной замены бромистого этидия и дорогостоящих красителей для ДНК для электрофореза». Электрофорез. 39 (12): 1474–1477. Дои:10.1002 / elps.201700489.
  5. ^ Эвенсон, Уильям Э .; Boden, Lauren M .; Muzikar, Katy A .; О’Лири, Дэниел Дж. (27 ноября 2012 г.). «Назначение ЯМР 1H и 13C для цианиновых красителей SYBR Safe и Thiazole Orange». Журнал органической химии. 77 (23): 10967–10971. Дои:10.1021 / jo3021659. PMID 23137048.
  6. ^ Бьянкарди, Алессандро; Тарита, Бивер; Альберто, Марини; Бенедетта, Меннуччи; Фернандо, Секко (2011). «Тиазоловый оранжевый (ТО) в качестве датчика переключения света: комбинированное квантово-механическое и спектроскопическое исследование». Физическая химия Химическая физика. 13 (27): 12595–12602. Дои:10.1039 / C1CP20812H.
  7. ^ Эвенсон В.Е.; Боден Л.М.; Музикар К.А.; О'Лири DJ (2012). «Назначение ЯМР 1H и 13C для цианиновых красителей SYBR Safe и Thiazole Orange». Журнал органической химии. 77 (23): 10967–10971. Дои:10.1021 / jo3021659. PMID 23137048.