WikiDer > Одноволновая аномальная дисперсия

Было предложено, чтобы эта статья была слился с Многоволновая аномальная дисперсия. (Обсудить) Предлагается с июня 2020 года.

Одноволновая аномальная дифракция (SAD) это техника, используемая в Рентгеновская кристаллография что облегчает определение структуры белки или другие биологические макромолекулы, позволяя растворить фазовая проблема. В отличие от многоволновая аномальная дифракция, SAD использует один набор данных на одной подходящей длине волны. Одним из преимуществ этого метода является минимизация времени, затрачиваемого кристаллом на пучок, что снижает потенциальное радиационное повреждение молекулы при сборе данных. ГРУСТНЫЙ иногда называют «одноволновая аномальная дисперсия», но нет диспергирующий В этом методе используются различия, поскольку данные собираются на одной длине волны. Сегодня селен-САД широко используется для экспериментальной фазы в связи с развитием методов селенометионин включение в рекомбинантные белки.

Смотрите также

Аномальная дисперсия

• Многоволновая аномальная дисперсия (СУМАСШЕДШИЙ)

Изоморфная замена

Два метода получения необходимой информации о фазировке путем введения тяжелых атомов в изоморфные кристаллы:

• Множественная изоморфная замена (МИР); и
• Единичная изоморфная замена с аномальным сигналом (СИРАС)

Другой

• Аномальное рассеяние
• Аномальное рассеяние рентгеновских лучей
• Карта Паттерсона

Рекомендации

дальнейшее чтение

• В. А. Хендриксон (1985). «Анализ структуры белка по дифракционным измерениям на множестве длин волн». Пер. ACA Том 21.
• Дж. Карле (1980). "Некоторые разработки в области аномальной дисперсии для структурного исследования макромолекулярных систем в биологии". Международный журнал квантовой химии: симпозиум по квантовой биологии 7, 357–367.
• Дж. Карле (1989). «Линейный алгебраический анализ структур с одним преобладающим типом аномального рассеивателя». Acta Crystallogr. A45, 303–307.
• А. Палер, Дж. Л. Смит и В. А. Хендриксон (1990). «Вероятностное представление информации о фазе из многоволновой аномальной дисперсии». Acta Crystallogr. A46, 537–540.
• Т. К. Тервиллигер (1994). «MAD Phasing: байесовские оценки FA» Acta Crystallogr. D50, 11–16.
• Т. К. Тервиллигер (1994). «Стадия MAD: рассмотрение дисперсионных различий как информации об изоморфном замещении» Acta Crystallogr. D50, 17–23.
• Р. Фурм, У. Шепард, Р. Кан, Гл'Эрмит и И.Л. де ла Сьерра (1995). «Метод многоволновой аномальной контрастности растворителя (MASC) в макроколекулярной кристаллографии». J. Synchrotron Rad. 2, 36–48.
• Э. де ла Фортель и Г. Бриконь (1997) "Максимально вероятное уточнение параметров тяжелых атомов для методов множественного изоморфного замещения и многоволновой аномальной дифракции". Методы в энзимологии 276, 472–494.
• В. А. Хендриксон и С. М. Огата (1997) "Определение фазы из измерений аномальной дифракции на многих длинах волн". Методы в энзимологии 276, 494–523.
• Дж. Белла и М. Г. Россманн (1998). «Общий алгоритм фазирования для множественных данных MAD и MIR» Acta Crystallogr. D54, 159–174.
• Дж. М. Гусс, Э. А. Мерритт, Р. П. Физакерли, Б. Хедман, М. Мурата, К. О. Ходжсон, и Х. К. Фриман (1989). «Определение фазы с помощью дифракции рентгеновских лучей с множеством длин волн: кристаллическая структура основного синего белка меди из огурцов». Наука 241, 806–811.
• Б. Виджаякумар и Д. Велмуруган (2013). «Использование ионов европия для фазы SAD лизоцима на длине волны Cu Kα» Acta Crystallogr. F69, 20–24.
• Дж. П. Роуз и Би-Си Ван (2016) «Поэтапное развитие SAD: история, текущее влияние и будущие возможности» Архивы Biochem Biophys 602, 80-94.

внешняя ссылка

• MAD фазировка - подробное руководство с примерами, иллюстрациями и ссылками.

Компьютерные программы

• Пакет поглощения SSRL — Бреннан С., Коуэн П.Л. (1992). «Набор программ для расчета характеристик поглощения, отражения и дифракции рентгеновских лучей для различных материалов на произвольных длинах волн» (PDF). Rev. Sci. Instrum. 63 (1): 850. Bibcode:1992RScI ... 63..850B. Дои:10.1063/1.1142625.
• CHOOCH — Эванс Г., Петтифер РФ (2001). "CHOOCH: программа для определения факторов аномального рассеяния из спектров рентгеновской флуоресценции". J. Appl. Кристалл. 34 (1): 82–86. Дои:10.1107 / S0021889800014655.
• Встряхнуть и испечь (SnB) — Смит Г.Д., Нагар Б., Рини Дж. М., Хауптман Г. А., Благословение Р. Х. (1998). «Использование Snb для определения субструктуры аномального рассеяния». Acta Crystallogr D. 54 (Pt 5): 799–804. Дои:10.1107 / S0907444997018805. PMID 9757093.
• ШЕЛКС — Шелдрик GM (1998). «ШЕЛКС: приложения к макромолекулам». В С. Фортье (ред.). Прямые методы решения макромолекулярных структур. Дордрехт: Kluwer Academic Publishers. С. 401–411. ISBN 0-7923-4949-0.

Учебники и примеры

• Эванс, Гвиндаф (октябрь 1994 г.). «Метод множественной аномальной дифракции длин волн с использованием синхротронного излучения при оптимальных энергиях рентгеновского излучения: применение в кристаллографии белков». Кандидатская диссертация. Уорикский университет.