WikiDer > Малая ядрышковая РНК SNORD36

Small nucleolar RNA SNORD36
Малая ядрышковая РНК SNORD36
RF00049.jpg
Идентификаторы
СимволSNORD36
Альт. СимволыU36
РфамRF00049
Прочие данные
РНК типГен; мяРНК; snoRNA; CD-бокс
Домен (ы)Эукариоты
ИДТИТермин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO:
ТАКТАК: 0000593
PDB структурыPDBe

snoRNA U36 (также известный как SNORD36) является некодирующая РНК (нкРНК) молекула, которая участвует в биогенезе (модификации) других малые ядерные РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК находится в ядрышко эукариотической клетки, которая является основным участком биогенеза мяРНК. Он известен как малая ядрышковая РНК (snoRNA) и также часто упоминается как направляющая РНК.

snoRNA U36 является членом C / D коробка класс snoRNA, которые содержат консервативные мотивы последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства боксов C / D действуют в направлении сайт-специфичных 2'-O-метилирование субстратных РНК.[1]

U36 закодирован внутри интрон из рибосомальный белок rpL7a и имеет две области комплементарности 18S и 28S рибосомной РНК. Эта комплементарность предполагает, что U36 действует как гид по метилированию 2'-O-рибозы.[2][3] Эта snoRNA также связана с другими snoRNA (snoR47 и Z100), идентифицированными в растении риса. Oryza sativa.[3][4]

Рекомендации

  1. ^ Galardi, S .; Fatica, A .; Бачи, А .; Scaloni, A .; Presutti, C .; Боццони, И. (октябрь 2002 г.). «Очищенные бокс-C / D snoRNP способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Молекулярная и клеточная биология. 22 (19): 6663–6668. Дои:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. ЧВК 134041. PMID 12215523.
  2. ^ Николосо М., Ку Л.Х., Мишо Б., Bachellerie JP (1996). «Кодируемые интроном антисмысловые малые ядрышковые РНК: характеристика девяти новых видов указывает на их прямую роль в качестве проводников для 2'-O-рибозы метилирования рРНК». J. Mol. Биол. 260 (2): 178–95. Дои:10.1006 / jmbi.1996.0391. PMID 8764399.
  3. ^ а б Джилли Дж, Фрид М (1998). «Эволюция мяРНК U24 и U36, кодируемых в интронах гомологов гена rpL7a позвоночных: уникальные особенности вариантов U36 млекопитающих». ДНК клетки биол. 17 (7): 591–602. Дои:10.1089 / dna.1998.17.591. PMID 9703018.
  4. ^ Лян Д., Чжоу Х., Чжан П. и др. (2002). «Новая генная организация: интронные кластеры генов snoRNA из Oryza sativa». Нуклеиновые кислоты Res. 30 (14): 3262–72. Дои:10.1093 / nar / gkf426. ЧВК 135747. PMID 12136108.

внешняя ссылка