WikiDer > Малая ядрышковая РНК SNORD38

Small nucleolar RNA SNORD38
Малая ядрышковая РНК SNORD38
RF00212.jpg
Идентификаторы
СимволSNORD38
Альт. СимволыU38
РфамRF00212
Прочие данные
РНК типГен; мяРНК; snoRNA; C / D-бокс
Домен (ы)Эукариоты
ИДТИТермин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO:
ТАКТАК: 0000593
PDB структурыPDBe

snoRNA U38 (также известен как SNORD38) это некодирующая РНК (нкРНК) молекула, которая функционирует в модификации других малые ядерные РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно находится в ядрышко эукариотической клетки, которая является основным участком биогенеза мяРНК. Он известен как малая ядрышковая РНК (snoRNA) и также часто упоминается как направляющая РНК.

snoRNA U38 принадлежит к C / D коробка класс snoRNA, которые содержат консервативные мотивы последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства боксов C / D действуют в направлении сайт-специфичных 2'-О-метилирование субстратных РНК.[1]

U38 находится в интроны 4 и 5 из рибосомальный белок S8 у человека и в гомологичных генах мыши и коровы.[2]Предполагается, что U38 управляет метилированием остатков 2'-O-рибозы в 28S рибосомная РНК (рРНК). Также был идентифицирован мышиный гомолог U38 (MBII-329).[3]

Рекомендации

  1. ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (октябрь 2002 г.). «Очищенные бокс-C / D snoRNP способны воспроизводить сайт-специфичное 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Молекулярная и клеточная биология. 22 (19): 6663–8. Дои:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. ЧВК 134041. PMID 12215523.
  2. ^ Николосо М., Ку Л.Х., Мишо Б., Bachellerie JP (июль 1996 г.). «Кодируемые интроном антисмысловые малые ядрышковые РНК: характеристика девяти новых видов указывает на их прямую роль в качестве проводников для 2'-O-рибозы метилирования рРНК». Журнал молекулярной биологии. 260 (2): 178–95. Дои:10.1006 / jmbi.1996.0391. PMID 8764399.
  3. ^ Hüttenhofer A, Kiefmann M, Meier-Ewert S, O'Brien J, Lehrach H, Bachellerie JP, Brosius J (июнь 2001 г.). «RNomics: экспериментальный подход, который идентифицирует 201 кандидата на новые, маленькие, не передающие РНК у мышей». Журнал EMBO. 20 (11): 2943–53. Дои:10.1093 / emboj / 20.11.2943. ЧВК 125495. PMID 11387227.

внешняя ссылка