WikiDer > URA3
Оротидин 5'-фосфатдекарбоксилаза | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||
Организм | |||||||
Символ | URA3 | ||||||
Альт. символы | YEL021W, ODCase | ||||||
Entrez | 856692 | ||||||
HomoloGene | 136914 | ||||||
RefSeq (мРНК) | NM_001178836 | ||||||
RefSeq (Prot) | NP_010893 | ||||||
UniProt | P03962 | ||||||
Прочие данные | |||||||
Номер ЕС | 4.1.1.23 | ||||||
Хромосома | V: 0.12 - 0.12 Мб | ||||||
|
URA3 - это ген на хромосома V в Saccharomyces cerevisiae (дрожжи). Его систематическое название YEL021W. URA3 часто используется в исследованиях дрожжей в качестве «маркерного гена», то есть гена для маркировки хромосом или плазмиды. URA3 кодирует Оротидин 5'-фосфатдекарбоксилаза (ODCase), что является фермент который катализирует одну реакцию в синтезе пиримидин рибонуклеотиды (компонент РНК).[1]
Использование в исследовании дрожжей
Потеря активности ODCase приводит к отсутствию роста клеток, если только урацил или же уридин добавлен в СМИ. Присутствие гена URA3 в дрожжах восстанавливает активность ODCase, облегчая рост на средах, не содержащих урацил или уридин, тем самым делая возможным отбор дрожжей, несущих ген. Напротив, если 5-FOA (5-фтороротовая кислота) добавляется в среду, активная ODCase превращает 5-FOA в токсичное соединение ( ингибитор суицида) 5-фторурацил вызывает гибель клеток, что позволяет проводить отбор против дрожжей, несущих ген.
Поскольку URA3 допускает как положительный, так и отрицательный отбор, он был разработан как генетический маркер для трансформации ДНК и других генетических методов у бактерий и многих видов грибов. Это один из самых важных генетических маркеров в дрожжи генетическая модификация. Хотя URA3 является мощным выбираемым маркером, он имеет высокий фон. Это связано с тем, что клетки, улавливающие мутации в URA3, также могут расти на 5-FOA. Колонии следует проверить с помощью второго анализа, такого как ПЦР, чтобы подтвердить, что нужный штамм был создан.
внешняя ссылка
База данных S. cerevisiae (2018) Ген URA3. https://www.yeastgenome.org/locus/S000000747
Рекомендации
- ^ Флинн, П. Дж .; Рис, Р. Дж. (1999). «Активация транскрипции промежуточными продуктами метаболизма пути биосинтеза пиримидина». Молекулярная и клеточная биология. 19 (1): 882–8. Дои:10.1128 / mcb.19.1.882. ЧВК 83945. PMID 9858611.