WikiDer > Мотив РНК Whalefall-1

Whalefall-1 RNA motif
Мотив РНК Whalefall-1
Whalefall-1-RNA.svg
Консенсусная вторичная структура РНК Whalefall-1
Идентификаторы
Символwf-1
РфамRF01762
Прочие данные
РНК типмРНК
Домен (ы)Метагеном падения кита
PDB структурыPDBe

В Мотив РНК Whalefall-1 (также называемый wf-1) относится к сохраненному РНК структура, которая была обнаружена с помощью биоинформатика.[1][2] Конструктивно мотив состоит из двух стебель-петли (см. диаграмму), вторая из которых часто завершается CUUG тетрапетля, которая является энергетически выгодной последовательностью РНК. РНК Whalefall-1 обнаружены только в ДНК извлекается из невозделываемых бактерии найти на кит, т.е. КИТ каркас. По состоянию на 2010 год РНК Whalefall-1 не были обнаружены ни у одного из известных культивируемых видов бактерий и, таким образом, являются одним из нескольких РНК, присутствующие в образцах окружающей среды.

Рекомендации

  1. ^ Вайнберг З., Ван Дж. Х, Бог Дж. И др. (Март 2010 г.). «Сравнительная геномика обнаруживает 104 кандидата структурированных РНК из бактерий, архей и их метагеномов». Геном Биол. 11 (3): R31. Дои:10.1186 / gb-2010-11-3-r31. ЧВК 2864571. PMID 20230605.
  2. ^ Вайнберг З., Перро Дж., Мейер М.М., Брейкер Р.Р. (декабрь 2009 г.). «Исключительные структурированные некодирующие РНК, выявленные с помощью анализа бактериального метагенома». Природа. 462 (7273): 656–9. Дои:10.1038 / природа08586. ЧВК 4140389. PMID 19956260.

внешняя ссылка