WikiDer > ZZ цинковый палец - Википедия
| ZZ | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | ZZ | ||||||||
| Pfam | PF00569 | ||||||||
| Pfam клан | CL0006 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR000433 | ||||||||
| CDD | cd02249 | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии Домен с цинковыми пальцами ZZ-типа это тип белковый домен который был назван из-за его способности связывать два zinc ионы.[1] Эти домены содержат 4-6 Cys остатки которые участвуют в связывании цинка (плюс дополнительные остатки Ser / His), включая мотив Cys-X2-Cys, обнаруженный в других доменах цинковых пальцев. Считается, что эти цинковые пальцы участвуют в белок-белковые взаимодействия. В структура домена ZZ показывает, что он принадлежит к семейству мотивов крестообразных цинковых пальцев, которые включают домены PHD, RING и FYVE.[2] Домены с цинковыми пальцами ZZ-типа встречаются в:
- Факторы транскрипции P300 и CBP.
- Растение белки участвует в свет ответы, такие как Hrb1.
- E3 убиквитинлигазы MEX и MIB2 (EC).
- Дистрофин и это гомологи
Единичные копии цинкового пальца ZZ встречаются в транскрипционный адаптерные / коактиваторные белки P300, в связывающем элементе ответа цАМФ (CREB) -связывающем белке (CBP) и ADA2. CBP предоставляет несколько участок связывания для транскрипции коактиваторы. Сайт взаимодействия с подавитель опухолей белок p53 и онкопротеин E1A с CBP / P300 представляет собой богатую Cys область, которая включает два цинк-связывающих мотива: ZZ-тип и TAZ2-тип. Цинковый палец CBP типа ZZ содержит два витых встречно-параллельных бета-листы и короткая альфа-спираль, и связывает два цинка ионы.[2] Один ион цинка координируется четырьмя цистеин остатков через 2 мотива Cys-X2-Cys, а третий ион цинка через третий мотив Cys-X-Cys и мотив His-X-His. Первый цинковый кластер строго консервативен, тогда как второй цинковый кластер демонстрирует вариабельность положения двух остатков His.
В Арабидопсис Талиана (Мышиный кресс-салат), сверхчувствительный к красному и синему 1 (Hrb1) белок, который регулирует реакции как на красный, так и на синий свет, содержит домен цинкового пальца ZZ-типа.[3]
Домены цинковых пальцев ZZ-типа также были идентифицированы в семеннике E3. убиквитин лигаза MEX, который способствует индуцированной рецептором смерти апоптоз.[4] MEX имеет четыре предполагаемых домена с цинковыми пальцами: один ZZ-типа, один SWIM-тип и два RING-типа. Область, содержащая цинковые пальцы ZZ-типа и RING-типа, необходима для взаимодействия с UbcH5a и самоассоциации MEX, тогда как домен SWIM был критическим для MEX. убиквитинирование.
Кроме того, богатые Cys домены дистрофина, утрофина и постсинаптического белка 87 кДа содержат цинковый палец ZZ-типа с высоким последовательность идентичны цинковым пальцам P300 / CBP ZZ. У дистрофина и утрофина цинковый палец ZZ-типа находится между WW-доменом (фланкированным и EF-рукой) и С-концом. спиральная катушка домен. Считается, что дистрофин действует как связующее звено между актин цитоскелет и внеклеточный матрица и нарушения комплекса, ассоциированного с дистрофином, например, между дистрофином и трансмембранный гликопротеин бета-дистрогликан, может привести к мышечной дистрофии. Дистрофин и его аутосомный гомолог утрофин взаимодействовать с бета-дистрогликаном через их С-концевые области, которые состоят из домена WW, домена руки EF и домена цинкового пальца ZZ-типа.[5] Домен WW является первичным местом взаимодействия между дистрофином или утрофином и дистрогликаном, тогда как домены руки EF и цинковые пальцы ZZ-типа стабилизируют и усиливают это взаимодействие.
Рекомендации
- ^ Понтинг С.П., Блейк Д.И., Дэвис К.Э., Кендрик-Джонс Дж., Уиндер С.Дж. (январь 1996 г.). «ZZ и TAZ: новые предполагаемые цинковые пальцы в дистрофине и других белках». Trends Biochem. Наука. 21 (1): 11–13. Дои:10.1016 / s0968-0004 (06) 80020-4. PMID 8848831.
- ^ а б Legge GB, Martinez-Yamout MA, Hambly DM, Trinh T, Lee BM, Дайсон HJ, Wright PE (октябрь 2004 г.). «ZZ-домен CBP: необычная складка из цинковых пальцев в модуле взаимодействия с белками». J. Mol. Биол. 343 (4): 1081–93. Дои:10.1016 / j.jmb.2004.08.087. PMID 15476823.
- ^ Кан Х, Чонг Дж, Ни М. (март 2005 г.). «ГИПЕРЧУВСТВИТЕЛЬНЫЙ К КРАСНОМУ И СИНЕМУ 1, белок цинкового пальца ZZ-типа, регулирует опосредованный фитохромом B красный и опосредованный криптохромом синий световой ответ». Растительная клетка. 17 (3): 822–35. Дои:10.1105 / tpc.104.029165. ЧВК 1069701. PMID 15705950.
- ^ Нисито Ю., Хасегава М., Инохара Н., Нуньес Дж. (Июнь 2006 г.). «MEX представляет собой тестис-специфическую E3-убиквитинлигазу, которая способствует апоптозу, индуцированному рецептором смерти». Biochem. J. 396 (3): 411–7. Дои:10.1042 / BJ20051814. ЧВК 1482824. PMID 16522193.
- ^ Hnia K, Zouiten D, Cantel S, Chazalette D, Hugon G, Fehrentz JA, Masmoudi A, Diment A, Bramham J, Mornet D, Winder SJ (февраль 2007 г.). «ZZ домен дистрофина и утрофина: топология и картирование сайта взаимодействия бета-дистрогликанов». Biochem. J. 401 (3): 667–77. Дои:10.1042 / BJ20061051. ЧВК 1770854. PMID 17009962.