WikiDer > ACSL4

ACSL4
ACSL4
Идентификаторы
ПсевдонимыACSL4, ACS4, FACL4, LACS4, MRX63, MRX68, член 4 семейства длинноцепочечных ацил-CoA синтетаз, член 4 семейства длинноцепочечных ацил-CoA синтетаз
Внешние идентификаторыOMIM: 300157 MGI: 1354713 ГомолоГен: 56282 Генные карты: ACSL4
Расположение гена (человек)
Х-хромосома (человек)
Chr.Х-хромосома (человек)[1]
Х-хромосома (человек)
Геномное расположение ACSL4
Геномное расположение ACSL4
ГруппаXq23Начните109,624,244 бп[1]
Конец109,733,403 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE ACSL4 202422 s at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_004458
NM_022977
NM_001318509
NM_001318510

NM_001033600
NM_019477
NM_207625

RefSeq (белок)

NP_001305438
NP_001305439
NP_004449
NP_075266

NP_001028772
NP_062350
NP_997508

Расположение (UCSC)Chr X: 109,62 - 109,73 МбChr X: 142,32 - 142,39 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Длинноцепочечные жирные кислоты - КоА-лигаза 4 является фермент что в люди кодируется ACSL4 ген.[5][6][7]

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой изофермент длинной цепи жирная кислота-кофермент А лигаза семья. Хотя отличается субстратная специфичность, субклеточный локализация и ткань распределения, все изоферменты этого семейства превращают свободные длинноцепочечные жирные кислоты в жирные ацил-CoA сложные эфиры, и тем самым играть ключевую роль в липид биосинтез и разложение жирных кислот. Этот изофермент предпочтительно использует арахидонат так как субстрат. Отсутствие этого фермента может способствовать умственная отсталость или Синдром Альпорта. Альтернативный сплайсинг этого гена дает 2 варианта транскрипта.[7]

Структура

Ген ACSL4 расположен на X-хромосоме, а его конкретное местоположение - Xq22.3-q23. Ген содержит 17 экзонов.[7] ASCL4 кодирует белок FACL4 массой 74,4 кДа, который состоит из 670 аминокислот; 17 пептидов были обнаружены с помощью данных масс-спектрометрии.[8][9]

Функция

КоА-лигаза 4 жирных кислот (FACL4), белок, кодируемый геном ACSL4, представляет собой ацил-КоА-синтетазу, которая является важным классом ферментов метаболизма липидов, и ACSL4 отличается предпочтением арахидоновой кислоте.[10] Фермент контролирует уровень этой жирной кислоты в клетках; Поскольку известно, что АК вызывает апоптоз (специфичный для клеток), этот фермент модулирует апоптоз.[11] Сверхэкспрессия ACSL4 приводит к более высокой скорости синтеза арахидоноил-КоА, увеличению включения 20: 4 в фосфатидилэтаноламин, фосфатидилинозитол и триацилглицерин и снижению клеточных уровней неэтерифицированного 20: 4. Кроме того, ACSL4 регулирует высвобождение PGE₂ из гладкомышечных клеток человека. ACSL4 может регулировать ряд процессов, зависящих от высвобождения липидных медиаторов, производных арахидоновой кислоты, в стенке артерии.[12]

Клиническое значение

Наиболее распространенный SNP (замена C на T) в первом интроне гена FACL4 связан с измененным составом ЖК фосфатидилхолинов в плазме у пациентов с метаболическим синдромом.[13]Он участвует во многих механизмах канцерогенеза и развития нейронов.[10]

Рак

При раке молочной железы ACSL4 может служить как биомаркером, так и медиатором агрессивного фенотипа рака молочной железы. ACSL4 также положительно коррелирует с уникальным подтипом тройного отрицательного рака груди (TNBC), который характеризуется отсутствием рецептора андрогенов (AR) и поэтому называется четверным отрицательным раком груди (QNBC).[14]

Кодируемый белок FACL4 также играет роль в росте раковых клеток печени. Ингибирование FACL4 приводит к ингибированию опухолевых клеток печени человека, что проявляется в повышенном уровне апоптоза.[15] Также было высказано предположение, что модуляция экспрессии / активности FACL4 является подходом к лечению карциномы печеночных клеток (HCC).[11]

Путь FACL4 также важен в канцерогенезе толстой кишки; Разработка селективных ингибиторов FACL4 может быть достойным усилием в профилактике и лечении рака толстой кишки. Повышающая регуляция FACL4, по-видимому, происходит во время трансформации рака из аденомы в аденокарциному. Кроме того, некоторые промоторы опухолей толстой кишки значительно индуцировали экспрессию FACL4.[16]

Нейрональное развитие

Было показано, что ген FACL4 участвует в неспецифической умственной отсталости и метаболизме жирных кислот.[17] Поскольку ген ASCL4 высоко экспрессируется в головном мозге, где он кодирует специфическую для мозга изоформу, мутация FACL4 может быть эффективным диагностическим инструментом у умственно отсталых мужчин.[18] FACL4 был обнаружен в семье с Синдром Альпорта и эллиптоцитоз.[19]

Взаимодействия

Экспрессия ACSL4 регулируется активностью SHP2.[20] Кроме того, ACSL4 взаимодействует с ACSL3, ПРИЛОЖЕНИЕ, DSE, ELAVL1, HECW2, MINOS1, ПАРК2, SPG20, SUMO2, TP53, TUBGCP3, UBC, UBD, и YWHAQ.[7]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000068366 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031278 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Пиччини М., Вителли Ф., Бруттини М., Побер Б. Р., Йонссон Дж. Дж., Вилланова М., Золло М., Борсани Дж., Баллабио А., Реньери А. (апрель 1998 г.). «FACL4, новый ген, кодирующий длинноцепочечную ацил-КоА синтетазу 4, удален в семье с синдромом Альпорта, эллиптоцитозом и умственной отсталостью». Геномика. 47 (3): 350–8. Дои:10.1006 / geno.1997.5104. PMID 9480748.
  6. ^ Веро Л., Аллоизио Н., Морле Л., Бозон М., Турень Р., Плаучу Н., Эдери П. (сентябрь 2003 г.). «Локализация несиндромального X-сцепленного гена умственной отсталости (MRX80) на Xq22-q24». Am J Med Genet A. 122A (1): 37–41. Дои:10.1002 / ajmg.a.20221. PMID 12949969.
  7. ^ а б c d «Ген Entrez: член 4 семейства длинноцепочечных ацил-CoA синтетазы ACSL4».
  8. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Дуан Х., Улен М., Йетс Дж. Р., Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии кардиального протеома и медицины посредством специализированной базы знаний». Циркуляционные исследования. 113 (9): 1043–53. Дои:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. ЧВК 4076475. PMID 23965338.
  9. ^ «Член 4 семейства длинноцепочечных ацил-КоА синтетаз». Атлас кардиоорганических белков (COPaKB). Архивировано из оригинал на 2015-09-24. Получено 2015-03-24.
  10. ^ а б Küch, EM; Велларамкалаил, Р; Чжан, я; Lehnen, D; Брюггер, В; Среммел, Вт; Ehehalt, R; Poppelreuther, M; Füllekrug, J (февраль 2014 г.). «Дифференциально локализованные изоферменты ацил-КоА синтетазы 4 опосредуют метаболическое направление жирных кислот в направлении фосфатидилинозита». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Молекулярная и клеточная биология липидов. 1841 (2): 227–39. Дои:10.1016 / j.bbalip.2013.10.018. PMID 24201376.
  11. ^ а б Sung, YK; Парк, МК; Hong, SH; Hwang, SY; Квак, MH; Ким, JC; Ким, МК (31 августа 2007 г.). «Регулирование роста клеток жирной кислотой-CoA лигазой 4 в клетках гепатоцеллюлярной карциномы человека». Экспериментальная и молекулярная медицина. 39 (4): 477–82. Дои:10.1038 / emm.2007.52. PMID 17934335.
  12. ^ Голей, DL; Аскари, Б; Kramer, F; Барнхарт, S; Вивеканандан-Гири, А; Pennathur, S; Борнфельдт, К. Э. (апрель 2011 г.). «Длинноцепочечная ацил-КоА синтетаза 4 модулирует высвобождение простагландина E₂ из клеток гладких мышц артерий человека». Журнал липидных исследований. 52 (4): 782–93. Дои:10.1194 / jlr.m013292. ЧВК 3053208. PMID 21242590.
  13. ^ Земан, М; Вецкая, М; Яхимова, М; Jirák, R; Tvrzická, E; Станкова, Б; Зак, А (апрель 2009 г.). «Полиморфизм гена CoA-лигазы-4 жирных кислот влияет на метаболизм жирных кислот при метаболическом синдроме, но не при депрессии». Журнал экспериментальной медицины Тохоку. 217 (4): 287–93. Дои:10.1620 / tjem.217.287. PMID 19346733.
  14. ^ Ву, Х; Ли, У; Ван, Дж; Вен, X; Маркус, MT; Дэниэлс, G; Zhang, DY; Ye, F; Ванга, LH; Ду, Х; Адамс, S; Сингх, B; Завадил, Дж; Ли, П; Монако, Мэн (2013). «Длинноцепочечная жирная ацил-КоА синтетаза 4 является биомаркером и медиатором устойчивости к гормонам при раке груди человека». PLOS ONE. 8 (10): e77060. Bibcode:2013PLoSO ... 877060 Вт. Дои:10.1371 / journal.pone.0077060. ЧВК 3796543. PMID 24155918.
  15. ^ Hu, C; Чен, L; Цзян, Y; Ли, У; Ван, С. (январь 2008 г.). «Влияние жирной кислоты-CoA лигазы 4 на рост раковых клеток печени». Биология и терапия рака. 7 (1): 131–4. Дои:10.4161 / cbt.7.1.5198. PMID 18059177.
  16. ^ Цао, Y; Дэйв, КБ; Доан, Т.П .; Прескотт, С.М. (1 декабря 2001 г.). «При аденокарциноме толстой кишки повышается активность CoA-лигазы 4 жирных кислот». Исследования рака. 61 (23): 8429–34. PMID 11731423.
  17. ^ Мелони, я; Muscettola, M; Рейно, М; Лонго, я; Bruttini, M; Моизард, депутат; Гомот, М; Chelly, J; де Порт, V; Fryns, JP; Роперс, HH; Magi, B; Bellan, C; Volpi, N; Yntema, HG; Льюис, ЮВ; Schaffer, JE; Реньери, А (апрель 2002 г.). «FACL4, кодирующий жирную кислоту-CoA-лигазу 4, мутирован в результате неспецифической Х-связанной умственной отсталости». Природа Генетика. 30 (4): 436–40. Дои:10,1038 / ng857. PMID 11889465.
  18. ^ Лонго, я; Frints, SG; Fryns, JP; Мелони, я; Пескуччи, C; Ariani, F; Borghgraef, M; Рейно, М; Маринен, П; Шварц, К; Реньери, А; Froyen, G (январь 2003 г.). «Третье семейство MRX (MRX68) является результатом мутации в гене длинноцепочечной жирной кислоты-CoA-лигазы 4 (FACL4): предложение быстрого ферментативного анализа для скрининга умственно отсталых пациентов». Журнал медицинской генетики. 40 (1): 11–7. Дои:10.1136 / jmg.40.1.11. ЧВК 1735250. PMID 12525535.
  19. ^ Пиччини, М; Vitelli, F; Bruttini, M; Побер, БР; Йонссон, JJ; Вилланова, М; Золло, М; Borsani, G; Ballabio, A; Реньери, А. (1 февраля 1998 г.). «FACL4, новый ген, кодирующий длинноцепочечную ацил-КоА синтетазу 4, удален в семье с синдромом Альпорта, эллиптоцитозом и умственной отсталостью». Геномика. 47 (3): 350–8. Дои:10.1006 / geno.1997.5104. PMID 9480748.
  20. ^ Кук, М; Орландо, США; Малоберти, П; Podestá, EJ; Корнехо Масиэль, Ф (ноябрь 2011 г.). «Тирозинфосфатаза SHP2 регулирует экспрессию ацил-КоА-синтетазы ACSL4». Журнал липидных исследований. 52 (11): 1936–48. Дои:10.1194 / jlr.m015552. ЧВК 3196225. PMID 21903867.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка