WikiDer > ARL1

ARL1
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1UPT, 4DCN, 5EE5
Идентификаторы
Псевдонимы	ARL1, ARFL1, фактор рибозилирования АДФ, такой как GTPase 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 603425 MGI: 99436 ГомолоГен: 20319 Генные карты: ARL1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 12 (человек)
Конец	101,407,772 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 10 (мышь)
Конец	88,744,094 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ; ; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание нуклеотидов; • GO: 0010577 активность активатора фермента; • ГТФазная активность; • специфическое связывание белкового домена; • связывание ионов металлов; • Связывание GTP;
Сотовый компонент	• аппарат Гольджи; • Мембрана Гольджи; • внутриклеточный; • мембрана; • цитоплазма; • сеть транс-Гольджи; • мембрана транс-сети Гольджи; • цитозоль;
Биологический процесс	• локализация белка в аппарате Гольджи; • процесс обмена токсинов; • активация активности фосфолипазы D; • ретроградный транспорт, эндосома к Гольджи; • Организация Гольджи; • Транспорт везикул Гольджи; • внутриклеточный транспорт белка; • везикулярный транспорт;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	400
	104303
	ENSG00000120805
	ENSMUSG00000060904
	P40616
	P61211
	NM_001301068; NM_001177
	NM_025859
	NP_001168; NP_001287997
	NP_080135
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

ARL1

АДФ-фактор рибозилирования-подобный белок 1 это белок что у людей кодируется ARL1 ген.^[5]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к семейству белков ARL (ADP-подобный фактору рибозилирования), которые структурно связаны с факторами ADP-рибозилирования (ARF). ARF, описанные как активаторы активности АДФ-рибозилтрансферазы холерного токсина (CT), регулируют внутриклеточный перенос везикулярной мембраны и стимулируют изоформу фосфолипазы D (PLD). Хотя первоначально считалось, что белки ARL не активируют CT или PLD, более поздние исследования показали, что они являются слабыми стимуляторами PLD и CT в зависимости от фосфолипидов.^[5]

Взаимодействия

ARL1 был показан взаимодействовать с ГОЛГА4^[6]^[7] и ГОЛГА1.^[6]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000120805 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000060904 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ ^а ^б «Ген Entrez: ARL1, фактор ADP-рибозилирования, подобный 1».
^ ^а ^б Лу Л., Хонг В. (сентябрь 2003 г.). «Взаимодействие Arl1-GTP с доменами GRIP привлекает аутоантигены Golgin-97 и Golgin-245 / p230 на Гольджи». Мол. Биол. Ячейка. 14 (9): 3767–81. Дои:10.1091 / mbc.E03-01-0864. ЧВК 196566. PMID 12972563.
^ Ван Валкенбург Х., Шерн Дж. Ф., Акционер Дж. Д., Чжу Х, Кан Р. А. (июнь 2001 г.). «Факторы ADP-рибозилирования (ARF) и ARF-подобные 1 (ARL1) имеют как специфические, так и общие эффекторы: характерные для ARL1-связывающих белков». J. Biol. Chem. 276 (25): 22826–37. Дои:10.1074 / jbc.M102359200. PMID 11303027.

внешняя ссылка

Человек ARL1 расположение генома и ARL1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

Чжан Г.Ф., Паттон В.А., Ли Ф.Дж., Лиянаге М., Хан Дж.С., Ри С.Г., Мосс Дж., Воган М. (1995). «Для активации холерного токсина и фосфолипазы D требуются разные домены ARF». J. Biol. Chem. 270 (1): 21–4. Дои:10.1074 / jbc.270.1.21. PMID 7814376.
Хонг Дж. Х., Ли Ф. Дж., Паттон В. А., Лин Си Ю., Мосс Дж., Воган М. (1998). «Фосфолипид- и GTP-зависимая активация холерного токсина и фосфолипазы D человеческим АДФ-фактором рибозилирования-подобным белком 1 (HARL1)». J. Biol. Chem. 273 (25): 15872–6. Дои:10.1074 / jbc.273.25.15872. PMID 9624189.
Чжао Л., Хелмс Дж. Б., Бруннер Дж., Виланд Ф. Т. (1999). «GTP-зависимое связывание фактора ADP-рибозилирования с коатомером в непосредственной близости от сайта связывания для мотивов извлечения дилизина и p23». J. Biol. Chem. 274 (20): 14198–203. Дои:10.1074 / jbc.274.20.14198. PMID 10318838.
Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2000). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК 310948. PMID 11076863.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Поустка А. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК 311072. PMID 11230166.
Симпсон Дж. С., Велленройтер Р., Поустка А., Пепперкок Р., Виманн С. (2000). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Rep. 1 (3): 287–92. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК 1083732. PMID 11256614.
Ван Валкенбург Х., Шерн Дж. Ф., Акционер Дж. Д., Чжу Х, Кан Р. А. (2001). «Факторы ADP-рибозилирования (ARF) и ARF-подобные 1 (ARL1) имеют как специфические, так и общие эффекторы: характерные для ARL1-связывающих белков». J. Biol. Chem. 276 (25): 22826–37. Дои:10.1074 / jbc.M102359200. PMID 11303027.
Лу Л., Хонг В. (2003). «Взаимодействие Arl1-GTP с доменами GRIP привлекает аутоантигены Golgin-97 и Golgin-245 / p230 на Гольджи». Мол. Биол. Ячейка. 14 (9): 3767–81. Дои:10.1091 / mbc.E03-01-0864. ЧВК 196566. PMID 12972563.
Лу Л, Тай Г, Хун В (2004). «Аутоантиген Golgin-97, эффектор Arl1 GTPase, участвует в трафике от эндосомы к сети транс-Гольджи». Мол. Биол. Ячейка. 15 (10): 4426–43. Дои:10.1091 / mbc.E03-12-0872. ЧВК 519138. PMID 15269279.
Wiemann S, Arlt D, Huber W., Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК 528930. PMID 15489336.
Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И., дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф., Бектель С., Симпсон Дж., Хофманн О., Хиде В., Глаттинг К. Х., Хубер В., Пепперкок Р., Поустка А., Виманн С. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Проблема с базой данных): D415-8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК 1347501. PMID 16381901.
Зан С., Хоммель А., Лу Л., Хонг В., Вальтер Д. Д., Флориан С., Йуст Г. Г., Шюрманн А. (2007). «Нокаут Arfrp1 приводит к нарушению нацеливания ARF-like1 (ARL1) на транс-Гольджи в эмбрионах мыши и клетках HeLa». Мол. Membr. Биол. 23 (6): 475–85. Дои:10.1080/09687860600840100. PMID 17127620. S2CID 22778359.
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., Макбрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК 1847948. PMID 17353931.

Эта статья о ген на хромосома человека 12 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000120805 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000060904 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[entrez-5] а ^б «Ген Entrez: ARL1, фактор ADP-рибозилирования, подобный 1».

[pmid12972563-6] а ^б Лу Л., Хонг В. (сентябрь 2003 г.). «Взаимодействие Arl1-GTP с доменами GRIP привлекает аутоантигены Golgin-97 и Golgin-245 / p230 на Гольджи». Мол. Биол. Ячейка. 14 (9): 3767–81. Дои:10.1091 / mbc.E03-01-0864. ЧВК 196566. PMID 12972563.

[pmid11303027-7] Ван Валкенбург Х., Шерн Дж. Ф., Акционер Дж. Д., Чжу Х, Кан Р. А. (июнь 2001 г.). «Факторы ADP-рибозилирования (ARF) и ARF-подобные 1 (ARL1) имеют как специфические, так и общие эффекторы: характерные для ARL1-связывающих белков». J. Biol. Chem. 276 (25): 22826–37. Дои:10.1074 / jbc.M102359200. PMID 11303027.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

Navigation