WikiDer > База J

Base J
База J
D-глюкопиранозилоксиметилурацил.svg
Имена
Название ИЮПАК
5-[[(3р,4S,5S,6р) -3,4,5-Тригидрокси-6- (гидроксиметил) тетрагидропиран-2-ил] оксиметил] -1ЧАС-пиримидин-2,4-дион
Другие имена
β-D-Глюкозил-5-гидроксиметилурацил
β-D-Глюкозил-гидроксиметилурацил
Идентификаторы
3D модель (JSmol)
ChemSpider
Характеристики
C11ЧАС16N2О8
Молярная масса304.255 г · моль−1
Если не указано иное, данные для материалов приводятся в их стандартное состояние (при 25 ° C [77 ° F], 100 кПа).
Ссылки на инфобоксы

β-D-Глюкопиранозилоксиметилурацил или же база J гипермодифицированный азотистое основание найдено в ДНК из кинетопластиды включая человека патогенный трипаносомы. Он был открыт в 1993 году в трипаносоме. Trypanosoma brucei и был первым гипермодифицированным азотистым основанием, обнаруженным в ДНК эукариот; с тех пор он был обнаружен в других кинетопластидах, включая Лейшмания.[1]Внутри этих организмов база J действует как РНК-полимераза II терминатор транскрипции с его удалением в нокаутные клетки сопровождается массивным считыванием сайтов терминации РНК-полимеразы II, что в конечном итоге оказывается смертельным для клетки.[2][3]

База J образована начальным гидроксилирование из тимидин и последующие гликозилирование пока неустановленным гликозилтрансфераза.[1]

Биосинтез основания J. А: тимидингидроксилаза; B: бета-глюкозилтранфераза; 1: dT (дезокситимидин); 2: HOCH3dU; 3: dJ

Рекомендации

  1. ^ а б Борст, Пит; Сабатини, Роберт (октябрь 2008 г.). «База J: открытие, биосинтез и возможные функции». Ежегодный обзор микробиологии. 62 (1): 235–251. Дои:10.1146 / annurev.micro.62.081307.162750. PMID 18729733.
  2. ^ van Luenen, Henri G.A.M .; Фаррис, Кэрол; Ян, Сабрина; Дженест, Поль-Андре; Трипати, Панкадж; Велдс, Арно; Керховен, Рон М .; Ньюланд, Марья; Хейдок, Эндрю; Рамасами, Гаутаман; Вайнио, Саара; Хайдебрехт, Татьяна; Перракис, Анастассис; Пейджи, Людо; ван Стинзель, Бас; Майлер, Питер Дж .; Борст, Пит (август 2012). «Глюкозилированный гидроксиметилурацил, основание ДНК J, предотвращает прохождение транскрипции при лейшмании». Клетка. 150 (5): 909–921. Дои:10.1016 / j.cell.2012.07.030. ЧВК 3684241. PMID 22939620.
  3. ^ Hazelbaker, Dane Z .; Буратовски, Стивен (ноябрь 2012 г.). "Транскрипция: База J преграждает путь". Текущая биология. 22 (22): R960 – R962. Дои:10.1016 / j.cub.2012.10.010. ЧВК 3648658. PMID 23174300.