WikiDer > C1QTNF5

C1QTNF5
C1QTNF5
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыC1QTNF5, CTRP5, C1q и белок 5, связанный с фактором некроза опухоли, C1q и родственный TNF 5, MFRP
Внешние идентификаторыOMIM: 608752 MGI: 2385958 ГомолоГен: 9227 Генные карты: C1QTNF5
Расположение гена (человек)
Хромосома 11 (человек)
Chr.Хромосома 11 (человек)[1]
Хромосома 11 (человек)
Геномное расположение C1QTNF5
Геномное расположение C1QTNF5
Группа11q23.3Начинать119,338,942 бп[1]
Конец119,340,940 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_015645
NM_001278431

NM_001040631
NM_001040632
NM_001190313
NM_001190319
NM_145613

RefSeq (белок)

NP_001265360
NP_056460

Расположение (UCSC)Chr 11: 119.34 - 119.34 МбChr 9: 44.11 - 44.11 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

C1q и белок 5, связанный с фактором некроза опухоли, также известный как C1QTNF5, это белок который у человека кодируется C1QTNF5 ген .[5][6] Ген C1QTNF5 секретируется и связан с мембраной белка, который сильно экспрессируется в клетках пигментного эпителия сетчатки.[7][8][9]

Функция

Белок CTRP5 является членом C1q / фактор некроза опухоли суперсемейство, которое демонстрирует разнообразные функции, включая клеточная адгезия и как компоненты базальная мембрана.[10]

Клиническое значение

Мутация в гене C1QTNF5 вызывает позднее начало дегенерация сетчатки.[6]Более конкретно, единичная миссенс-мутация (S163R) в кодируемом белке C1QTNF5 вызывает болезнь поздней дегенерации сетчатки (L-ORD).[5]

Структура

Структура C1q и белка 5, связанного с фактором некроза опухоли (C1QTNF5), который также называется CTRP5[11] имеет три основных домена. Первый домен представляет собой одиночный пептид, расположенный на N-конце, второй домен представляет собой домен коллажа, а третий домен представляет собой глобулярный комплемент 1q (gC1q), который существует в C-концевом домене.[8][12][13][7][14] Единственная мутация S163R обнаружена в домене gC1q, который является основной причиной болезни поздней дегенерации сетчатки (L-ORD).[7][9][8][14] C1QTNF5 является частью семейства C1q. Однако существует уникальная особенность структуры C1QTNF5, заключающаяся в том, что он не владеет сайтом связывания Ca 2+, как другие члены семейства C1q.[7]

Кристальная структура

Кристаллическая структура C1QTNF5 была взята Xiongying и Krzysztof и имеет две характеристики. Во-первых, структура C1QTNF5, по-видимому, не имеет сайта связывания Ca 2+ для обеспечения ее стабильности. Кроме того, он необходим для функционирования членов семейства C1q. Другой особенностью является наличие необычной последовательности (F181, F182, G183, G184, W185, P186), которая создает гидрофобное поле. В этой области S163 и F182 образуют H-связь, однако мутация S163 нарушает H-связь.[7]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000223953 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000079592 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б Стэнтон С.М., Борооа С., Дрейк С., Марш Дж. А., Кэмпбелл С., Леннон А., Соарес, округ Колумбия, Валлаб Н. А., Сахни Дж., Сидесиян А. В., Диллон Б., Витарт В., Якобсон С. Г., Райт А. Ф., Хейворд С. (сентябрь 2017 г.). «Новые патогенные мутации в C1QTNF5 поддерживают доминантно-негативный механизм заболевания при поздней дегенерации сетчатки». Научные отчеты. 7 (1): 12147. Дои:10.1038 / s41598-017-11898-3. ЧВК 5610255. PMID 28939808.
  6. ^ а б «Ген Entrez: C1QTNF5 C1q и белок 5, связанный с фактором некроза опухоли».
  7. ^ а б c d е Tu X, Palczewski K (декабрь 2012 г.). «Кристаллическая структура глобулярного домена C1QTNF5: последствия для позднего начала дегенерации желтого пятна сетчатки». Журнал структурной биологии. 180 (3): 439–46. Дои:10.1016 / j.jsb.2012.07.011. ЧВК 3496058. PMID 22892318.
  8. ^ а б c Стэнтон С.М., Борооа С., Дрейк С., Марш Дж. А., Кэмпбелл С., Леннон А., Соарес, округ Колумбия, Валлаб Н. А., Сахни Дж., Сидесиян А. В., Диллон Б., Витарт В., Якобсон С. Г., Райт А. Ф., Хейворд С. (сентябрь 2017 г.). «Новые патогенные мутации в C1QTNF5 поддерживают доминантно-негативный механизм заболевания при поздней дегенерации сетчатки». Научные отчеты. 7 (1): 12147. Дои:10.1038 / s41598-017-11898-3. ЧВК 5610255. PMID 28939808.
  9. ^ а б Hayward C, Shu X, Cideciyan AV, Lennon A, Barran P, Zareparsi S, Sawyer L, Hendry G, Dhillon B, Milam AH, Luthert PJ, Swaroop A, Hastie ND, Jacobson SG, Wright AF (октябрь 2003 г.). «Мутация в гене короткоцепочечного коллагена, CTRP5, приводит к образованию внеклеточных отложений при поздней дегенерации сетчатки: генетическая модель возрастной дегенерации желтого пятна». Молекулярная генетика человека. 12 (20): 2657–67. Дои:10.1093 / hmg / ddg289. PMID 12944416.
  10. ^ Шапиро Л., Шерер ЧП (март 1998 г.). «Кристаллическая структура белка семейства комплемента-1q предполагает эволюционную связь с фактором некроза опухоли». Текущая биология. 8 (6): 335–8. Дои:10.1016 / S0960-9822 (98) 70133-2. PMID 9512423. S2CID 14287212.
  11. ^ Шу X, Туллох Б., Леннон А., Влахантони Д., Чжоу Х, Хейворд С., Райт А.Ф. (май 2006 г.). «Механизмы заболевания при поздней дегенерации желтого пятна сетчатки, связанной с мутацией в C1QTNF5». Молекулярная генетика человека. 15 (10): 1680–9. Дои:10.1093 / hmg / ddl091. PMID 16600989.
  12. ^ Мандал М.Н., Васиредди В., Редди Г.Б., Ван X, Морой С.Е., Паттнаик Б.Р., Хьюз Б.А., Хекенливли-младший, Хичкок П.Ф., Яблонски М.М., Айягари Р. (декабрь 2006 г.) «CTRP5 представляет собой ассоциированный с мембраной и секреторный белок в RPE и цилиарном теле, и мутация S163R CTRP5 нарушает его секрецию». Исследовательская офтальмология и визуализация. 47 (12): 5505–13. Дои:10.1167 / iovs.06-0312. PMID 17122142.
  13. ^ Chavali VR, Khan NW, Cukras CA, Bartsch DU, Jablonski MM, Ayyagari R (май 2011 г.). "Модель мыши с нокаутом мутации S163R гена CTRP5 для позднего начала дегенерации сетчатки". Молекулярная генетика человека. 20 (10): 2000–14. Дои:10.1093 / hmg / ddr080. ЧВК 3080610. PMID 21349921.
  14. ^ а б Динкулеску А., Мин С.Х., Дайка FM, Дэн В.Т., Ступай Р.М., Чиодо В., Смит В.К., Хаусвирт В.В. (октябрь 2015 г.) «Патологические эффекты экспрессии мутанта C1QTNF5 (S163R) в пигментном эпителии сетчатки мышей». Исследовательская офтальмология и визуализация. 56 (11): 6971–80. Дои:10.1167 / iovs.15-17166. ЧВК 4627469. PMID 26513502.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка