WikiDer > CPSF6

CPSF6
CPSF6
Белок CPSF6 PDB 3P5T.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыCPSF6, CFIM, CFIM68, HPBRII-4, HPBRII-7, специфический фактор расщепления и полиаденилирования 6, CFIM72
Внешние идентификаторыOMIM: 604979 MGI: 1913948 ГомолоГен: 134126 Генные карты: CPSF6
Расположение гена (человек)
Хромосома 12 (человек)
Chr.Хромосома 12 (человек)[1]
Хромосома 12 (человек)
Геномное расположение CPSF6
Геномное расположение CPSF6
Группа12q15Начните69,239,569 бп[1]
Конец69,274,358 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE CPSF6 202469 s в формате fs.png

PBB GE CPSF6 202470 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001300947
NM_007007

NM_001013391
NM_001310609

RefSeq (белок)

NP_001287876
NP_008938

NP_001013409
NP_001297538

Расположение (UCSC)Chr 12: 69,24 - 69,27 МбChr 10: 117.34 - 117.38 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Субъединица 6 фактора специфичности расщепления и полиаденилирования это белок что у людей кодируется CPSF6 ген.[5][6][7]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой одну субъединицу фактора расщепления, необходимого для расщепления 3'-РНК и процессинга полиаденилирования. Взаимодействие белка с РНК является одной из самых ранних стадий сборки 3'-концевого процессингового комплекса и способствует привлечению других факторов процессинга. Комплекс фактора расщепления состоит из четырех полипептидов. Этот ген кодирует субъединицу 68 кДа. Он имеет доменную организацию, напоминающую сплайсосомные белки.[7]

Взаимодействия

CPSF6 показал себя взаимодействовать с WWP1[8] и PLSCR1.[8]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000111605 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000055531 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Rüegsegger U, Blank D, Keller W (январь 1998 г.). «Фактор расщепления пре-мРНК человека Im связан со сплайсосомными белками SR и может быть восстановлен in vitro из рекомбинантных субъединиц». Молекулярная клетка. 1 (2): 243–53. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80025-8. PMID 9659921.
  6. ^ Cardinale S, Cisterna B, Bonetti P, Aringhieri C, Biggiogera M, Barabino SM (апрель 2007 г.). «Субъядерная локализация и динамика субъединицы 68 кДа фактора расщепления 3 'конца пре-мРНК фактора I расщепления фактора I». Молекулярная биология клетки. 18 (4): 1282–92. Дои:10.1091 / mbc.E06-09-0846. ЧВК 1838998. PMID 17267687.
  7. ^ а б «Ген Entrez: фактор, специфичный для расщепления CPSF6 и полиаденилирования 6, 68 кДа».
  8. ^ а б Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н. и др. (Октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

внешняя ссылка

дальнейшее чтение