WikiDer > Конститутивный гетерохроматин

Constitutive heterochromatin
C-бэндинг женского кариотипа человека, показывающий конститутивный гетерохроматин[1]

Конститутивный гетерохроматин Домены - это участки ДНК, обнаруженные во всех хромосомах эукариот.[2] Большая часть конститутивного гетерохроматина находится в перицентромерных областях хромосом, но также обнаруживается на теломерах и во всех хромосомах.[2] У человека значительно больше конститутивного гетерохроматина обнаруживается на хромосомах 1, 9, 16, 19 и Y.[3] Конститутивный гетерохроматин состоит в основном из большого числа копий. тандем повторяет известные как спутниковые повторы, мини-спутник и микроспутник повторяется, и транспозон повторяется. У человека на эти регионы приходится около 200 МБ или 6,5% от общего количества человеческий геном, но их повторяющийся состав затрудняет секвенирование, поэтому были секвенированы только небольшие участки.

Визуализация конститутивного гетерохроматина возможна с помощью Техника C-бандажа. Более темные участки являются участками конститутивного гетерохроматина.[4] Конститутивный гетерохроматин окрашивается в более темный цвет из-за сильно конденсированной природы ДНК.

Конститутивный гетерохроматин не следует путать с факультативный гетерохроматин, который менее уплотнен, менее стабилен и гораздо менее полиморфный, который не оставляет пятен при использовании техники С-образных полос.

Возможные модели экспрессии генов, обнаруженных в конститутивном гетерохроматине.[5]

Функция

Гетерохроматин против эухроматина

Конститутивный гетерохроматин чаще обнаруживается на периферии ядра, прикрепленного к ядерной мембране. Это концентрирует эухроматический ДНК в центре ядра, где она может активно транскрибироваться. Считается, что во время митоза конститутивный гетерохроматин необходим для правильной сегрегации сестринских хроматид и функции центромеры.[6] Последовательности повторов, обнаруженные в перицентромерах, не сохраняются у многих видов и больше зависят от эпигенетический модификации для регуляции, тогда как теломеры демонстрируют более консервативные последовательности.[2]

Считалось, что конститутивный гетерохроматин относительно лишен генов, но исследователи обнаружили более 450 генов в гетерохроматической ДНК Drosophila melanogaster.[5] Эти области сильно конденсированы и эпигенетически модифицированы для предотвращения транскрипции. Для того чтобы гены транскрибировались, они должны иметь механизм, позволяющий преодолеть молчание, которое происходит в остальной части гетерохроматина. Существует много предложенных моделей того, как экспрессируются гены в этих регионах, включая модели изоляции, отрицания, интеграции, эксплуатации и ограничения TE.[требуется разъяснение]

Когда гены расположены рядом с областью конститутивного гетерохроматина, их транскрипция обычно подавляется. Это известно как позиционно-эффектное разнообразие и может привести к мозаичный фенотип.

Репликация и эпигенетика

Общая модель дупликации гетерохроматина во время деления клетки

Конститутивный гетерохроматин реплицируется поздно в S фаза клеточного цикла и не участвует в мейотической рекомбинации.

Модификации гистонов являются одним из основных способов конденсации конститутивного гетерохроматина в клетке.[7] Три наиболее распространенных модификации конститутивного гетерохроматина: гипоацетилирование гистонов, метилирование гистона H3-Lys9 (H3K9) и метилирование цитозина. Эти модификации также встречаются в других типах ДНК, но гораздо реже. Метилирование цитозина является наиболее распространенным типом, хотя не у всех эукариот. У людей наблюдается повышенное метилирование центромер и теломер, которые состоят из конститутивного гетерохроматина. Эти модификации могут сохраняться как в митозе, так и в мейозе, и наследственный.

SUV39H1 это гистон-метилтрансфераза который метилирует H3K9, обеспечивая сайт связывания для гетерохроматиновый белок 1 (HP1). HP1 участвует в процессе конденсации хроматина, что делает ДНК недоступной для транскрипции.[8][9]

Болезни

Генетические нарушения, возникающие в результате мутаций с участием конститутивного гетерохроматина, имеют тенденцию влиять на дифференцировку клеток и наследуются по аутосомно-рецессивному типу.[6] Заболевания включают Синдром Робертса и Синдром МКФ.

Некоторые виды рака связаны с аномалиями конститутивного гетерохроматина и белков, участвующих в его формировании и поддержании. Рак молочной железы связано с уменьшением Альфа-белок HP1, пока неходжкинской лимфомы связано с гипометилированием генома и особенно сателлитных областей.[нужна цитата]

Рекомендации

  1. ^ "C-Banding". web.udl.es. Получено 2015-12-02.
  2. ^ а б c Саксук, Нехме; Симбок, Элизабет; Дежарден, Жером (15 января 2015 г.). «Формирование конститутивного гетерохроматина и транскрипция у млекопитающих». Эпигенетика и хроматин. 8: 3. Дои:10.1186/1756-8935-8-3. ISSN 1756-8935. ЧВК 4363358. PMID 25788984.
  3. ^ Т. Страчан и А. Рид (2004). Молекулярная генетика человека 3. Издательство Гарленд. стр.256–295. ISBN 978-0-81534182-6.
  4. ^ Angell, Roslyn R .; Джейкобс, Патрисия А. (1975-12-01). «Боковая асимметрия конститутивного гетерохроматина человека». Хромосома. 51 (4): 301–310. Дои:10.1007 / BF00326317. ISSN 0009-5915.
  5. ^ а б Yasuhara, Jiro C .; Вакимото, Барбара Т. (01.06.2006). «Оксюморон больше нет: расширяющийся мир гетерохроматических генов». Тенденции в генетике. 22 (6): 330–338. Дои:10.1016 / j.tig.2006.04.008. PMID 16690158.
  6. ^ а б Мари-Женевьева Маттеи и Джудит Лучани. «Гетерохроматин, от хромосомы к белку». Атлас генетики и цитогенетики в онкологии и гематологии. Архивировано из оригинал 27 октября 2015 г.. Получено 9 ноября 2015.
  7. ^ Ричардс, Эрик Дж .; Элгин, Сара С. Р. (2002). «Эпигенетические коды для образования и молчания гетерохроматина». Клетка. 108 (4): 489–500. Дои:10.1016 / S0092-8674 (02) 00644-X. ISSN 0092-8674. PMID 11909520.
  8. ^ Бартова, Ева; Крейчи, Яна; Харничарова, Андреа; Галиова, Габриэла; Козубек, Станислав (01.08.2008). «Модификации гистонов и ядерная архитектура: обзор». Журнал гистохимии и цитохимии. 56 (8): 711–721. Дои:10.1369 / jhc.2008.951251. ISSN 0022-1554. ЧВК 2443610. PMID 18474937.
  9. ^ Ломберк, Гвен; Валрат, Лори; Уррутия, Рауль (01.01.2006). «Семейство гетерохроматиновых протеинов 1». Геномная биология. 7 (7): 228. Дои:10.1186 / gb-2006-7-7-228. ISSN 1465-6906. ЧВК 1779566. PMID 17224041.