WikiDer > Элемент стимуляции сдвига кадра коронавируса
| Элемент стимуляции сдвига кадра коронавируса | |
|---|---|
 Предсказанный вторичная структура и сохранение последовательности Corona_FSE | |
| Идентификаторы | |
| Символ | Corona_FSE |
| Рфам | RF00507 |
| Прочие данные | |
| РНК тип | Снг; элемент framehift |
| Домен (ы) | Вирусы |
| ТАК | ТАК: 0000233 |
| PDB структуры | PDBe |
В молекулярная биология, то коронавирус сдвиг кадров элемент стимуляции это консервированный стебель-петля из РНК нашел в коронавирусы что может продвигать рибосомальный сдвиг рамки. Такие молекулы РНК взаимодействуют с регион нижнего течения сформировать псевдоузел структура; область варьируется в зависимости от вируса, но известно, что образование псевдоузлов стимулирует сдвиг кадров. В классической ситуации последовательность 32 нуклеотиды после стержня дополняет часть петли. Однако у других коронавирусов другая структура петля-стебель примерно на 150 нуклеотидов ниже по течению может взаимодействовать с членами этого семейства с образованием целовать стебли-петли и стимулировать смену кадров.[1]
Другие семейства РНК, идентифицированные в коронавирусе, включают SL-III цис-действующий элемент репликации (CRE), то коронавирусный 3 'мотив, похожий на стебель-петлю II (s2m), то сигнал упаковки коронавируса и псевдоузел коронавируса 3 ′ UTR.
Во время синтеза белка быстро меняющиеся условия в клетке могут вызывать рибосомная пауза. У коронавирусов это может повлиять на скорость роста и вызвать отказ от трансляции. Это освобождает рибосому от мРНК, и неполный полипептид становится мишенью для разрушения.[2]
Смотрите также
- Трансляционный сдвиг кадров
- Скользкая последовательность
- Коронавирус 5 'UTR
- Коронавирус 3 'UTR
- Псевдоузел Coronavirus 3 ′ UTR
- Мотив, подобный 3'-стеблю-петле II коронавируса (s2m)
- Сигнал упаковки коронавируса
Рекомендации
- ^ Баранов П.В., Хендерсон С.М., Андерсон С.Б., Гестеланд РФ, Аткинс Дж. Ф., Ховард М. Т. (февраль 2005 г.). «Запрограммированный сдвиг рамки рибосом при декодировании генома SARS-CoV». Вирусология. 332 (2): 498–510. Дои:10.1016 / j.virol.2004.11.038. PMID 15680415.
- ^ Buchan, J. R .; Стэнсфилд, И. (2007). «Остановка линии по производству клеток: ответы на паузу в рибосомах во время трансляции». Биологическая ячейка. 99 (9): 475–487. Дои:10.1042 / BC20070037.
внешняя ссылка
 | Этот молекулярный или же клеточная биология статья - это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |