WikiDer > DDEF2

DDEF2
Как можно скорее2
Белок DDEF2 PDB 1dcq.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыКак можно скорее2, AMAP2, CENTB3, DDEF2, PAG3, PAP, Pap-alpha, SHAG1, ArfGAP с доменом SH3, анкириновым повтором и доменом PH 2
Внешние идентификаторыOMIM: 603817 MGI: 2685438 ГомолоГен: 2888 Генные карты: Как можно скорее2
Расположение гена (человек)
Хромосома 2 (человек)
Chr.Хромосома 2 (человек)[1]
Хромосома 2 (человек)
Геномное расположение ASAP2
Геномное расположение ASAP2
Группа2п25.1 | 2п24Начните9,206,765 бп[1]
Конец9,405,683 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE DDEF2 206414 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001135191
NM_003887

NM_001004364
NM_001098168
NM_001135192

RefSeq (белок)

NP_001128663
NP_003878

NP_001004364
NP_001091637
NP_001128664

Расположение (UCSC)Chr 2: 9.21 - 9.41 МбChr 12: 20.99 - 21.27 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Arf-GAP с доменом SH3, повтором ANK и белком 2, содержащим домен PH это белок что у людей кодируется Как можно скорее2 ген.[5][6][7]

Этот ген кодирует мультидоменный белок, содержащий N-концевую альфа-спиральную область с мотивом спиральной спирали, за которым следует домен гомологии плекстрина (PH), домен Arf-GAP, область гомологии анкирина, богатая пролином область и С-концевой домен гомологии Src 3 (SH3). Белок локализуется в аппарате Гольджи и на плазматической мембране, где он совместно локализуется с протеинтирозинкиназой 2-бета (PYK2). Кодируемый белок образует стабильный комплекс с PYK2 in vivo. Это взаимодействие, по-видимому, опосредуется связыванием его домена SH3 с С-концевым богатым пролином доменом PYK2. Кодируемый белок фосфорилируется тирозином активированным PYK2. In vitro он показывает сильную активность GTPase-активирующего белка (GAP) в отношении малых GTPases ADP-фактора рибозилирования (ARF) 1 и ARF5 и слабую активность в отношении ARF6. Кодируемый белок, как полагают, функционирует как ARF GAP, который контролирует ARF-опосредованное почкование пузырьков при рекрутировании на мембраны Гольджи. Кроме того, он функционирует как субстрат и нижестоящая мишень для PYK2 и SRC, пути, который может участвовать в регуляции везикулярного транспорта.[7]

Взаимодействия

DDEF2 был показан взаимодействовать с PTK2B.[8]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000151693 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000052632 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Андреев Дж., Саймон Дж. П., Сабатини Д. Д., Кам Дж., Пахарь Дж., Рандаццо П. А., Шлессингер Дж. (Март 1999 г.). «Идентификация нового белка-мишени Pyk2 с активностью Arf-GAP». Mol Cell Biol. 19 (3): 2338–50. Дои:10.1128 / MCB.19.3.2338. ЧВК 84026. PMID 10022920.
  6. ^ Исикава К., Нагасе Т., Накадзима Д., Секи Н., Охира М., Миядзима Н., Танака А., Котани Н., Номура Н., Охара О. (февраль 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. VIII. 78 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 4 (5): 307–13. Дои:10.1093 / днарес / 4.5.307. PMID 9455477.
  7. ^ а б «Ген Entrez: фактор 2, усиливающий развитие и дифференцировку DDEF2».
  8. ^ Андреев, Дж; Саймон Дж. П.; Sabatini D D; Кам Дж; Пахарь G; Рандаццо П. А; Шлессингер Дж. (Март 1999 г.). «Идентификация нового белка-мишени Pyk2 с активностью Arf-GAP». Мол. Клетка. Биол. 19 (3): 2338–50. Дои:10.1128 / MCB.19.3.2338. ISSN 0270-7306. ЧВК 84026. PMID 10022920.

дальнейшее чтение