WikiDer > ELOC

ELOC
ELOC
Белок TCEB1 PDB 1lm8.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыELOC, SIII, eloC, TCEB1, субъединица 1 фактора элонгации транскрипции B, элонгин C
Внешние идентификаторыOMIM: 600788 MGI: 1915173 ГомолоГен: 38083 Генные карты: ELOC
Расположение гена (человек)
Хромосома 8 (человек)
Chr.Хромосома 8 (человек)[1]
Хромосома 8 (человек)
Геномное местоположение для ELOC
Геномное местоположение для ELOC
Группа8q21.11Начинать73,939,169 бп[1]
Конец73,972,287 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE TCEB1 202824 s at fs.png

PBB GE TCEB1 202823 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001310470
NM_026456

RefSeq (белок)

NP_001297399
NP_080732

Расположение (UCSC)Chr 8: 73.94 - 73.97 МбChr 1: 16.64 - 16.66 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Полипептид 1 фактора элонгации транскрипции это белок что у людей кодируется TCEB1 ген.[5][6]

Функция

Этот ген кодирует белок элонгин C, который является субъединицей комплекса фактора транскрипции B (SIII). Комплекс SIII состоит из элонгинов A / A2, B и C. Он активирует элонгацию с помощью РНК-полимеразы II, подавляя временную паузу полимеразы во многих сайтах внутри единиц транскрипции. Элонгин A функционирует как транскрипционно активный компонент комплекса SIII, тогда как элонгины B и C являются регуляторными субъединицами. Элонгин А2 специфически экспрессируется в семенниках и способен образовывать стабильный комплекс с элонгинами В и С. Белок-супрессор опухоли фон Гиппеля-Линдау связывается с элонгинами В и С и тем самым ингибирует элонгацию транскрипции.[7]

Взаимодействия

TCEB1 был показан взаимодействовать с:

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000154582 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000079658 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Гаррет К.П., Хак Д., Конавей Р.К., Конавей Дж. У. (февраль 1995 г.). «КДНК человека, кодирующая малую субъединицу фактора транскрипции РНК-полимеразы II SIII». Ген. 150 (2): 413–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90467-7. PMID 7821821.
  6. ^ Дуан Д.Р., Пауза А., Берджесс WH, Асо Т., Чен Д.Й., Гарретт К.П., Конавей Р.С., Конавей Д.В., Лайнхан В.М., Клауснер Р.Д. (октябрь 1995 г.). «Ингибирование элонгации транскрипции белком-супрессором опухоли VHL». Наука. 269 (5229): 1402–6. Дои:10.1126 / science.7660122. PMID 7660122. S2CID 22334719.
  7. ^ «Ген Entrez: фактор элонгации транскрипции TCEB1 (SIII), полипептид 1 (15 кДа, элонгин C)».
  8. ^ Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
  9. ^ а б Ohh M, Takagi Y, Aso T., Stebbins CE, Pavletich NP, Zbar B, Conaway RC, Conaway JW, Kaelin WG (декабрь 1999 г.). «Синтетические пептиды определяют критические контакты между элонгином C, элонгином B и белком фон Хиппеля-Линдау». J. Clin. Вкладывать деньги. 104 (11): 1583–91. Дои:10.1172 / JCI8161. ЧВК 481054. PMID 10587522.
  10. ^ Крумм А., Гроудин М. (сентябрь 1995 г.). «Подавление опухоли и удлинение транскрипции: ужасные последствия смены партнеров». Наука. 269 (5229): 1400–1. Дои:10.1126 / science.7660121. PMID 7660121. S2CID 39758696.
  11. ^ а б Li Z, Na X, Wang D, Schoen SR, Messing EM, Wu G (февраль 2002 г.). «Убиквитинирование нового деубиквитинирующего фермента требует прямого связывания с опухолевым супрессорным белком фон Хиппеля-Линдау». J. Biol. Chem. 277 (7): 4656–62. Дои:10.1074 / jbc.M108269200. PMID 11739384.
  12. ^ Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., Макбрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3: 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК 1847948. PMID 17353931.
  13. ^ Цучия Х, Иседа Т, Хино О (июль 1996 г.). «Идентификация связывания нового белка (VBP-1) с продуктом гена-супрессора опухоли фон Хиппеля-Линдау (VHL)». Рак Res. 56 (13): 2881–5. PMID 8674032.
  14. ^ Мин Дж. Х., Ян Х., Иван М., Гертлер Ф., Келин В. Г., Павлетич Н. П. (июнь 2002 г.). «Структура комплекса HIF-1alpha -pVHL: узнавание гидроксипролина в передаче сигналов». Наука. 296 (5574): 1886–9. Дои:10.1126 / science.1073440. PMID 12004076. S2CID 19641938.
  15. ^ Хакер К.Е., Ли СМ, ​​Ратмелл В.К. (2008). Чжан Б. (ред.). «Мутации VHL типа 2B сохраняют сложную форму и функцию VBC». PLOS ONE. 3 (11): e3801. Дои:10.1371 / journal.pone.0003801. ЧВК 2583047. PMID 19030229.
  16. ^ Kim BY, Kim H, Cho EJ, Youn HD (февраль 2008 г.). «Nur77 активирует HIF-альфа, ингибируя pVHL-опосредованную деградацию». Exp. Мол. Med. 40 (1): 71–83. Дои:10.3858 / emm.2008.40.1.71. ЧВК 2679322. PMID 18305400.

дальнейшее чтение