WikiDer > EPS15

EPS15
EPS15
Белок EPS15 PDB 1c07.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыEPS15, AF-1P, AF1P, MLLT5, субстрат пути рецептора эпидермального фактора роста 15
Внешние идентификаторыOMIM: 600051 MGI: 104583 ГомолоГен: 128359 Генные карты: EPS15
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человек)[1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное местоположение для EPS15
Геномное местоположение для EPS15
Группа1п32.3Начинать51,354,263 бп[1]
Конец51,519,266 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE EPS15 217887 s на fs.png

PBB GE EPS15 217886 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001159969
NM_001981

NM_001159964
NM_007943

RefSeq (белок)

NP_001153441
NP_001972

NP_001153436
NP_031969

Расположение (UCSC)Chr 1: 51.35 - 51.52 МбChr 4: 109,28 - 109,39 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Субстрат рецептора эпидермального фактора роста 15 это белок что у людей кодируется EPS15 ген.[5]

Функция

Этот ген кодирует белок, который является частью пути EGFR. Белок присутствует в ямках, покрытых клатрином, и участвует в рецепторном эндоцитозе EGF. Примечательно, что этот ген перегруппирован с геном HRX / ALL / MLL в острые миелогенные лейкозы. Альтернативные варианты сплайсинга транскрипции этого гена наблюдались, но не были полностью охарактеризованы.[6]

Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при изучении функции EPS15. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Eps15tm1a (КОМП) Wtsi[11][12] был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект мутагенеза с высокой пропускной способностью для создания и распространения животных моделей болезней среди заинтересованных ученых - в Wellcome Trust Sanger Institute.[13][14][15]

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.[9][16] Было проведено 26 испытаний мутант мышей, и наблюдалась одна значительная аномалия: гомозиготный мутантные животные имели пониженную среднюю корпускулярную гемоглобин концентрация.[9]

Взаимодействия

EPS15 показал взаимодействовать с:

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000085832 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028552 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Wong WT, Kraus MH, Carlomagno F, Zelano A, Druck T, Croce CM, Huebner K, Di Fiore PP (июнь 1994 г.). «Ген eps15 человека, кодирующий субстрат тирозинкиназы, является консервативным в процессе эволюции и отображается на 1p31-p32». Онкоген. 9 (6): 1591–7. PMID 8183552.
  6. ^ «Ген Entrez: субстрат 15 пути рецептора эпидермального фактора роста EPS15».
  7. ^ "Сальмонелла данные о заражении для Eps15 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  8. ^ "Citrobacter данные о заражении для Eps15 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  9. ^ а б c Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88 (S248). Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x.
  10. ^ Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
  11. ^ «Международный консорциум нокаут-мышей».
  12. ^ "Информатика генома мыши".
  13. ^ Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт АФ, Брэдли А (2011). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–342. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК 3572410. PMID 21677750.
  14. ^ Долгин Е. (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID 21677718.
  15. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID 17218247.
  16. ^ ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геном Биол. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК 3218837. PMID 21722353.
  17. ^ Шумахер К., Кнудсен Б.С., Охучи Т., Ди Фиоре П.П., Глассман Р.Х., Ханафуса Н. (июнь 1995 г.). «Домен SH3 Crk специфически связывается с консервативным мотивом, богатым пролином в Eps15 и Eps15R». J. Biol. Chem. 270 (25): 15341–7. Дои:10.1074 / jbc.270.25.15341. PMID 7797522.
  18. ^ Чен Х., Фре С., Слепнев В.И., Капуа М.Р., Такей К., Батлер М.Х., Ди Фьоре П.П., Де Камилли П. (август 1998 г.). «Эпсин представляет собой белок, связывающий ЕН-домен, участвующий в клатрин-опосредованном эндоцитозе». Природа. 394 (6695): 793–7. Дои:10.1038/29555. PMID 9723620.
  19. ^ Бин А.Дж., Давангер С., Чоу М.Ф., Герхардт Б., Цудзимото С., Чанг И. (май 2000 г.). «Hrs-2 ​​регулирует рецептор-опосредованный эндоцитоз посредством взаимодействия с Eps15». J. Biol. Chem. 275 (20): 15271–8. Дои:10.1074 / jbc.275.20.15271. PMID 10809762.
  20. ^ Бач К.Г., Райборг С., Мехлум А., Стенмарк Н. (апрель 2003 г.). «STAM и Hrs представляют собой субъединицы поливалентного убиквитин-связывающего комплекса на ранних эндосомах». J. Biol. Chem. 278 (14): 12513–21. Дои:10.1074 / jbc.M210843200. PMID 12551915.
  21. ^ Дориа М., Сальчини А.Е., Коломбо Е., Парслоу Т.Г., Пеличчи П.Г., Ди Фьоре П.П. (декабрь 1999 г.). «Основанное на домене гомологии eps15 (EH) взаимодействие между eps15 и hrb связывает молекулярный механизм эндоцитоза с механизмом нуклеоцитозольного транспорта». J. Cell Biol. 147 (7): 1379–84. Дои:10.1083 / jcb.147.7.1379. ЧВК 2174238. PMID 10613896.
  22. ^ Накашима С., Моринака К., Кояма С., Икеда М., Кишида М., Окава К., Ивамацу А., Кишида С., Кикучи А. (июль 1999 г.). «Малый G-белок Ral и его нижележащие молекулы регулируют эндоцитоз EGF и рецепторов инсулина». EMBO J. 18 (13): 3629–42. Дои:10.1093 / emboj / 18.13.3629. ЧВК 1171441. PMID 10393179.

дальнейшее чтение