WikiDer > Белок, связывающий элементы 1 далеко вверх по течению

Far upstream element-binding protein 1
FUBP1
Белок FUBP1 PDB 1j4w.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыFUBP1, FBP, FUBP, hDH V, белок 1, связывающий далеко предшествующий элемент
Внешние идентификаторыOMIM: 603444 MGI: 1196294 ГомолоГен: 48253 Генные карты: FUBP1
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человек)[1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение FUBP1
Геномное расположение FUBP1
Группа1п31.1Начните77,944,055 бп[1]
Конец77,979,110 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE FUBP1 214094 в формате fs.png

PBB GE FUBP1 214093 s в формате fs.png

PBB GE FUBP1 203091 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001303433
NM_003902
NM_001376055
NM_001376056
NM_001376057

RefSeq (белок)

NP_001290362
NP_003893
NP_001362984
NP_001362985
NP_001362986

Расположение (UCSC)Chr 1: 77.94 - 77.98 МбChr 3: 152.21 - 152.24 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Белок, связывающий элементы 1 далеко вверх по течению это белок что у людей кодируется FUBP1 ген.[5][6]

Этот ген кодирует связывающий оцДНК белок, который активирует дальний восходящий элемент (FUSE) c-myc и стимулирует экспрессию c-myc в недифференцированных клетках. Регуляция FUSE с помощью FUBP происходит посредством однонитевого связывания FUBP с некодирующей цепью. Было показано, что этот белок действует как АТФ-зависимая ДНК-геликаза.[6]

Взаимодействия

Было показано, что белок 1, связывающий элементы, находящийся далеко выше по течению, взаимодействовать с участием MAPK14[7] и SMN1.[8]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000162613 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028034 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Дункан Р., Базар Л., Микелотти Дж., Томонага Т., Крутч Х., Авиган М., Левенс Д. (апрель 1994 г.). «Последовательно-специфичный, одноцепочечный связывающий белок активирует расположенный далеко вверх по течению элемент c-myc и определяет новый ДНК-связывающий мотив». Genes Dev. 8 (4): 465–80. Дои:10.1101 / gad.8.4.465. PMID 8125259.
  6. ^ а б «Ген Entrez: белок 1, связывающий далеко вышестоящий элемент (FUSE) FUBP1».
  7. ^ Ким, Мин Чжон; Пак Бом-Джун; Кан Ён-Сун; Ким Хён Джун; Пак Чжэ Хён; Кан Чон У; Ли Сан Вон; Хан Чжон Мин; Ли Хан-Ун; Ким Сонхун (июль 2003 г.). «Подавление FUSE-связывающего белка и c-myc кофактором тРНК-синтетазы p38 требуется для дифференцировки клеток легких». Nat. Genet. Соединенные Штаты. 34 (3): 330–6. Дои:10.1038 / ng1182. ISSN 1061-4036. PMID 12819782.
  8. ^ Уильямс, Б. И .; Гамильтон С. Л.; Саркар Х. К. (март 2000 г.). «Белок выживания двигательных нейронов взаимодействует с трансактиваторным связывающим белком FUSE из мозга плода человека». FEBS Lett. НИДЕРЛАНДЫ. 470 (2): 207–10. Дои:10.1016 / S0014-5793 (00) 01320-X. ISSN 0014-5793. PMID 10734235.

дальнейшее чтение