WikiDer > IFT140 - Википедия
IFT140, Внутрилагеллярный транспорт 140 гомолог, это белок что у людей кодируется IFT140 ген. Продукт гена является основным компонентом комплекса IFT-A, который является незаменимым для ретроградного внутрижладжковый транспорт в пределах первичная ресничка.[5]
Клиническое значение
Мутации в этом гене были связаны со случаями скелетной цилиопатия так называемый синдром Майнцера-Салдино, характеризующийся аномалиями развития скелета, дегенерацией сетчатки и фиброзно-кистозным заболеванием почек, известным как нефронофтиз.[6][7][8] Это также было описано у пациентов с Синдром Jeune[9] и изолированные Врожденный амавроз Леберса при отсутствии других синдромальных признаков.[10]
Модельные организмы
Модельные организмы были использованы в исследовании функции IFT140. Условный нокаутирующая мышь линия называется Ift140tm1a (КОМП) Wtsi был создан на Wellcome Trust Sanger Institute.[11] Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг[12] для определения последствий удаления.[13][14][15][16] Проведены дополнительные проверки: - Углубленное иммунологическое фенотипирование[17]
Мышь, производная от ENU (Cauli) несущие гомозиготные IFT140 аллели (c.2564T> A, p. I855K) генерировались на Детский научно-исследовательский институт Мердока в Мельбурне, Австралия.[9] В Cauli у мыши наблюдалась летальность в середине беременности, экзэнцефалия, расщелина позвоночника, черепно-лицевой дисморфизм, аномалии пальцев, аномалии сердца и дефекты формирования паттерна сомитов.[9] Эктопическая передача сигналов hedgehog была продемонстрирована с помощью totalmount на месте гибридизация в зачатках конечностей и аномальная морфология первичных ресничек внутри зачатков конечностей была продемонстрирована с помощью сканирующей электронной микроскопии.[9]
Пациент с синдромом Майнцера-Салдино, носящий составной гетерозиготный варианты в IFT140 имел индуцированные плюрипотентные стволовые клетки перепрограммирован и CRISPR ген скорректирован перед дифференцировкой обеих линий стволовых клеток в почки органоиды для транскрипционного сравнения.[8] Помимо подтверждения морфологии булавовидной формы первичных ресничек, наблюдаемой в зачатке конечности стебля мышей в регенерированных канальцах нефрона IFT140c.634G> A / c.2176C> G органоиды по сравнению с IFT140WT / c.2176C> GСравнение объемного секвенирования РНК продемонстрировало значительные различия в путях генов, связанных с апикобазальной полярностью, межклеточными соединениями и сборкой аксонемного динеина.[8]
| Характеристика | Фенотип |
|---|---|
| Все данные доступны на сайте.[12][17] | |
| Лейкоциты периферической крови 6 недель | Нормальный |
| Гематология 6 недель | Нормальный |
| Инсулин | Нормальный |
| Гомозиготная жизнеспособность на P14 | Аномальный |
| Рецессивный смертельное исследование | Аномальный |
| Масса тела | Нормальный |
| Неврологический осмотр | Нормальный |
| Сила захвата | Нормальный |
| Дисморфология | Нормальный |
| Косвенная калориметрия | Нормальный |
| Тест толерантности к глюкозе | Нормальный |
| Слуховой ответ ствола мозга | Нормальный |
| DEXA | Нормальный |
| Рентгенография | Нормальный |
| Морфология глаза | Нормальный |
| Клиническая химия | Нормальный |
| Гематология 16 недель | Нормальный |
| Лейкоциты периферической крови 16 недель | Нормальный |
| Вес сердца | Нормальный |
| Сальмонелла инфекционное заболевание | Нормальный |
| Функция цитотоксических Т-клеток | Нормальный |
| Иммунофенотипирование селезенки | Нормальный |
| Иммунофенотипирование мезентериальных лимфатических узлов | Нормальный |
| Иммунофенотипирование костного мозга | Нормальный |
| Состав эпидермального иммунитета | Нормальный |
| Проблема гриппа | Нормальный |
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000187535 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024169 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Степанек, Людек; Пигино, Гайя (2016-05-06). «Дублеты микротрубочек - это двухколейные железные дороги для внутрижладовых транспортных поездов». Наука. 352 (6286): 721–724. Дои:10.1126 / science.aaf4594. ISSN 1095-9203. PMID 27151870. S2CID 206648246.
- ^ Шмидтс М., Фрэнк В., Эйзенбергер Т., Аль-Турки С., Бизе А.А., Энтони Д., Рикс С., Деккер С., Бахманн Н., Лысый М., Винке Т., Тоеншофф Б., Ди Донато Н., Нойханн Т., Хартли Дж. Л., Махер Э. Р., Bogdanović R, Peco-Antić A, Mache C, Hurles ME, Joksić I, Guć-Šćekić M, Dobricic J, Brankovic-Magic M, Bolz HJ, Pazour GJ, Beales PL, Scambler PJ, Saunier S, Mitchison HM, Bergmann C (Май 2013). «Комбинированные подходы NGS выявляют мутации во внутрижладжеллярном транспортном гене IFT140 при скелетных цилиопатиях с ранним прогрессирующим заболеванием почек». Человеческая мутация. 34 (5): 714–24. Дои:10.1002 / humu.22294. ЧВК 4226634. PMID 23418020.
- ^ Перро, Изабель; Сонье, Софи; Ханейн, Сильвен; Филхол, Эмили; Bizet, Albane A .; Коллинз, Фелисити; Салих, Мустафа А. М .; Гербер, Сильви; Дельфин, Натали (2012-05-04). «Синдром Майнцера-Салдино - это цилиопатия, вызванная мутациями IFT140». Американский журнал генетики человека. 90 (5): 864–870. Дои:10.1016 / j.ajhg.2012.03.006. ISSN 1537-6605. ЧВК 3376548. PMID 22503633.
- ^ а б c Forbes, Thomas A .; Howden, Sara E .; Лоулор, Кинан; Фипсон, Белинда; Максимович, Йована; Хейл, Лорна; Уилсон, Шон; Куинлан, Кэтрин; Хо, Глэдис (2018-05-03). «Полученные пациентом ИПСК почечные органоиды демонстрируют функциональное подтверждение цилиопатического почечного фенотипа и выявляют лежащие в основе патогенетические механизмы». Американский журнал генетики человека. 102 (5): 816–831. Дои:10.1016 / j.ajhg.2018.03.014. ISSN 0002-9297. ЧВК 5986969. PMID 29706353.
- ^ а б c d Миллер, Керри А .; Ах-Канн, Кейси Дж .; Благосостояние, Меган Ф .; Tan, Tiong Y .; Папа, Кейт; Каруана, Джорджина; Фрекманн, Мэри-Луиза; Саварирайан, Рави; Бертрам, Джон Ф. (август 2013 г.). «Cauli: линия мышей с мутацией Ift140, которая приводит к цилиопатии скелета, моделирующей синдром Jeune». PLOS Genetics. 9 (8): e1003746. Дои:10.1371 / journal.pgen.1003746. ISSN 1553-7404. ЧВК 3757063. PMID 24009529.
- ^ Билс, Родни К .; Велебер, Ричард Г. (2007). «Коноренальная дисплазия: синдром конусообразного эпифиза, заболевание почек в детстве, пигментный ретинит и аномалия проксимального отдела бедренной кости». Американский журнал медицинской генетики, часть A. 143A (20): 2444–2447. Дои:10.1002 / ajmg.a.31948. ISSN 1552-4833. PMID 17853467. S2CID 32559930.
- ^ Гердин А.К. (2010). «Программа генетики мыши Сэнгера: характеристика мышей с высокой пропускной способностью». Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID 85911512.
- ^ а б «Международный консорциум по фенотипированию мышей».
- ^ Скарнес В.С., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт AF, Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК 3572410. PMID 21677750.
- ^ Долгин Э (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID 21677718.
- ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID 17218247. S2CID 18872015.
- ^ Уайт Дж. К., Гердин А. К., Карп Н. А., Райдер Э., Бульян М., Басселл Дж. Н., Солсбери Дж., Клэр С., Ингем Нью-Джерси, Подрини С., Хоутон Р., Эстабель Дж., Боттомли Дж. Р., Мелвин Д. Дж., Сантер Д., Адамс Н. , Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smyth I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (июль 2013 г.). «Полногеномное поколение и систематическое фенотипирование мышей с нокаутом открывает новые роли для многих генов». Клетка. 154 (2): 452–64. Дои:10.1016 / j.cell.2013.06.022. ЧВК 3717207. PMID 23870131.
- ^ а б «Консорциум иммунофенотипирования инфекций и иммунитета (3i)».
 | Этот белок-связанная статья является заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |