WikiDer > IWS1

IWS1
IWS1
Идентификаторы
ПсевдонимыIWS1, SUPT6H взаимодействующий белок, взаимодействует с SUPT6H, фактор сборки CTD 1
Внешние идентификаторыMGI: 1920723 ГомолоГен: 134421 Генные карты: IWS1
Расположение гена (человек)
Хромосома 2 (человек)
Chr.Хромосома 2 (человек)[1]
Хромосома 2 (человек)
Геномное расположение IWS1
Геномное расположение IWS1
Группа2q14.3Начинать127,436,207 бп[1]
Конец127,526,886 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE IWS1 gnf1h08910 s в формате fs.png

PBB GE IWS1 gnf1h08911 x в формате fs.png

PBB GE IWS1 gnf1h08909 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_017969

NM_173441

RefSeq (белок)

NP_060439

NP_775617

Расположение (UCSC)Chr 2: 127,44 - 127,53 МбChr 18: 32.07 - 32,1 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Гомолог белка IWS1 также известен как взаимодействует с Spt6 (IWS1) - это белок что у людей кодируется IWS1 ген.[5]

IWS1 - это транскрипция коэффициент удлинения. Впервые он был обнаружен во время поиска РНК-полимераза II-связанные факторы удлинения в дрожжи; он напрямую взаимодействует с РНК-полимеразой II (RNAPII) и является фосфорилированный в казеинкиназа II (CKII) сайты.[6]

Гомолог человека, который физически взаимодействует с протеин аргининметилтрансфераза 5 (PRMT5), необходим для выживания клеток.[7] Он также задействует гистон-метилтрансферазу SET2 (белок HYPB, взаимодействующий с Хантингтином, также известный как SETD2) к RNAPII во время элонгации транскрипции и необходим для триметилирования H3K36.[8]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000163166 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024384 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ «Ген Entrez: IWS1 гомолог IWS1 (S. cerevisiae)».
  6. ^ Krogan NJ, Kim M, Ahn SH, Zhong G, Kobor MS, Cagney G, Emili A, Shilatifard A, Buratowski S, Greenblatt JF (октябрь 2002 г.). «Факторы элонгации РНК-полимеразы II Saccharomyces cerevisiae: целенаправленный протеомный подход». Молекулярная и клеточная биология. 22 (20): 6979–92. Дои:10.1128 / MCB.22.20.6979-6992.2002. ЧВК 139818. PMID 12242279.
  7. ^ Лю З., Чжоу З., Чен Г., Бао С. (февраль 2007 г.). «Предполагаемый фактор элонгации транскрипции hIws1 необходим для пролиферации клеток млекопитающих». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 353 (1): 47–53. Дои:10.1016 / j.bbrc.2006.11.133. PMID 17184735.
  8. ^ Йо С.М., Лукас Дж.С., Джонс К.А. (декабрь 2008 г.). «Комплекс Iws1: Spt6: CTD контролирует котранскрипционный биосинтез мРНК и HYPB / Setd2-опосредованное метилирование гистона H3K36». Гены и развитие. 22 (24): 3422–34. Дои:10.1101 / gad.1720008. ЧВК 2607075. PMID 19141475.

дальнейшее чтение