WikiDer > Список самонаводящихся сайтов разрезания эндонуклеаз
Легенда о азотистые основания | |
---|---|
Код | Нуклеотид представлен |
А | Аденин (А) |
C | Цитозин (С) |
грамм | Гуанин (ГРАММ) |
Т | Тимин (Т) |
N | A, C, G или T |
M | А или С |
р | A или G |
W | А или Т |
Y | C или T |
S | C или G |
K | G или T |
ЧАС | A, C или T |
B | C, G или T |
V | A, C или G |
D | A, G или T |
Самонаводящиеся эндонуклеазы представляют собой особый тип рестрикционные ферменты закодировано интроны или же интеины. Они действуют на сотовые ДНК клетки, которая их синтезирует; если быть точным, наоборот аллель из ген которые их кодируют.[1]
- Дальнейшая информация: Самонаводящаяся эндонуклеаза.
Самонаводящиеся эндонуклеазы
В список включены некоторые из наиболее изученных примеров. Были подробно описаны следующие концепции:
- Фермент: Принятое название молекулы согласно международно принятой номенклатуре. Библиографические ссылки. (Дальнейшее чтение: Самонаводящаяся эндонуклеаза § Номенклатура.)
- SF (структурная семья): Любое из установленных семейств для этого типа белков на основе их общих структурные мотивы:
H1
: Семья LAGLIDADG -H2
: Семья ГИЙ-ЙИГ -H3
: Семейство H-N-H -H4
: Семейство коробок His-Cys -H5
: PD- (D / E) xK -H6
: EDxHD. (Дальнейшее чтение: Самонаводящаяся эндонуклеаза § Структурные семейства.) - Код PDB: Код, используемый для определения структуры белка в PDB база данных. Если структура недоступна, UniProt вместо него дается идентификатор.
- Источник: Организм, который естественным образом производит фермент.
- D: Биологический домен источника: A: археи - B: бактерии - E: эукария.
- SCL: Субклеточный геном: хлор: хлоропласт - chrm: хромосомный - мито: митохондриальный - плазмида: другие внехромосомные - фаг: бактериофаг.
- Последовательность распознавания: Последовательность ДНК, распознаваемая ферментом. Фермент специфически связан с этой последовательностью.
- Резать: Участок раскроя и изделия распила. Как последовательность распознавания, так и сайт разреза обычно совпадают, но иногда сайт разреза может находиться на расстоянии нескольких десятков нуклеотидов от сайта узнавания.
Фермент | SF | Код PDB | Источник | D | SCL | Последовательность распознавания | Резать |
---|---|---|---|---|---|---|---|
И-АНИИ[2] | H1 | 1П8К | Aspergillus nidulans | E | мито | 5 'TTGAGGAGGTTTCTCTGTAAATAA 3 'AACTCCTCCAAAGAGACATTTATT | 5 '--- TTGAGGAGGTTTC TCTGTAAATAA --- 3 ' 3 '--- AACTCCTCC AAAGAGACATTTATT --- 5 ' |
I-CeuI[3][4][5][6] | H1 | 2EX5 | Chlamydomonas eugametos | E | хлор | 5 'TAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGA 3 'ATTGATATTGCCAGGATTCCATCGCT | 5 '--- TAACTATAACGGTCCTAA GGTAGCGA --- 3 ' 3 '--- ATTGATATTGCCAG GATTCCATCGCT --- 5 ' |
И-Чуй[7][8] | H1 | Q32001 | Chlamydomonas humicola | E | хлор | 5 'GAAGGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATC 3 'CTTCCAAACCGTGGAGCTACAGCCGAGTAG | 5 '--- GAAGGTTTGGCACCTCG ATGTCGGCTCATC --- 3 ' 3 '--- CTTCCAAACCGTG GAGCTACAGCCGAGTAG --- 5 ' |
I-CpaI[8][9] | H1 | Q39562 | Хламидомонада паллидостигматная | E | хлор | 5 'CGATCCTAAGGTAGCGAAATTCA 3 'GCTAGGATTCCATCGCTTTAAGT | 5 '--- CGATCCTAAGGTAGCGAA ATTCA --- 3 ' 3 '--- GCTAGGATTCCATC GCTTTAAGT --- 5 ' |
I-CpaII[10] | H1 | Q39559 | Хламидомонада паллидостигматная | E | хлор | 5 'CCCGGCTAACTCTGTGCCAG 3 'GGGCCGATTGAGACACGGTC | 5 '--- CCCGGCTAACTC TGTGCCAG --- 3 ' 5 '--- GGGCCGAT TGAGACACGGTC --- 3 ' |
I-CreI[11] | H1 | 1BP7 | Chlamydomonas reinhardtii | E | хлор | 5 'CTGGGTTCAAAACGTCGTGAGACAGTTTGG 3 'GACCCAAGTTTTGCAGCACTCTGTCAAACC | 5 '--- CTGGGTTCAAAACGTCGTGA GACAGTTTGG --- 3 ' 3 '--- GACCCAAGTTTTGCAG CACTCTGTCAAACC --- 5 ' |
I-DmoI | H1 | 1B24 | Desulfurococcus mobilis | А | chrm | 5 'ATGCCTTGCCGGGTAAGTTCCGGCGCGCAT 3 'TACGGAACGGCCCATTCAAGGCCGCGCGTA | 5 '--- ATGCCTTGCCGGGTAA GTTCCGGCGCGCAT --- 3 ' 3 '--- TACGGAACGGCC CATTCAAGGCCGCGCGTA --- 5 ' |
H-DreI[12] | H1 | 1MOW | Гибрид: I-DmoI и I-CreI | АE | 5 'CAAAACGTCGTAAGTTCCGGCGCG 3 'GTTTTGCAGCATTCAAGGCCGCGC | 5 '--- CAAAACGTCGTAA GTTCCGGCGCG --- 3 ' 3 '--- GTTTTGCAG CATTCAAGGCCGCGC --- 5 ' | |
I-HmuI[13][14] | H3 | 1U3E | Bacillus subtilis фаг SP01 | B | фаг | 5 'AGTAATGAGCCTAACGCTCAGCAA 3 'TCATTACTCGGATTGCGAGTCGTT | Никелевая эндонуклеаза: * 3 '--- TCATTACTCGGATTGC GAGTCGTT --- 5 ' |
I-HmuII[14][15] | H3 | Q38137 | Bacillus subtilis фаг SP82 | B | фаг | 5 'AGTAATGAGCCTAACGCTCAACAA 3 'TCATTACTCGGATTGCGAGTTGTT | Никелевая эндонуклеаза: * 3 '--- TCATTACTCGGATTGCGAGTTGTTN35 NNNN --- 5 ' |
I-LlaI[16][17] | H3 | P0A3U1 | Lactococcus lactis | B | chrm | 5 'CACATCCATAACCATATCATTTTT 3 'GTGTAGGTATTGGTATAGTAAAAA | 5 '--- CACATCCATAA CCATATCATTTTT --- 3 ' 3 '--- GTGTAGGTATTGGTATAGTAA AAA --- 5 ' |
I-MsoI | H1 | 1M5X | Мономастикс sp. | E | 5 'CTGGGTTCAAAACGTCGTGAGACAGTTTGG 3 'GACCCAAGTTTTGCAGCACTCTGTCAAACC | 5 '--- CTGGGTTCAAAACGTCGTGA GACAGTTTGG --- 3 ' 3 '--- GACCCAAGTTTTGCAG CACTCTGTCAAACC --- 5 ' | |
PI-PfuI | H1 | 1DQ3 | Pyrococcus furiosus Vc1 | А | 5 'GAAGATGGGAGGAGGGACCGGACTCAACTT 3 'CTTCTACCCTCCTCCCTGGCCTGAGTTGAA | 5 '--- GAAGATGGGAGGAGGG ACCGGACTCAACTT --- 3 ' 3 '--- CTTCTACCCTCC TCCCTGGCCTGAGTTGAA --- 5 ' | |
ПИ-ПкоИИ | H1 | 2CW7 | Pyrococcus kodakarensis БАД-918 | А | 5 'CAGTACTACGGTTAC 3 'GTCATGATGCCAATG | 5 '--- CAGTACTACG GTTAC --- 3 ' 3 '--- GTCATG ATGCCAATG --- 5 ' | |
I-PorI[18][19] | H3 | Pyrobaculum organotrophum | А | chrm | 5 'GCGAGCCCGTAAGGGTGTGTACGGG 3 'CGCTCGGGCATTCCCACACATGCCC | 5 '--- GCGAGCCCGTAAGGGT GTGTACGGG --- 3 ' 3 '--- CGCTCGGGCATT CCCACACATGCCC --- 5 ' | |
I-PpoI | H4 | 1EVX | Physarum polycephalum | E | плазмида | 5 'TAACTATGACTCTCTTAAGGTAGCCAAAT 3 'ATTGATACTGAGAGAATTCCATCGGTTTA | 5 '--- TAACTATGACTCTCTTAA GGTAGCCAAAT --- 3 ' 3 '--- ATTGATACTGAGAG AATTCCATCGGTTTA --- 5 ' |
PI-PspI | H1 | Q51334 | Пирококк sp. | А | chrm | 5 'TGGCAAACAGCTATTATGGGTATTATGGGT 3 'ACCGTTTGTCGATAATACCCATAATACCCA | 5 '--- TGGCAAACAGCTATTAT GGGTATTATGGGT --- 3 ' 3 '--- ACCGTTTGTCGAT AATACCCATAATACCCA --- 5 ' |
I-ScaI[20][21] | H1 | P03873 | Saccharomyces capensis | E | мито | 5 'TGTCACATTGAGGTGCACTAGTTATTAC 3 'ACAGTGTAACTCCACGTGATCAATAATG | 5 '--- TGTCACATTGAGGTGCACT АГТТАТТАК --- 3 ' 3 '--- ACAGTGTAACTCCAC GTGATCAATAATG --- 5 ' |
I-SceI[4][5] | H1 | 1R7M | Saccharomyces cerevisiae | E | мито | 5 'AGTTACGCTAGGGATAACAGGGTAATATAG 3 'TCAATGCGATCCCTATTGTCCCATTATATC | 5 '--- AGTTACGCTAGGGATAA CAGGGTAATATAG --- 3 ' 3 '--- TCAATGCGATCCC TATTGTCCCATTATATC --- 5 ' |
PI-SceI[22][23] | H1 | 1VDE | Saccharomyces cerevisiae | E | 5 'ATCTATGTCGGGTGCGGAGAAAGAGGTAATGAAATGGCA 3 'TAGATACAGCCCACGCCTCTTTCTCCATTACTTTACCGT | 5 '--- ATCTATGTCGGGTGC GGAGAAAGAGGTAATGAAATGGCA --- 3 ' 3 '--- TAGATACAGCC CACGCCTCTTTCTCCATTACTTTACCGT --- 5 ' | |
I-Сцена II[24][25][26] | H1 | Saccharomyces cerevisiae | E | мито | 5 'TTTTGATTCTTTGGTCACCCTGAAGTATA 3 'AAAACTAAGAAACCAGTGGGACTTCATAT | 5 '--- TTTTGATTCTTTGGTCACCC ТГААГТАТА --- 3 ' 3 '--- AAAACTAAGAAACCAG TGGGACTTCATAT --- 5 ' | |
I-SecIII[24][27][28] | H1 | Saccharomyces cerevisiae | E | мито | 5 'ATTGGAGGTTTTGGTAACTATTTATTACC 3 'TAACCTCCAAAACCATTGATAAATAATGG | 5 '--- ATTGGAGGTTTTGGTAAC TATTTATTACC --- 3 ' 3 '--- TAACCTCCAAAACC ATTGATAAATAATGG --- 5 ' | |
I-SceIV[24][29][30] | H1 | Saccharomyces cerevisiae | E | мито | 5 'TCTTTTCTCTTGATTAGCCCTAATCTACG 3 'AGAAAAGAGAACTAATCGGGATTAGATGC | 5 '--- TCTTTTCTCTTGATTA GCCCTAATCTACG --- 3 ' 3 '--- AGAAAAGAGAAC TAATCGGGATTAGATGC --- 5 ' | |
I-SceV[24][31] | H3 | Saccharomyces cerevisiae | E | мито | 5 'AATAATTTTCTTCTTAGTAATGCC 3 'TTATTAAAAGAAGAATCATTACGG | 5 '--- AATAATTTTCT TCTTAGTAATGCC --- 3 ' 3 '--- TTATTAAAAGAAGAATCATTA CGG --- 5 ' | |
I-SceVI[24][32] | H3 | Saccharomyces cerevisiae | E | мито | 5 'GTTATTTAATGTTTTAGTAGTTGG 3 'CAATAAATTACAAAATCATCAACC | 5 '--- GTTATTTAATG TTTTAGTAGTTGG --- 3 ' 3 '--- CAATAAATTACAAAATCATCA АКК --- 5 ' | |
I-сценаVII[20] | H1 | Saccharomyces cerevisiae | E | мито | 5 'TGTCACATTGAGGTGCACTAGTTATTAC 3 'ACAGTGTAACTCCACGTGATCAATAATG | Неизвестный ** | |
I-Ssp6803I | H5 | 2OST | Synechocystis sp. PCC 6803 | B | 5 'GTCGGGCTCATAACCCGAA 3 'CAGCCCGAGTATTGGGCTT | 5 '--- GTCGGGCT CATAACCCGAA --- 3 ' 3 '--- CAGCCCGAGTA TTGGGCTT --- 5 ' | |
I-TevI[33][34][35] | H2 | 1I3J | кишечная палочка фаг Т4 | B | фаг | 5 'AGTGGTATCAACGCTCAGTAGATG 3 'TCACCATAGT TGCGAGTCATCTAC | 5 '--- AGTGGTATCAAC GCTCAGTAGATG --- 3 ' 3 '--- TCACCATAGT TGCGAGTCATCTAC --- 5 ' |
I-TevII[33][36] | H2 | кишечная палочка фаг Т4 | B | фаг | 5 'GCTTATGAGTATGAAGTGAACACGTTATTC 3 'CGAATACTCATACTTCACTTGTGCAATAAG | 5 '--- GCTTATGAGTATGAAGTGAACACGT TATTC --- 3 ' 3 '--- CGAATACTCATACTTCACTTGTG CAATAAG --- 5 ' | |
I-TevIII[37] | H3 | кишечная палочка фаг RB3 | B | фаг | 5 'TATGTATCTTTTGCGTGTACCTTTAACTTC 3 'ATACATAGAAAACGCACATGGAAATTGAAG | 5 '--- т ATGTATCTTTTGCGTGTACCTTTAACTTC --- 3 ' 3 '--- В ACATAGAAAACGCACATGGAAATTGAAG --- 5 ' | |
PI-TliI[38][39] | H1 | Термококк литоралис | А | chrm | 5 'TAYGCNGAYACNGACGGYTTYT 3 'ATRCGNCTRTGNCTGCCTAARA | 5 '--- TAYGCNGAYACNGACGG YTTYT --- 3 ' 3 '--- ATRCGNCTRTGNC TGCCTAARA --- 5 ' | |
PI-TliII[22][39][40] | H1 | Термококк литоралис | А | chrm | 5 'AAATTGCTTGCAAACAGCTATTACGGCTAT 3 'TTTAACGAACGTTTGTCGATAATGCCGATA | Неизвестный ** | |
I-Tsp061I | H1 | 2DCH | Термопротеус sp. IC-061 | А | 5 'CTTCAGTATGCCCCGAAAC 3 'GAAGTCATACGGGGCTTTG | 5 '--- CTTCAGTAT GCCCCGAAAC --- 3 ' 3 '--- GAAGT CATACGGGGCTTTG --- 5 ' | |
I-Vdi141I | H1 | 3Э54 | Vulcanisaeta Distributa IC-141 | А | 5 'CCTGACTCTCTTAAGGTAGCCAAA 3 'GGACTGAGAGAATTCCATCGGTTT | 5 '--- CCTGACTCTCTTAA GGTAGCCAAA --- 3 ' 3 '--- GGACTGAG AGAATTCCATCGGTTT --- 5 ' |
*: Никелевая эндонуклеаза: Эти ферменты разрезают только одну цепь ДНК, не затрагивая другую.
**: Неизвестный участок резки: Исследователи еще не смогли определить точное место разрезания этих ферментов.
Смотрите также
- Список сайтов разрезания рестрикционных ферментов.
- Самонаводящаяся эндонуклеаза.
- Фермент рестрикции.
- Интроны и интеины.
- Внутригеномный конфликт: Гены самонаводящейся эндонуклеазы.
- Самонаводящаяся эндонуклеаза I-CreI.
- Изошизомер.
- Подробные статьи о некоторых рестрикционных ферментах: EcoRI, HindIII, BglII.
Источники информации
Базы данных и списки рестрикционных ферментов:
- Очень обширная база данных рестрикционных ферментов, поддерживаемая New England Biolabs ©. Он включает в себя всю биологическую, структурную, кинетическую и коммерческую информацию о тысячах ферментов. Также включает соответствующую литературу по каждой молекуле: Робертс Р.Дж., Винце Т., Посфаи Дж., Маселис Д. "REBASE". Получено 2010-01-07.
База данных рестрикционных ферментов.
- База данных интеинов, размещенная в New England Biolabs ©. Perler FB. "InBase". Архивировано из оригинал на 2010-08-02. Получено 2010-02-05.
База данных и реестр Intein
.[41] - Подробная информация для биохимических экспериментов: «Поиск ферментов». Архивировано из оригинал на 2010-01-08. Получено 2010-01-07.
New England Biolabs © средство поиска ферментов.
- Алфавитный список ферментов и сайтов их рестрикции: «Веб-страница GenScript © Restriction Enzyme». Архивировано из оригинал на 2009-07-04. Получено 2010-01-07.
- Общая информация о сайтах рестрикции и биохимических условиях рестрикционных реакций: «Ресурс рестрикционных ферментов». Архивировано из оригинал на 2002-02-03. Получено 2010-01-07.
Веб-страница рестрикционных ферментов Promega ©.
Базы данных белков:
- База данных белковых структур, решенная с атомным разрешением: «PDB». Исследовательское сотрудничество по структурной биоинформатике (RCSB). Архивировано из оригинал на 2015-04-07. Получено 2010-01-25.
Банк данных белков RCSB.
- Базы данных белков: Швейцарский институт биоинформатики (SIB); Европейский институт биоинформатики (EBI). "UniProtKB / Swiss-Prot & TrEMBL". Получено 2010-01-25.
Swiss-Prot - это тщательно подобранная база данных последовательностей белков, которая стремится обеспечить высокий уровень аннотации (например, описание функции белка, его доменной структуры, посттрансляционные модификации, варианты и т. д.), минимальный уровень избыточности и высокий уровень интеграции с другими базами данных. TrEMBL - это компьютерно-аннотированное приложение Swiss-Prot, которое содержит все переводы EMBL записи нуклеотидных последовательностей еще не интегрированы в Swiss-Prot.
Примечания и ссылки
- ^ Ламбовиц AM, Белфорт М (1993). «Интроны как мобильные генетические элементы». Анну Рев Биохим. 62: 587–622. Дои:10.1146 / annurev.bi.62.070193.003103. PMID 8352597.
- ^ Наито Т., Кусано К., Кобаяши И. (февраль 1995 г.). «Эгоистичное поведение систем ограничения-модификации». Наука. 267 (5199): 897–99. Bibcode:1995Научный ... 267..897N. Дои:10.1126 / science.7846533. PMID 7846533.
- ^ Жакье А., Дужон Б. (июнь 1985 г.). «Белок, кодируемый интроном, активен в процессе преобразования гена, который распространяет интрон в митохондриальный ген». Клетка. 41 (2): 383–94. Дои:10.1016 / S0092-8674 (85) 80011-8. PMID 3886163.
- ^ а б Готье А., Турмель М., Лемье С. (январь 1991 г.). «Интрон группы I в гене рРНК большой субъединицы хлоропласта Chlamydomonas eugametos кодирует двухцепочечную эндонуклеазу, которая расщепляет хоминг-сайт этого интрона». Курр Жене. 19 (1): 43–47. Дои:10.1007 / BF00362086. PMID 2036685.
- ^ а б Маршалл П., Лемье С. (август 1991 г.). «Паттерн расщепления самонаводящейся эндонуклеазы, кодируемой пятым интроном в гене, кодирующем рРНК большой субъединицы хлоропласта Chlamydomonas eugametos». Ген. 104 (2): 241–5. Дои:10.1016 / 0378-1119 (91) 90256-Б. PMID 1916294.
- ^ Turmel M, Boulanger J, Schnare MN, Gray MW, Lemieux C (март 1991 г.). «Шесть интронов группы I и три внутренних транскрибируемых спейсера в гене большой субъединицы рибосомной РНК хлоропласта зеленой водоросли Chlamydomonas eugametos». Дж Мол Биол. 218 (2): 293–311. Дои:10.1016 / 0022-2836 (91) 90713-Г. PMID 1849178.
- ^ Côté V, Mercier JP, Lemieux C, Turmel M (июль 1993 г.). «Единственный интрон группы I в гене rrnL хлоропласта Chlamydomonas humicola кодирует сайт-специфичную эндонуклеазу ДНК (I-ChuI)». Ген. 129 (1): 69–76. Дои:10.1016/0378-1119(93)90697-2. PMID 8335261.
- ^ а б Turmel M, Gutell RR, Mercier JP, Otis C, Lemieux C (июль 1993 г.). «Анализ гена рибосомной РНК большой субъединицы хлоропласта из 17 таксонов Chlamydomonas. Три внутренних транскрибируемых спейсера и 12 сайтов вставки интронов группы I». Дж Мол Биол. 232 (2): 446–67. Дои:10.1006 / jmbi.1993.1402. PMID 8393936.
- ^ Turmel M, Côté V, Otis C, Mercier JP, Gray MW, Lonergan KM, Lemieux C (июль 1995 г.). «Эволюционный перенос интронов группы I, содержащих ORF, между различными субклеточными компартментами (хлоропластом и митохондрией)». Мол Биол Эвол. 12 (4): 533–45. Дои:10.1093 / oxfordjournals.molbev.a040234. PMID 7659010.
- ^ Turmel M, Mercier JP, Côté V, Otis C, Lemieux C (июль 1995 г.). «Сайт-специфическая ДНК-эндонуклеаза, кодируемая интроном группы I в гене малой субъединицы рРНК хлоропласта Chlamydomonas pallidostigmatica, вводит однонитевой разрыв при низких концентрациях Mg2 +». Нуклеиновые кислоты Res. 23 (13): 2519–25. Дои:10.1093 / nar / 23.13.2519. ЧВК 307060. PMID 7630730.
- ^ Юрица М.С., Моннат Р.Дж., Стоддард Б.Л. (октябрь 1998 г.). «Распознавание и расщепление ДНК эндонуклеазой LAGLIDADG самонаводящейся I-CreI». Мол. Клетка. 2 (4): 469–76. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80146-X. PMID 9809068.
- ^ Chevalier BS, Kortemme T, Chadsey MS, Baker D, Monnat RJ, Stoddard BL (октябрь 2002 г.). «Дизайн, активность и структура высокоспецифической искусственной эндонуклеазы». Мол. Клетка. 10 (4): 895–905. Дои:10.1016 / S1097-2765 (02) 00690-1. PMID 12419232.
- ^ Goodrich-Blair H, Scarlato V, Gott JM, Xu M, Shub DA (октябрь 1990 г.). «Самосплайсинговый интрон группы I в гене ДНК-полимеразы бактериофага Bacillus subtilis SPO1». Клетка. 63 (2): 417–24. Дои:10.1016 / 0092-8674 (90) 90174-Д. PMID 2119891.
- ^ а б Гудрич-Блэр Х., Шуб Д.А. (январь 1996 г.). «За пределами хоминга: конкуренция между интронными эндонуклеазами дает селективное преимущество фланкирующим генетическим маркерам». Клетка. 84 (2): 211–21. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80976-9. PMID 8565067.
- ^ Гудрич-Блэр Х., Шуб Д.А. (сентябрь 1994 г.). «Гены ДНК-полимеразы нескольких HMU-бактериофагов имеют аналогичные интроны группы I с сильно расходящимися открытыми рамками считывания». Нуклеиновые кислоты Res. 22 (18): 3715–21. Дои:10.1093 / nar / 22.18.3715. ЧВК 308352. PMID 7937082.
- ^ Ширман С., Годон Дж. Дж., Гассон М. (июль 1996 г.). «Сплайсинг интрона группы II в гене функционального переноса Lactococcus lactis». Мол Микробиол. 21 (1): 45–53. Дои:10.1046 / j.1365-2958.1996.00610.x. PMID 8843433.
- ^ Миллс Д.А., Маккей Л.Л., Данни Г.М. (июнь 1996 г.). «Сплайсинг интрона группы II, участвующего в конъюгативном переносе pRS01 в лактококки». J Бактериол. 178 (12): 3531–8. Дои:10.1128 / jb.178.12.3531-3538.1996. ЧВК 178122. PMID 8655550.
- ^ Ликке-Андерсен Дж., Ти-Нгок Х.П., Гаррет Р.А. (ноябрь 1994 г.). «ДНК-субстратная специфичность и кинетика расщепления эндонуклеазы типа« хоминг »архей из Pyrobaculum organotrophum». Нуклеиновые кислоты Res. 22 (22): 4583–90. Дои:10.1093 / nar / 22.22.4583. ЧВК 308504. PMID 7984405.
- ^ Далгаард Дж. З., Гаррет Р. А. (ноябрь 1992 г.). «Кодирующие белок интроны из гена, кодирующего 23S рРНК, образуют стабильные круги в гипертермофильной архее Pyrobaculum organotrophum». Ген. 121 (1): 103–10. Дои:10.1016 / 0378-1119 (92) 90167-Н. PMID 1427083.
- ^ а б Щепанек Т., Лазовска Дж. (Июль 1996 г.). «Замена двух несмежных аминокислот в кодируемой интроном S.cerevisiae bi2 РНК maturase достаточна для достижения активности хоминг-эндонуклеаз». EMBO J. 15 (14): 3758–67. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00746.x. ЧВК 452048. PMID 8670880.
- ^ Lazowska J, Szczepanek T, Macadre C, Dokova M (1992). «Два гомологичных митохондриальных интрона от близкородственных видов Saccharomyces отличаются лишь несколькими аминокислотными заменами в их открытых рамках чтения: один подвижен, другой - нет». C. R. Acad. Sci. Париж. 315 (2): 37–41. PMID 1330224.
- ^ а б Кейн PM, Ямаширо CT, Wolczyk DF, Neff N, Goebl M, Stevens TH (ноябрь 1990). «Белковый сплайсинг превращает дрожжевой продукт гена TFP1 в 69-кДа субъединицу вакуолярной H (+) - аденозинтрифосфатазы». Наука. 250 (4981): 651–7. Bibcode:1990Научный ... 250..651K. Дои:10.1126 / science.2146742. PMID 2146742.
- ^ Гимбл Ф.С., Торнер Дж. (Май 1992 г.). "Направление гена эндонуклеазы ДНК путем преобразования мейотического гена в Saccharomyces cerevisiae". Природа. 357 (6376): 301–6. Bibcode:1992Натура.357..301Г. Дои:10.1038 / 357301a0. PMID 1534148.
- ^ а б c d е Бонитц С.Г., Коруцци Г., Таленфельд Б.Е., Цаголофф А., Мачино Г. (декабрь 1980 г.). «Сборка митохондриальной мембранной системы. Структура и нуклеотидная последовательность гена, кодирующего субъединицу 1 цитохромоксидазы дрожжей». J Biol Chem. 255 (24): 11927–41. PMID 6254986.
- ^ Хэнсон Д.К., Лэмб М.Р., Малер Х.Р., Перлман П.С. (март 1982 г.). «Доказательства транслированных промежуточных последовательностей в митохондриальном геноме Saccharomyces cerevisiae». J Biol Chem. 257 (6): 3218–24. PMID 6277926.
- ^ Делаходде А., Гогуэль В., Бекам А.М., Крезо Ф., Переа Дж., Банрокес Дж., Жак С. (февраль 1989 г.). «Сайт-специфическая ДНК-эндонуклеаза и активность матуразной РНК двух гомологичных кодируемых интронами белков из митохондрий дрожжей». Клетка. 56 (3): 431–41. Дои:10.1016/0092-8674(89)90246-8. PMID 2536593.
- ^ Саргей Б., Делаходде А., Хатат Д., Тиан Г.Л., Лазовска Дж., Жак С. (февраль 1991 г.). «Новая специфическая ДНК-эндонуклеазная активность в митохондриях дрожжей». Мол Джен Генет. 225 (2): 340–1. Дои:10.1007 / BF00269867. PMID 1848651.
- ^ Переа Дж., Десдуэ С., Шаприя М., Жак С. (январь 1993 г.). «I-Sce III: новая кодируемая интронами эндонуклеаза группы I из митохондрий дрожжей». Нуклеиновые кислоты Res. 21 (2): 358. Дои:10.1093 / nar / 21.2.358. ЧВК 309119. PMID 8441645.
- ^ Moran JV, Wernette CM, Mecklenburg KL, Butow RA, Perlman PS (август 1992 г.). «Интрон 5 альфа гена COXI митохондриальной ДНК дрожжей представляет собой мобильный интрон группы I.. Нуклеиновые кислоты Res. 20 (15): 4069–76. Дои:10.1093 / nar / 20.15.4069. ЧВК 334089. PMID 1324475.
- ^ Серафин Б., Фэй Дж., Хатат Д., Жак С. (апрель 1992 г.). "Дрожжевой митохондриальный интрон aI5 альфа: ассоциированная эндонуклеазная активность и подвижность in vivo". Ген. 113 (1): 1–8. Дои:10.1016 / 0378-1119 (92) 90663-А. PMID 1314207.
- ^ Лян Ф., Романиенко П.Дж., Уивер Д.Т., Джегго П.А., Джасин М. (август 1996 г.). «Ремонт двухцепочечных хромосомных разрывов в Ku80-дефицитных клетках». PNAS. 93 (17): 8929–33. Bibcode:1996PNAS ... 93.8929L. Дои:10.1073 / пнас.93.17.8929. ЧВК 38571. PMID 8799130.
- ^ Ян Дж., Циммерли С., Перлман П.С., Ламбовиц А.М. (май 1996 г.). «Эффективная интеграция интронной РНК в двухцепочечную ДНК путем обратного сплайсинга». Природа. 381 (6580): 332–5. Bibcode:1996Натура.381..332Y. Дои:10.1038 / 381332a0. PMID 8692273.
- ^ а б Белл-Педерсен Д., Куирк С., Клайман Дж., Белфорт М. (июль 1990 г.). «Подвижность интронов в фаге Т4 зависит от особого класса эндонуклеаз и не зависит от последовательностей ДНК, кодирующих ядро интрона: механистические и эволюционные последствия». Нуклеиновые кислоты Res. 18 (13): 3763–70. Дои:10.1093 / nar / 18.13.3763. ЧВК 331075. PMID 2165250.
- ^ Чу Ф.К., Мэйли Дж., Педерсен-Лейн Дж., Ван А.М., Мэйли Ф. (май 1990 г.). «Характеристика сайта рестрикции прокариотической эндонуклеазы, кодируемой интроном». PNAS. 87 (9): 3574–8. Bibcode:1990PNAS ... 87.3574C. Дои:10.1073 / pnas.87.9.3574. ЧВК 53944. PMID 2159153.
- ^ Белл-Педерсен Д., Куирк С.М., Обри М., Белфорт М. (октябрь 1989 г.). «Сайт-специфическая эндонуклеаза и совместная конверсия фланкирующих экзонов, связанных с мобильным интроном td фага Т4». Ген. 82 (1): 119–26. Дои:10.1016 / 0378-1119 (89) 90036-Х. PMID 2555262.
- ^ Шуб Д.А., Готт Дж.М., Сюй М.К., Ланг Б.Ф., Мишель Ф., Томашевски Дж., Педерсен-Лейн Дж., Белфорт М. (февраль 1988 г.). «Структурная консервация среди трех гомологичных интронов бактериофага Т4 и интронов группы I эукариот». PNAS. 85 (4): 1151–5. Bibcode:1988ПНАС ... 85.1151С. Дои:10.1073 / pnas.85.4.1151. ЧВК 279724. PMID 3422485.
- ^ Эдди С.Р., Голд Л. (июнь 1991 г.). «Интрон nrdB фага T4: делеционный мутант версии, найденной в дикой природе». Genes Dev. 5 (6): 1032–41. Дои:10.1101 / gad.5.6.1032. PMID 2044951.
- ^ Сюй М., Саутворт М.В., Мерша Ф. Б., Хорнстра Л. Дж., Перлер Ф. Б. (декабрь 1993 г.). «Сплайсинг очищенного предшественника белка in vitro и идентификация разветвленного промежуточного продукта». Клетка. 75 (7): 1371–7. Дои:10.1016 / 0092-8674 (93) 90623-Х. PMID 8269515.
- ^ а б Perler FB, Comb DG, Jack WE, Moran LS, Qiang B, Kucera RB, Benner J, Slatko BE, Nwankwo DO, Hempstead SK, Carlow CK, Jannasch H (июнь 1992 г.). «Промежуточные последовательности в гене ДНК-полимеразы архей». PNAS. 89 (12): 5577–81. Bibcode:1992ПНАС ... 89.5577П. Дои:10.1073 / пнас.89.12.5577. ЧВК 49335. PMID 1608969.
- ^ Хирата Р., Осумк Ю., Накано А., Кавасаки Н., Сузуки К., Анраку Ю. (апрель 1990 г.). «Молекулярная структура гена VMA1, кодирующего каталитическую субъединицу H (+) - транслокации аденозинтрифосфатазы из вакуолярных мембран Saccharomyces cerevisiae». J Biol Chem. 265 (12): 6726–33. PMID 2139027.
- ^ Perler FB (январь 2002 г.). «InBase: база данных Intein». Нуклеиновые кислоты Res. 30 (1): 383–4. Дои:10.1093 / nar / 30.1.383. ЧВК 99080. PMID 11752343.