WikiDer > Список сайтов разрезания рестрикционных ферментов: A - Википедия
List of restriction enzyme cutting sites: A - Wikipedia
| Легенда о азотистые основания | |
|---|---|
| Код | Нуклеотид представлен |
| А | Аденин (А) |
| C | Цитозин (С) |
| грамм | Гуанин (ГРАММ) |
| Т | Тимин (Т) |
| N | A, C, G или T |
| M | А или С |
| р | A или G |
| W | А или Т |
| Y | C или T |
| S | C или G |
| K | G или T |
| ЧАС | A, C или T |
| B | C, G или T |
| V | A, C или G |
| D | A, G или T |
Эта статья содержит список рестрикционных ферментов, названия которых начинаются с буквы А и имеют четко определенный участок разреза.
Для каждого фермента дана следующая информация:
- Название рестрикционного фермента: Принятое название молекула, согласно международно принятой номенклатура,[1][2] и библиографические ссылки. Примечание. При алфавитном расположении ферменты сначала располагаются в алфавитном порядке по аббревиатурам (все до римской цифры); тогда ферменты данного акронима упорядочиваются в алфавитном порядке по римской цифре, считая цифру числом, а не строкой букв. Это помогает упорядочивать записи в иерархическом порядке, а также в алфавитном порядке.(Дальнейшее чтение: см. Раздел "Номенклатура"в статье"Фермент рестрикции".)
- PDB код: Код, используемый для определения структуры белка в PDB база данных белковых структур. Трехмерная атомная структура белка дает очень ценную информацию для понимания внутренних деталей механизма его действия.[3][4]
- REBASE Число: Число, используемое для идентификации рестрикционных ферментов в База данных рестрикционных ферментов REBASE. Эта база данных включает важную информацию о ферменте, например: Последовательность распознавания, источник и Изошизомеры, а также другие данные, такие как коммерческие поставщики фермента.
- Источник: Организм, который естественным образом производит фермент.
- Последовательность распознавания: Последовательность ДНК, распознаваемая ферментом и с которой он специфически связывается.
- Резать: Отображение места вырезания, рисунка и продуктов вырезания. В последовательность распознавания и сайт разреза обычно совпадает, но иногда сайт разреза может находиться на расстоянии нескольких десятков нуклеотидов от сайта узнавания.[5][6]
- Изошизомеры и неошизомеры: An изошизомер это рестрикционный фермент который распознает ту же последовательность, что и другой. А неошизомер представляет собой особый тип изошизомера, который распознает одну и ту же последовательность, но разрезает другим способом. Для каждого фермента указано не более 8–10 наиболее распространенных изошизомеров, но их может быть намного больше. Неошизомеры выделены жирным шрифтом зеленого цвета (например: BamHI). Если указано «Нет на [дата]», это означает, что на эту дату в базах данных не было зарегистрированных изошизомеров. с четко обозначенной площадкой для резки. Изошизомеры, указанные белым шрифтом и серым фоном, соответствуют ферментам, не перечисленным в текущих списках, как в этом не перечисленном ферменте: Abc123I
Ферменты рестрикции
А
| Фермент | PDB код | REBASE Число | Источник | Последовательность распознавания | Резать | Изошизомеры |
|---|---|---|---|---|---|---|
| AaaI | 1 | Acetobacter aceti | 5 'CGGCCG 3 'GCCGGC | 5 '--- С GGCCG --- 3 ' 3 '--- GCCGG C --- 5 ' | BseX3I, BstZI, EagI, EclXI, Eco52I, SenPT16I, XmaIII | |
| AagI | 4 | Achromobacter agile | 5 'ATCGAT 3 'ТАГКТА | 5 '--- В CGAT --- 3 ' 3 '--- TAGC ТА --- 5 ' | BanIII, BavCI, Bsa29I, BseCI, BspDI, Bsu15I, BsuTUI, ClaI | |
| Аани | 15358 | Arthrobacter aurescens RFL2 | 5 'TTATAA 3 'AATATT | 5 '--- ТТА TAA --- 3 ' 3 '--- AAT ATT --- 5 ' | PsiI, Csp1BORF7380P | |
| AarI[7] | 2892 | Arthrobacter aurescens SS2-322 | 5 'CACCTGC 3 'GTGGACG | 5 '--- CACCTGCN3N NNNN --- 3 ' 3 '--- GTGGACGN3NNNNN --- 5' | Нет по состоянию на май 2010 г. | |
| AasI | 5465 | Arthrobacter aurescens RFL3 | 5 'GACN6GTC 3 'CTGN6CAG | 5 '--- GACNNNN NNGTC --- 3 ' 3 '--- CTGNN NNNNCAG --- 5 ' | DrdI, DseDI | |
| Аати[8] | 6 | Acetobacter aceti | 5 'AGGCCT 3 'TCCGGA | 5 '--- AGG CCT --- 3 ' 3 '--- TCC GGA --- 5 ' | AspMI, Eco147I, Эко1524И, PceI, Pme55I, SarI, Sru30DI, SteI | |
| AatII[8][9][10][11] | 7 | Acetobacter aceti | 5 'GACGTC 3 'CTGCAG | 5 '--- GACGT C --- 3 ' 3 '--- С TGCAG --- 5 ' | Ssp5230I, ZraI | |
| AauI | 3010 | Arthrobacter aurescens | 5 'TGTACA 3 'ACATGT | 5 '--- т GTACA --- 3 ' 3 '--- ACATG Т --- 5 ' | BsmRI, Bsp1407I, BsrGI, BstAUI, Ssp4800I, SspBI | |
| Абаи | 3029 | Азоспириллы бразильские UQ 1796 | 5 'ТГАТКА 3 'ACTAGT | 5 '--- т GATCA --- 3 ' 3 '--- ACTAG Т --- 5 ' | BclI, BsiQI, BspXII, BstT7I, FbaI, Ksp22I, ParI | |
| AbeI | 3097 | Азотобактер beijerinckii Slo 54-028 | 5 'CCTCAGC 3 'GGAGTCG | 5 '--- CC TCAGC --- 3 ' 3 '--- GGAGT CG --- 5 ' | BbvCI | |
| Абри | 8 | Азоспириллы бразильские | 5 'CTCGAG 3 'GAGCTC | 5 '--- С TCGAG --- 3 ' 3 '--- GAGCT C --- 5 ' | BluI, BspAAI, BssHI, EscI, PaeR7I, Наука, Sfr274I, Sol10179I, StrI, TliI | |
| AbsI | 14594 | Артробактер sp. 7M06 | 5 'CCTCGAGG 3 'GGAGCTCC | 5 '--- CC TCGAGG --- 3 ' 3 '--- GGAGCT CC --- 5 ' | Нет по состоянию на 4 апреля 2019 г. | |
| AccI[12][13][14][15] | 18 | Acinetobacter calcoaceticus | 5 'GTMKAC 3 'CAKMTG | 5 '--- GT MKAC --- 3 ' 3 '--- CAKM ТГ --- 5 ' | FblI, XmiI | |
| AccII[12][16] | 19 | Acinetobacter calcoaceticus | 5 футов CGCG 3 'GCGC | 5 '--- CG CG --- 3 ' 3 '--- GC GC --- 5 ' | Bsh1236I, Bsp50I, BstFNI, BstUI, MvnI, SelI, BceBI, BepI, Bpu95I | |
| AccIII[17] | 20 | Acinetobacter calcoaceticus | 5 'TCCGGA 3 'AGGCCT | 5 '--- т CCGGA --- 3 ' 3 '--- AGGCC Т --- 5 ' | Aor13HI, BbvAIII, BlfI, BseAI, BsiMI, BspEI, CauB3I, Kpn2I, MroI, PtaI | |
| Acc16I | 2638 | Acinetobacter calcoaceticus 16 | 5 'TGCGCA 3 'ACGCGT | 5 '--- ТГК GCA --- 3 ' 3 '--- АЧГ CGT --- 5 ' | AosI, AviII, FdiII, FspI, MstI, NsbI, PamI, Pun14627I | |
| Acc36I[18] | 4162 | Acinetobacter calcoaceticus 36 | 5 'ACCTGC 3 'TGGACG | 5 '--- ACCTGCN3N NNNN --- 3 ' 3 '--- TGGACGN3NNNNN --- 5' | BfuAI, BspMI, BveI | |
| Acc65I[19] | 14 | Acinetobacter calcoaceticus 65 | 5 'GGTACC 3 'CCATGG | 5 '--- G GTACC --- 3 ' 3 '--- CCATG G --- 5 ' | AhaB8I, Asp718I, КПНИ, SthI | |
| Acc113I | 2665 | Acinetobacter calcoaceticus 113 | 5 'АГТАКТ 3 'TCATGA | 5 '--- AGT ДЕЙСТВИЕ --- 3 ' 3 '--- TCA TGA --- 5 ' | AssI, BmcAI, Bpa34I, DpaI, Eco255I, RflFII, ScaI, ZrmI | |
| AccB1I | 15 | Acinetobacter calcoaceticus B1 | 5 'GGYRCC 3 'CCRYGG | 5 '--- G GYRCC --- 3 ' 3 '--- CCRYG G --- 5 ' | BanI, BbvBI, BshNI, BspT107I, Eco64I, HgiCI, HgiHI, MspB4I | |
| AccB2I | 2666 | Acinetobacter calcoaceticus Би 2 | 5 'RGCGCY 3 'YCGCGR | 5 '--- RGCGC Y --- 3 ' 3 '--- Y CGCGR --- 5 ' | BfoI, Bme142I, Bsp143II, BstH2I, HaeII, LpnI | |
| AccB7I[20] | 16 | Acinetobacter calcoaceticus B7 | 5 'CCAN5TGG 3 'ГГТН5АКК | 5 '--- CCANNNN NTGG --- 3 ' 3 '--- GGTN NNNNACC --- 5 ' | AcpII, Asp10HII, BasI, Esp1396I, PflBI, PflMI, Van91I | |
| AccBSI[21] | 2733 | Acinetobacter calcoaceticus BS | 5 'CCGCTC 3 'GGCGAG | 5 '--- CCG CTC --- 3 ' 3 '--- GGC GAG --- 5 ' | BsrBI, BstD102I, Bst31NI, MbiI | |
| AccEBI | 17 | Acinetobacter calcoaceticus EBF 65/65 | 5 'GGATCC 3 'CCTAGG | 5 '--- G GATCC --- 3 ' 3 '--- CCTAG G --- 5 ' | AsiI, BamHI, Bce751I, Bsp98I, BspAAIII, CelI, OkrAI, Uba4009I | |
| AceI | 2571 | Анабаена цедрорум | 5 'GCWGC 3 'CGWCG | 5 '--- G CWGC --- 3 ' 3 '--- CGWC G --- 5 ' | ApeKI, SuiI, Taq52I, TseI | |
| AceII | 2570 | Анабаена цедрорум | 5 'GCTAGC 3 'CGATCG | 5 '--- GCTAG C --- 3 ' 3 '--- С GATCG --- 5 ' | AsuNHI, BmtI, BspOI, , LlaG2I, NheI, ПстНИ | |
| AceIII | 2569 | Анабаена цедрорум | 5 'CAGCTC 3 'GTCGAG | 5 '--- CAGCTCN5N NNNN --- 3 ' 3 '--- GTCGAGN5NNNNN --- 5' | - Нет по состоянию на май 2010 г. - | |
| AciI[11][22] | 21 | Arthrobacter citreus | 5 'CCGC 3 'GGCG | 5 '--- С CGC --- 3 ' 3 '--- GGC G --- 5 ' | SsiI | |
| AclI[23] | 2181 | Acinetobacter calcoaceticus M4 | 5 'AACGTT 3 'TTGCAA | 5 '--- AA CGTT --- 3 ' 3 '--- TTGC AA --- 5 ' | Psp1406I | |
| AclNI | 2667 | Acinetobacter calcoaceticus N20 | 5 'ACTAGT 3 'ТГАТКА | 5 '--- А CTAGT --- 3 ' 3 '--- ТГАТК А --- 5 ' | AhlI, BcuI, SpeI | |
| AclWI | 2668 | Acinetobacter calcoaceticus W2131 | 5 'GGATC 3 'CCTAG | 5 '--- GGATCN3N N --- 3 ' 3 '--- CCTAGN3NN --- 5' | AlwI, BinI, BpuFI, BsrWI, BspPI, BstH9I, Бст31ТИ, EacI, Ral8I | |
| AcoI | 11822 | Acinetobacter calcoaceticus | 5 'YGGCCR 3 'RCCGGY | 5 '--- Y GGCCR --- 3 ' 3 '--- RCCGG Y --- 5 ' | EaeI, Bfi89I, CfrI, EcoHK31I | |
| AcpI | 22 | Acidiphilium cryptum 25H | 5 'TTCGAA 3 'AAGCTT | 5 '--- ТТ CGAA --- 3 ' 3 '--- AAGC TT --- 5 ' | Asp10HI, Bpu14I, Bsp119I, BstBI, Csp45I, FspII, MlaI, NspV, SspRFI | |
| AcpII | 23 | Acidiphilium cryptum 25H | 5 'CCAN5TGG 3 'ГГТН5АКК | 5 '--- CCANNNN NTGG --- 3 ' 3 '--- GGTN NNNNACC --- 5 ' | AccB7I, Asp10HII, BasI, Esp1396I, PflBI, PflMI, Van91I | |
| AcrII | 25 | Анабаенопсис круговой | 5 'GGTNACC 3 'CCANTGG | 5 '--- G GTNACC --- 3 ' 3 '--- CCANTG G --- 5 ' | AspAI, Bse64I, BseT9I, BstEII, BstPI, Eco91I, EcoO65I, PspEI | |
| AcsI[24] | 2184 | Arthrobacter citreus 310 | 5 мин. 3 'YTTAAR | 5 '--- R АЭТТИ --- 3 ' 3 '--- YTTAA R --- 5 ' | ApoI, CfaI, FsiI, XapI | |
| AcuI | 5534 | Acinetobacter calcoaceticus | 5 'CTGAAG 3 'GACTTC | 5 '--- CTGAAGN13NNN --- 3' 3 '--- GACTTCN13N NN --- 5 ' | БспКТ5И, Эко57И | |
| AcvI | 5359 | Aeromonas caviae | 5 'CACGTG 3 'GTGCAC | 5 '--- CAC ГТГ --- 3 ' 3 '--- GTG CAC --- 5 ' | BbrPI, BcoAI, Eco72I, PmaCI, PmlI, PspCI | |
| AcyI[25] | 31 | Анабаена цилиндрическая | 5 'GRCGYC 3 'CYGCRG | 5 '--- GR CGYC --- 3 ' 3 '--- CYGC RG --- 5 ' | AhaII, AosII, BbiII, BsaHI, BstACI, Hin1I, HgiI, Hsp92I, Msp17I | |
| AdeI | 2991 | Alcaligenes denitrificans Ss 3-028 | 5 'CACNNNGTG 3 'GTGNNNCAC | 5 '--- CACNNN ГТГ --- 3 ' 3 '--- GTG NNNCAC --- 5 ' | BstIZ316I, DraIII | |
| AeuI | 33 | Achromobacter eurydice | 5 'CCWGG 3 'GGWCC | 5 '--- CC WGG --- 3 ' 3 '--- GGW CC --- 5 ' | Агли, Аджни, BseBI, BstNI, BstOI, Bst2UI, ЭкоРИИ, SleI, SspAI | |
| Афай[26] | 37 | Acidiphilium facilis 28H | 5 'GTAC 3 'CATG | 5 '--- GT AC --- 3 ' 3 '--- CA ТГ --- 5 ' | Csp6I, CviQI, CviRII, HpyBI, Паби, PlaAII, RsaI, РСАНИ | |
| Afa16RI | 34 | Ацидифилиум sp. 16R | 5 'CGATCG 3 'GCTAGC | 5 '--- CGAT CG --- 3 ' 3 '--- GC TAGC --- 5 ' | Afa22MI, BspCI, EagBI, MvrI, NblI, Ple19I, PvuI, Psu161I, RshI, XorII | |
| Afa22MI | 35 | Acidocella facilis | 5 'CGATCG 3 'GCTAGC | 5 '--- CGAT CG --- 3 ' 3 '--- GC TAGC --- 5 ' | Afa16RI, BspCI, EagBI, ErhB9I, NblI, Ple19I, Psu161I, PvuI, RshI | |
| AfeI[27] | 2669 | Alcaligenes faecalis T2774 | 5 'AGCGCT 3 'TCGCGA | 5 '--- AGC GCT --- 3 ' 3 '--- TCG CGA --- 5 ' | AitI, Aor51H, Eco47III, FunI | |
| AfiI | 10489 | Anoxybacillus flavithermus | 5 'CCN7GG 3 'GGN7CC | 5 '--- CCNNNNN NNGG --- 3 ' 3 '--- GGNN NNNNNCC --- 5 ' | Bsc4I, BseLI, BslI, BflI, Bsc107I, BsiYI, Bst22I | |
| AflI[28] | Anabaena flos-aquae | 5 'GGWCC 3 'CCWGG | 5 '--- G GWCC --- 3 ' 3 '--- CCWG G --- 5 ' | Asp745I, BamNI, BcuAI, CauI, Csp68KI, DsaIV, Eco47I, SinI | ||
| AflII[28][29][30] | 39 | Anabaena flos-aquae | 5 'CTTAAG 3 'GAATTC | 5 '--- С TTAAG --- 3 ' 3 '--- ГААТТ C --- 5 ' | BfrI, BspTI, Bst98I, BstAFI, BstPZ740I, Esp4I, MspCI, Vha464I | |
| AflIII[28][10] | 40 | Anabaena Flos-Aquae | 5 'АКРИГТ 3 'TGYRCA | 5 '--- А КРИГТ --- 3 ' 3 '--- TGYRC А --- 5 ' | Asp90I | |
| ВозрастI[11][31] | 42 | Agrobacterium gelatinovorum | 5 'ACCGGT 3 'TGGCCA | 5 '--- А CCGGT --- 3 ' 3 '--- TGGCC А --- 5 ' | AsiAI, AsiGI, БшТИ, CsiAI, CspAI, PinAI | |
| Агли[32] | 6652 | Arthrobacter globiformis | 5 'CCWGG 3 'GGWCC | 5 '--- CC WGG --- 3 ' 3 '--- GGW CC --- 5 ' | АевИ, Бсе16И, Бсе17И, Бсе24И, БшГИ, ЭкоРИИ, SleI, SniI, SslI | |
| AgsI | Агрококк sp. 25 | 5 'TTSAA 3 'ААСТТ | 5 мин --- TTS AA --- 3 ' 5 '--- AA STT --- 3 ' | Нет по состоянию на 4 мая 2019 г. | ||
| Ага | 45 | Alteromonas haloplanktis B8 | 5 'CCSGG 3 'GGSCC | 5 '--- CC SGG --- 3 ' 3 '--- GGS CC --- 5 ' | AseII, BcnI, БпуМИ, CauII, Eco1831I, EcoHI, HgiS22I, NciI | |
| AhaII | Aphanothece halophytica | 5 'GRCGYC 3 'CYGCRG | 5 '--- GR CGYC --- 3 ' 3 '--- CYGC RG --- 5 ' | AcyI, AstWI, AsuIII, BsaHI, BstACI, Hin1I, HgiI, HgiDI, HgiHII, PamII | ||
| AhaIII[14][29][30][33] | Aphanothece halophytica | 5 'TTTAAA 3 'AAATTT | 5 '--- TTT AAA --- 3 ' 3 '--- AAA ТТТ --- 5 ' | DraI, PauAII, SruI | ||
| AhaB8I | Aphanothece halophytica B8 | 5 'GGTACC 3 'CCATGG | 5 '--- G GTACC --- 3 ' 3 '--- CCATG G --- 5 ' | Acc65I, Asp718I, КПНИ, SthI | ||
| Ахди[34][35] | Aeromonas hydrophila | 5 'GACN5GTC 3 'CTGN5CAG | 5 '--- GACNNN NNGTC --- 3 ' 3 '--- CTGNN NNNCAG --- 5 ' | AspEI, BmeRI, BspOVI, DriI, Eam1105I, EclHKI, NruGI | ||
| Ахли | 4838 | Alteromonas haloplanktis SP | 5 'ACTAGT 3 'ТГАТКА | 5 '--- А CTAGT --- 3 ' 3 '--- ТГАТК А --- 5 ' | AclNI, BcuI, SpeI | |
| Ахй | 49 | Aeromonas hydrophila | 5 'CCCGGG 3 'GGGCCC | 5 '--- С CCGGG --- 3 ' 3 '--- GGGCC C --- 5 ' | Cfr9I, CfrJ4I, EaeAI, EclRI, PaeBI, SmaI, TspMI, XmaI, XmaCI | |
| AitI | 54 | Aquaspirillum itersonii | 5 'AGCGCT 3 'TCGCGA | 5 '--- AGC GCT --- 3 ' 3 '--- TCG CGA --- 5 ' | AfeI, Aor51H, Eco47III, FunI | |
| AjiI | 10919 | Acinetobacter Johnsonii RFL47 | 5 'CACGTC 3 'GTGCAG | 5 '--- CAC GTC --- 3 ' 3 '--- GTG CAG --- 5 ' | BmgBI, BtrI | |
| Аджни | 7185 | Acinetobacter johnsonii R2 | 5 'CCWGG 3 'GGWCC | 5' --- CCWGG --- 3 ' 3 '--- GGWCC --- 5' | AorI, Апаори, ApyI, ЭкоРИИ, MvaI, Psp6I, PspGI, SleI, SspAI | |
| AjoI | 2604 | Acinetobacter johnsonii 35 | 5 'CTGCAG 3 'GACGTC | 5 '--- CTGCA G --- 3 ' 3 '--- G ACGTC --- 5 ' | ApiI, BloHII, BspMAI, CfrA4I, CfuII, PstI, SalPI, SflI, Srl5DI | |
| AjuI | 7740 | Acinetobacter junii RFL46 | 5 'ГААН7ТТГГ 3'CTTN7AACC | 5 '--- NNNNN NN6ГААН7TTGGN5NNNNNN --- 3' 3' --- NNNNNNN6CTTN7AACCN5N NNNNN --- 5 ' | Нет по состоянию на 28 октября 2020 г. | |
| AleI | 5791 | Aureobacterium liquefaciens | 5 'CACN4GTG 3 'GTGN4САС | 5 '--- CACNN NNGTG --- 3 ' 3 '--- GTGNN NNCAC --- 5 ' | ОлиI | |
| Альфи | 6110 | Acinetobacter lwoffii BH 32 | 5 'GCAN6ТГК 3 'CGTN6АЧГ | 5 '--- GCAN6ТГКН9NNN --- 3' 3 '--- CGTN6ACGN9N NN --- 5 ' | Нет по состоянию на май 2010 г. | |
| АлиИ | Acetobacter liquefaciens | 5 'GGATCC 3 'CCTAGG | 5 '--- G GATCC --- 3 ' 3 '--- CCTAG G --- 5 ' | AccEBI, BamHI, Bce751I, Bsp98I, BspAAIII, Nsp29132II, Pfl8I | ||
| АлиАджи | 59 | Acetobacter liquefaciens AJ 2881 | 5 'CTGCAG 3 'GACGTC | 5 '--- CTGCA G --- 3 ' 3 '--- G ACGTC --- 5 ' | ApiI, Asp713I, BspMAI, CflI, CstI, MhaAI, PstI, SalPI, Sst12I, YenI | |
| АлоИ[36][37] | 2812 | Acinetobacter lwoffii Ks 4-8 | 5 'GAACN6TCC 3 'CTTGN6AGG | 5 '--- GAACN6TCCN6NNNNNN --- 3' 3 '--- CTTGN6AGGN6N NNNNN --- 5 ' | Нет по состоянию на май 2010 г. | |
| AluI[12][14][38][39][40][41] | 61 | Arthrobacter luteus | 5 'AGCT 3 'TCGA | 5 '--- AG CT --- 3 ' 3 '--- TC GA --- 5 ' | AluBI, MltI | |
| AluBI | 16189 | Arthrobacter luteus B | 5 'AGCT 3 'TCGA | 5 '--- AG CT --- 3 ' 3 '--- TC GA --- 5 ' | AluI, MltI | |
| AlwI | 65 | Acinetobacter lwoffii | 5 'GGATC 3 'CCTAG | 5 '--- GGATCN3N N --- 3 ' 3 '--- CCTAGN3NN --- 5' | AclWI, BinI, BspPI, BsrWI, BstH9I, BthII, Bth617I, EacI | |
| Alw21I | Acinetobacter lwoffii RFL21 | 5 'GWGCWC 3 'CWCGWG | 5 '--- GWGCW C --- 3 ' 3 '--- С WCGWG --- 5 ' | AspHI, Bbv12I, Bsh45I, BsiHKAI, Бсм6И, HgiAI, MspV281I | ||
| Alw26I[42] | 63 | Acinetobacter lwoffii RFL26 | 5 'GTCTC 3 'CAGAG | 5 '--- GTCTCN NNNN --- 3 ' 3 '--- CAGAGNNNNN --- 5' | BcoDI, BscQII, BsmAI, BsoMAI, BstMAI | |
| Alw44I | Acinetobacter lwoffii RFL44 | 5 'GTGCAC 3 'CACGTG | 5 '--- G TGCAC --- 3 ' 3 '--- CACGT G --- 5 ' | АПАЛИ, СНОИ, ВНЕИ | ||
| AlwNI[43] | Acinetobacter lwoffii N | 5 'CAGNNNCTG 3 'GTCNNNGAG | 5 '--- CAGNNN CTG --- 3 ' 3 '--- GTC NNNGAC --- 5 ' | CaiI | ||
| AlwXI | 67 | Acinetobacter lwoffii Икс | 5 'GCAGC 3 'CGTCG | 5 '--- GCAGCN7N NNNN --- 3 ' 3 '--- CGTCGN7NNNNN --- 5' | BbvI, BseKI, BseXI, Bsp423I, Bst12I, Bst71I, BstV1I | |
| Ama87I | Alteromonas macleodii 87 | 5 'CYCGRG 3 'GRGCYC | 5 '--- С YCGRG --- 3 ' 3 '--- GRGCY C --- 5 ' | AquI, AvaI, BmeT110I, BsiHKCI, BsoBI, Eco88I, Nli3877I, NspSAI | ||
| AmaCSI | 26714 | Arthrospira maxima CS-328 | 5 'GCTCCA 3 'CGAGGT | 5 '--- GCTCCAN8NNN --- 3' 3 '--- CGAGGTN8N NN --- 5 ' | Нет по состоянию на 4 мая 2018 г. | |
| AocI | 74 | Анабаена sp. | 5 'CCTNAGG 3 'GGANTCC | 5 '--- CC TNAGG --- 3 ' 3 '--- ГГАНТ CC --- 5 ' | AyI, Bse21I, Bsu36I, Eco81I, Lmu60I, OaNI, MstII, SauI, SshAI | |
| AocII | Анабаена sp. | 5 'ГДГЧК 3 'CHCGDG | 5 '--- ГДГЧ C --- 3 ' 3 '--- С HCGDG --- 5 ' | BmyI, BsoCI, Bsp1286I, BspLS2I, MhlI, NspII, SduI | ||
| AorI | 77 | Acetobacter aceti orleanensis | 5 'CCWGG 3 'GGWCC | 5 '--- CC WGG --- 3 ' 3 '--- GGW CC --- 5 ' | BseBI, BstNI, BstOI, Bst2UI, ЭкоРИИ, MvaI, Sth117I, Tai | |
| Aor13HI[44] | Acidiphilium organovorum 13H | 5 'TCCGGA 3 'AGGCCT | 5 '--- т CCGGA --- 3 ' 3 '--- AGGCC Т --- 5 ' | AccIII, BbvAIII, BlfI, BseAI, BsiMI, BspEI, CauB3I, Kpn2I, MroI, PtaI | ||
| Aor51HI[45] | 76 | Acidiphilium organovorum 51H | 5 'AGCGCT 3 'TCGCGA | 5 '--- AGC GCT --- 3 ' 3 '--- TCG CGA --- 5 ' | AfeI, AitI, Eco47III, FunI | |
| AosI | Анабаена осцилляриоидес | 5 'TGCGCA 3 'ACGCGT | 5 '--- ТГК GCA --- 3 ' 3 '--- АЧГ CGT --- 5 ' | Acc16I, AviII, FdiII, FspI, MstI, NsbI, PamI, Pun14627I | ||
| AosII | Анабаена осцилляриоидес | 5 'GRCGYC 3 'CYGCRG | 5 '--- GR CGYC --- 3 ' 3 '--- CYGC RG --- 5 ' | AcyI, AstWI, BbiII, BsaHI, BstACI, Hin1I, HgiI, HgiGI, Msp17I, PamII | ||
| Апай[11][30][46] | Acetobacter pasteurianus pasteurianus | 5 'GGGCCC 3 'CCCGGG | 5 '--- GGGCC C --- 3 ' 3 '--- С CCGGG --- 5 ' | Bsp120I, PpeI, PspOMI | ||
| ApaBI[47] | Acetobacter pasteurianus B | 5 'GCAN5ТГК 3 'CGTN5АЧГ | 5 '--- GCANNNNN ТГК --- 3 ' 3 '--- CGT NNNNNACG --- 5 ' | BstAPI | ||
| ApaCI | Acetobacter pasteurianus C | 5 'GGATCC 3 'CCTAGG | 5 '--- G GATCC --- 3 ' 3 '--- CCTAG G --- 5 ' | АлиИ, BamHI, BnaI, Bsp4009I, BstI, NspSAIV, Pfl8I, SolI, SurI | ||
| Апали[48][49] | Acetobacter pasteurianus | 5 'GTGCAC 3 'CACGTG | 5 '--- G TGCAC --- 3 ' 3 '--- CACGT G --- 5 ' | Alw44I, SnoI, VneI | ||
| Апаори | 86 | Acetobacter pasteurianus | 5 'CCWGG 3 'GGWCC | 5 '--- CC WGG --- 3 ' 3 '--- GGW CC --- 5 ' | Аджни, BstNI, BstOI, Bst1I, Bst2I, Fsp1604I, MvaI, Psp6I, PspGI | |
| ApeKI[50] | Аэропирум перникс K1 | 5 'GCWGC 3 'CGWCG | 5 '--- G CWGC --- 3 ' 3 '--- CGWC G --- 5 ' | AceI, SuiI, Taq52I, TseI | ||
| ApiI | 2315 | Arthrobacter picolinophilus | 5 'CTGCAG 3 'GACGTC | 5 '--- CTGCA G --- 3 ' 3 '--- G ACGTC --- 5 ' | Asp713I, Bsp63I, CfrA4I, PaePI, Pfl21I, Psp23I, PstI, SflI, Sst12I | |
| ApoI[51] | Arthrobacter protophormiae | 5 мин. 3 'YTTAAR | 5 '--- R АЭТТИ --- 3 ' 3 '--- YTTAA R --- 5 ' | AcsI, CfaI, FsiI, XapI, EcoRI | ||
| AplI | 25962 | Arthrospira platensis NIES-39 | 5 'CTGCAG 3 'GACGTC | 5 '--- CTGCA G --- 3 ' 3 '--- G ACGTC --- 5 ' | Видеть этот сайт для полного списка. | |
| ApyI | 93 | Arthrobacter pyridinolis | 5 'CCWGG 3 'GGWCC | 5 '--- CC WGG --- 3 ' 3 '--- GGW CC --- 5 ' | BciBII, BptI, BseBI, BstNI, BstOI, Bst2UI, Bst38I, Bst100I, MvaI | |
| АпиПИ | 14756 | Arcanobacterium pyogenes | 5 'ATCGAC 3 'TAGCTG | 5 '--- ATCGACN17NNN --- 3' 3 '--- TAGCTGN17N NN --- 5 ' | Нет по состоянию на 4 августа 2019 г. | |
| AquI | Agmenellum quadruplicatum PR-6 | 5 'CYCGRG 3 'GRGCYC | 5 '--- С YCGRG --- 3 ' 3 '--- GRGCY C --- 5 ' | BcoI, BmeT110I, BsmAI, BsoMAI, BsoBI, BstSI, Eco27kI, OfoI | ||
| AquII | 20238 | Agmenellum quadruplicatum PR-6 | 5 'GCCGNAC 3 'CGGCNTG | 5 '--- GCCGNACN17NNN --- 3' 3 '--- CGGCNTGN17N NN --- 5 ' | Нет по состоянию на 4 августа 2019 г. | |
| AquIII | 20239 | Agmenellum quadruplicatum PR-6 | 5 'ГАГГАГ 3 'CTCCTC | 5 '--- GAGGAGN17NNN --- 3' 3 '--- CTCCTCN17N NN --- 5 ' | BseRI | |
| AquIV | 20240 | Agmenellum quadruplicatum PR-6 | 5 'GRGGAAG 3 'CYCCTTC | 5 '--- GRGGAAGN16NNN --- 3' 3 '--- CYCCTTCN16N NN --- 5 ' | Нет по состоянию на 09.04.19 | |
| Арси | 19405 | Артробактер sp. НТС | 5 'GACN6TTYG 3 'CTGN6AARC | 5 '--- NNNNN NN7GACN6TTYGN5NNNNNN --- 3' 3' --- NNNNNNN7CTGN6AARCN5N NNNNN --- 5 ' | Нет по состоянию на 28 октября 2020 г. | |
| AscI[11][52] | Артробактер sp. | 5 'GGCGCGCC 3 'CCGCGCGG | 5 '--- GG CGCGCC --- 3 ' 3 '--- CCGCGC GG --- 5 ' | PalAI, SgsI | ||
| AseI[53] | 96 | Aquaspirillum serpens | 5 'АТТААТ 3 'ТААТТА | 5 '--- В ТААТ --- 3 ' 3 '--- ТААТ ТА --- 5 ' | Асни, БпоАИ, ПшБИ, Сру4ДИ, ВспИ | |
| AseII[53] | 97 | Aquaspirillum serpens | 5 'CCSGG 3 'GGSCC | 5 '--- CC SGG --- 3 ' 3 '--- GGS CC --- 5 ' | AhaI, AsuC2I, BcnI, CauII, EcoHI, HgiS22I, Kpn49kII, Mgl14481I, NciI | |
| AsiI | Азотобактер sp. | 5 'GGATCC 3 'CCTAGG | 5 '--- G GATCC --- 3 ' 3 '--- CCTAG G --- 5 ' | ApaCI, BamHI, BnaI, Bsp4009I, BstI, OkrAI, Pfl8I, SurI, Uba4009I | ||
| AsiAI | 2853 | Артробактер sp. A7359 | 5 'ACCGGT 3 'TGGCCA | 5 '--- А CCGGT --- 3 ' 3 '--- TGGCC А --- 5 ' | AgeI, AsiGI, БшТИ, CsiAI, CspAI, PinAI | |
| AsiGI | 10828 | Артробактер sp. грамм | 5 'ACCGGT 3 'TGGCCA | 5 '--- А CCGGT --- 3 ' 3 '--- TGGCC А --- 5 ' | AgeI, AsiAI, БшТИ, CsiAI, CspAI, PinAI | |
| AsiSI | Артробактер sp. | 5 'GCGATCGC 3 'CGCTAGCG | 5 '--- GCGAT CGC --- 3 ' 3 '--- CGC TAGCG --- 5 ' | РГАИ, СфаАИ, , SgfI | ||
| Asi256I | 18472 | Артробактер sp. Ck256 | 5 'GATC 3 'CTAG | 5 '--- G ATC --- 3 ' 3 '--- CTA G --- 5 ' | Видеть этот сайт для полного списка. | |
| Asi372I | 15803 | Артробактер sp. Mn372 | 5 'ATGCAT 3 'ТАКГА | 5 '--- ATGCA Т --- 3 ' 3 '--- т ACGTA --- 5 ' | Ppu10I, EcoT22I, Mph1103I, NsiI, Zsp2I, BfrBI, Csp68KIII, PinBI, SepI, SspD5II | |
| AsnI[54] | 98 | Артробактер sp. N-CM | 5 'АТТААТ 3 'ТААТТА | 5 '--- В ТААТ --- 3 ' 3 '--- ТААТ ТА --- 5 ' | AseI, BpoAI, PshBI, Sru4DI, VspI | |
| AspI[55] | Ахромобактерии sp. 699 | 5 'GACNNNGTC 3 'CTGNNNCAG | 5 '--- GACN NNGTC --- 3 ' 3 '--- CTGNN NCAG --- 5 ' | AtsI, PflFI, PsyI, TelI, Tth111I | ||
| Asp10HI | Ацидифилиум sp. 10H | 5 'TTCGAA 3 'AAGCTT | 5 '--- ТТ CGAA --- 3 ' 3 '--- AAGC TT --- 5 ' | AsuII, BspT104I, BstBI, CbiI, Csp68KII, PlaII, PpaAI, Ssp1I | ||
| Asp10HII | 100 | Ацидифилиум sp. 10H | 5 'CCAN5TGG 3 'ГГТН5АКК | 5 '--- CCANNNN NTGG --- 3 ' 3 '--- GGTN NNNNACC --- 5 ' | AccB7I, AcpII, BasI, Esp1396I, PflBI, PflMI, Van91I | |
| Asp26HI | 111 | Ацидифилиум sp. 26H | 5 'GAATGC 3 'CTTACG | 5 '--- GAATGCN --- 3' 3 '--- CTTAC GN --- 5 ' | Asp27HI, Asp35HI, Asp36HI, BsaMI, BscCI, BsmI, PctI | |
| Asp27HI | 112 | Ацидифилиум sp. 27H | 5 'GAATGC 3 'CTTACG | 5 '--- GAATGCN --- 3' 3 '--- CTTAC GN --- 5 ' | Asp35HI, Asp36HI, Asp40HI, BmaHI, BsaMI, BscCI, BsmI | |
| Asp35HI | 117 | Ацидифилиум sp. 35H | 5 'GAATGC 3 'CTTACG | 5 '--- GAATGCN --- 3' 3 '--- CTTAC GN --- 5 ' | Asp36HI, Asp40HI, Asp50HI, BsaMI, BscCI, BsmI, Mva1269I | |
| Asp36HI | 118 | Ацидифилиум sp. 36H | 5 'GAATGC 3 'CTTACG | 5 '--- GAATGCN --- 3' 3 '--- CTTAC GN --- 5 ' | Asp40HI, Asp50HI, BmaHI, BscCI, BsmI, Mva1269I, PctI | |
| Asp40HI | 120 | Ацидифилиум sp. 40H | 5 'GAATGC 3 'CTTACG | 5 '--- GAATGCN --- 3' 3 '--- CTTAC GN --- 5 ' | Asp27HI, Asp36HI, Asp50HI, BsaMI, BscCI, BsmI, Mva1269I | |
| Asp50HI | 122 | Ацидифилиум sp. 50H | 5 'GAATGC 3 'CTTACG | 5 '--- GAATGCN --- 3' 3 '--- CTTAC GN --- 5 ' | Asp26HI, Asp35HI, Asp36HI, BsaMI, BscCI, BsmI, Mva1269I | |
| Asp700I[56] | Ахромобактерии sp. 700 | 5 'ГААН4TTC 3 'CTTN4AAG | 5 '--- ГААНН NNTTC --- 3 ' 3 '--- CTTNN NNAAG --- 5 ' | BbvAI, MroXI, PdmI, XmnI | ||
| Asp713I | 131 | Ахромобактерии sp. 713 | 5 'CTGCAG 3 'GACGTC | 5 '--- CTGCA G --- 3 ' 3 '--- G ACGTC --- 5 ' | AjoI, AliAJI, BloHII, CfrA4I, Ecl37kI, MhaAI, PstI, SflI, Srl5DI, YenI | |
| Asp718I[57] | Ахромобактерии sp. 718 | 5 'GGTACC 3 'CCATGG | 5 '--- G GTACC --- 3 ' 3 '--- CCATG G --- 5 ' | Acc65I, AhaB8I, КПНИ, SthI | ||
| Asp745I | Ахромобактерии sp. 745 | 5 'GGWCC 3 'CCWGG | 5 '--- G GWCC --- 3 ' 3 '--- CCWG G --- 5 ' | Bme18I, BsrAI, CauI, Eco47I, ErpI, FdiI, SinI, VpaK11AI, ВпаК11БИ | ||
| AspAI | Алкалигены sp. | 5 'GGTNACC 3 'CCANTGG | 5 '--- G GTNACC --- 3 ' 3 '--- CCANTG G --- 5 ' | AcrII, Bse64I, BseT10I, BstEII, BstPI, Eco91I, EcoO65I, PspEI | ||
| AspA2I | 6959 | Артробактер sp. A2 | 5 'CCTAGG 3 'GGATCC | 5 '--- С CTAGG --- 3 ' 3 '--- GGATC C --- 5 ' | AvrBII, AvrII, BlnI, BspA2I, XmaJI | |
| AspEI[58] | Ауреобактерии sp. | 5 'GACN5GTC 3 'CTGN5CAG | 5 '--- GACNNN NNGTC --- 3 ' 3 '--- CTGNN NNNCAG --- 5 ' | Ахди, BmeRI, BspOVI, DriI, Eam1105I, EclHKI, NruGI | ||
| AspHI[59] | Ахромобактерии sp. ЧАС | 5 'GWGCWC 3 'CWCGWG | 5 '--- GWGCW C --- 3 ' 3 '--- С WCGWG --- 5 ' | Alw21I, Bbv12I, Bsh45I, BsiHKAI, Бсм6И, HgiAI, MspV281I | ||
| AspLEI | Артробактер sp. LE3860 | 5 'GCGC 3 'CGCG | 5 '--- GCG C --- 3 ' 3 '--- С GCG --- 5 ' | BspLAI, BstHHI, CfoI, FnuDIII, HhaI, Hin6I, HinP1I, HsoI, HspAI, Наука | ||
| AspMI | 2977 | Acinetobacter sp. M | 5 'AGGCCT 3 'TCCGGA | 5 '--- AGG CCT --- 3 ' 3 '--- TCC GGA --- 5 ' | AatI, Eco147I, GdiI, PceI, SarI, Sru30DI, SseBI, SteI, StuI | |
| AspMDI | Алкалигены sp. MD1 | 5 'GATC 3 'CTAG | 5' --- GATC --- 3 ' 3 '--- CTAG --- 5' | BfuCI, Bsp143I, BstMBI, DpnII, Kzo9I, MboI, NdeII, Sau3AI | ||
| AspNI | Анабаена sp. J3 | 5 'GGNNCC 3 'CCNNGG | 5 '--- GGN NCC --- 3 ' 3 '--- CCN NGG --- 5 ' | BmiI, BscBI, BspLI, NlaIV, PspN4I | ||
| AspS9I | Артробактер sp. S9 | 5 'GGNCC 3 'CCNGG | 5 '--- G GNCC --- 3 ' 3 '--- CCNG G --- 5 ' | AsuI, AvcI, Bac36I, Bal228I, FmuI, NspIV, PspPI, Sau96I | ||
| AssI | 4930 | Артробактер sp. | 5 'АГТАКТ 3 'TCATGA | 5 '--- AGT ДЕЙСТВИЕ --- 3 ' 3 '--- TCA TGA --- 5 ' | Acc113I, BmcAI, Bpa34I, DpaI, Eco255I, RflFII, ScaI, ZrmI | |
| AstWI | Анабаена sp. | 5 'GRCGYC 3 'CYGCRG | 5 '--- GR CGYC --- 3 ' 3 '--- CYGC RG --- 5 ' | AcyI, AsuIII, BsaHI, BstACI, Hin1I, HgiI, HgiDI, HgiGI, Msp17I | ||
| AsuI[60] | Анабаена субцилиндрическая | 5 'GGNCC 3 'CCNGG | 5 '--- G GNCC --- 3 ' 3 '--- CCNG G --- 5 ' | AspS9I, AvcI, CcuI, Cfr13I, FmuI, MaeK81II, Nsp7121I, PspPI, UnbI | ||
| AsuII[61] | Анабаена субцилиндрическая | 5 'TTCGAA 3 'AAGCTT | 5 '--- ТТ CGAA --- 3 ' 3 '--- AAGC TT --- 5 ' | AcpI, Bpu14I, Bsp119I, BspT104I, Csp45I, FspII, LspI, NspV, SfuI | ||
| AsuIII | Анабаена субцилиндрическая | 5 'GRCGYC 3 'CYGCRG | 5 '--- GR CGYC --- 3 ' 3 '--- CYGC RG --- 5 ' | AcyI, AsuIII, BbiII, BsaHI, BstACI, Hin1I, HgiHII, Hsp92I, Msp17I | ||
| AsuC2I | 2901 | Actinobacillus suis C2 | 5 'CCSGG 3 'GGSCC | 5 '--- CC SGG --- 3 ' 3 '--- GGS CC --- 5 ' | AhaI, AseII, BcnI, Eco1831I, EcoHI, Kpn49kII, Mgl14481I, NciI | |
| AsuHPI[62] | 2811 | Actinobacillus suis HP | 5 'GGTGA 3 'CCACT | 5 '--- GGTGAN6NN --- 3' 3 '--- CCACTN6N N --- 5 ' | HphI, SspD5I | |
| AsuNHI[62] | Actinobacillus suis NH | 5 'GCTAGC 3 'CGATCG | 5 '--- G CTAGC --- 3 ' 3 '--- CGATC G --- 5 ' | AceII, BmtI, BspOI, LlaG2I, NheI, PstNHI | ||
| AtsI | Aureobacterium testaceum 4842 | 5 'GACNNNGTC 3 'CTGNNNCAG | 5 '--- GACN NNGTC --- 3 ' 3 '--- CTGNN NCAG --- 5 ' | AspI, PflFI, PsyI, TelI, Tth111I | ||
| AvaI[14][63][64] | Анабаена вариабилис | 5 'CYCGRG 3 'GRGCYC | 5 '--- С YCGRG --- 3 ' 3 '--- GRGCY C --- 5 ' | AquI, Ama87I, BsiHKCI, BsoBI, BspLU4I, Eco88I, NspIII, PlaAI | ||
| AvaII[12][14][41][63][64] | Анабаена вариабилис | 5 'GGWCC 3 'CCWGG | 5 '--- G GWCC --- 3 ' 3 '--- CCWG G --- 5 ' | Bme18I, Bme216I, BsrAI, Eco47I, Kzo49I, Psp03I, СмуЭИ, VpaK11AI | ||
| AvcI | Actinomyces violaceoniger cristalomycini | 5 'GGNCC 3 'CCNGG | 5 '--- G GNCC --- 3 ' 3 '--- CCNG G --- 5 ' | AspS9I, BshKI, BsiZI, Bsp1894I, BspBII, BspF4I, Bsu54I, Pde12I | ||
| AviII | Анабаена вариабиллис (алле) | 5 'TGCGCA 3 'ACGCGT | 5 '--- ТГК GCA --- 3 ' 3 '--- АЧГ CGT --- 5 ' | Acc16I, AosI, FdiII, FspI, MstI, NsbI, PamI, Pun14627I | ||
| AvrII[11][29] | 173 | Анабаена вариабилис UW | 5 'CCTAGG 3 'GGATCC | 5 '--- С CTAGG --- 3 ' 3 '--- GGATC C --- 5 ' | AspA2I, AvrBII, BlnI, BspA2I, XmaJI | |
| AvrBII | 171 | Arthrobacter variabilis | 5 'CCTAGG 3 'GGATCC | 5 '--- С CTAGG --- 3 ' 3 '--- GGATC C --- 5 ' | AspA2I, AvrII, BlnI, BspA2I, XmaJI | |
| AxyI[65] | 174 | Acetobacter xylinus | 5 'CCTNAGG 3 'GGANTCC | 5 '--- CC TNAGG --- 3 ' 3 '--- ГГАНТ CC --- 5 ' | AocI, BliHKI, Bse21I, BspR7I, Bsu36I, CvnI, Eco81I, Lmu60I |
§ Доступна HF-версия этого фермента.
Примечания
- ^ Смит Х.О., Натанс Д. (декабрь 1973 г.). «Письмо: Предлагаемая номенклатура для бактериальных систем модификации и рестрикции и их ферментов». J. Mol. Биол. 81 (3): 419–23. Дои:10.1016/0022-2836(73)90152-6. PMID 4588280.
- ^ Робертс Р.Дж., Белфорт М., Бестор Т., Бхагват А.С., Бикл Т.А., Битинаит Дж., Блюменталь Р.М., Дегтярев С.К., Драйден Д.Т., Дибвиг К., Фирман К., Громова Е.С., Гампорт Р.И., Халфорд С.Е., Хаттман С., Хейтман Дж., Хорнби Д.П. , Janulaitis A, Jeltsch A, Josephsen J, Kiss A, Klaenhammer TR, Kobayashi I, Kong H, Krüger DH, Lacks S, Marinus MG, Miyahara M, Morgan RD, Murray NE, Nagaraja V, Piekarowicz A, Pingoud A, Raleigh Э, Рао Д. Н., Райх Н., Репин В. Е., Селкер Э. С., Шоу П. К., Штейн Д. К., Стоддард Б. Л., Шибальский В., Траутнер Т. А., Ван Эттен Д. Л., Витор Д. М., Уилсон Г. Г., Сюй С.Ю. (апрель 2003 г.). «Номенклатура рестрикционных ферментов, ДНК-метилтрансфераз, самонаводящихся эндонуклеаз и их генов». Нуклеиновые кислоты Res. 31 (7): 1805–12. Дои:10.1093 / nar / gkg274. ЧВК 152790. PMID 12654995.
- ^ Джереми МБ, Джон LT, Люберт S (2002). «3. Структура и функции белка». Биохимия. Сан-Франциско: В. Х. Фриман. ISBN 0-7167-4684-0.
- ^ Анфинсен К. Б. (1973). «Принципы, регулирующие сворачивание белковых цепей». Наука. 181 (4096): 223–30. Bibcode:1973Sci ... 181..223A. Дои:10.1126 / science.181.4096.223. PMID 4124164.
- ^ Кесслер C, Манта V (август 1990 г.). «Специфичность рестрикционных эндонуклеаз и модификации ДНК метилтрансфераз - обзор (издание 3)». Ген. 92 (1–2): 1–248. Дои:10.1016 / 0378-1119 (90) 90486-Б. PMID 2172084.
- ^ Pingoud A, Jeltsch A (сентябрь 2001 г.). «Структура и функция эндонуклеаз рестрикции II типа». Нуклеиновые кислоты Res. 29 (18): 3705–27. Дои:10.1093 / nar / 29.18.3705. ЧВК 55916. PMID 11557805.
- ^ Григайте Р., Манелиене З., Янулайтис А. (ноябрь 2002 г.). "AarI, эндонуклеаза рестрикции из Arthrobacter aurescens SS2-322, который распознает новую непалиндромную последовательность 5'-CACCTGC (N) 4 / 8-3'". Нуклеиновые кислоты Res. 30 (21): 123e – 123. Дои:10.1093 / нар / gnf122. ЧВК 135850. PMID 12409482.
- ^ а б Sugisaki H, Maekawa Y, Kanazawa S, Takanami M (октябрь 1982 г.). "Новые эндонуклеазы рестрикции от Acetobacter aceti и Bacillus aneurinolyticus". Нуклеиновые кислоты Res. 10 (19): 5747–52. Дои:10.1093 / nar / 10.19.5747. ЧВК 320926. PMID 6292849.
- ^ Nwankwo DO, Maunus RE, Xu S. (январь 1997 г.). «Клонирование и экспрессия системы рестрикции-модификации AatII в кишечная палочка". Ген. 185 (1): 105–9. Дои:10.1016 / S0378-1119 (96) 00641-5. PMID 9034320.
- ^ а б Робертс Р.Дж. (январь 1983 г.). «Ферменты рестрикции и модификации и их последовательности распознавания». Нуклеиновые кислоты Res. 11 (1): r135–69. ЧВК 325705. PMID 6306557.
- ^ а б c d е ж Вэй Х, Терриен С., Бланшар А., Гуань С., Чжу З. (май 2008 г.). «Индекс верности обеспечивает систематическое количественное определение звездной активности эндонуклеаз рестрикции ДНК». Нуклеиновые кислоты Res. 36 (9): e50. Дои:10.1093 / nar / gkn182. ЧВК 2396408. PMID 18413342. S2CID 10463398.
- ^ а б c d Нишигаки К., Канеко Ю., Вакуда Х, Хусими Ю., Танака Т. (август 1985 г.). «Эндонуклеазы рестрикции типа II расщепляют однонитевые ДНК в целом». Нуклеиновые кислоты Res. 13 (16): 5747–60. Дои:10.1093 / nar / 13.16.5747. ЧВК 321909. PMID 2994012.
- ^ Шеной С., Дайгл К., Эрлих К.С., Герке К.В., Эрлих М. (июнь 1986 г.). «Гидролиз эндонуклеазами рестрикции по их последовательностям узнавания ДНК, замещенным несовпадающими парами оснований». Нуклеиновые кислоты Res. 14 (11): 4407–20. ЧВК 311455. PMID 3012472.
- ^ а б c d е Нельсон М., Христос К., Шильдкраут I (июль 1984 г.). «Изменение очевидной специфичности распознавания рестрикционной эндонуклеазы ДНК-метилазами». Нуклеиновые кислоты Res. 12 (13): 5165–73. Дои:10.1093 / nar / 12.13.5165. ЧВК 318911. PMID 6087274.
- ^ Нельсон П.С., Папас Т.С., Швайнфест CW (февраль 1993 г.). «Расщепление эндонуклеазой рестрикции гемиметилированной ДНК 5-метил-дезоксицитозина при высоких соотношениях фермента и субстрата». Нуклеиновые кислоты Res. 21 (3): 681–6. Дои:10.1093 / nar / 21.3.681. ЧВК 309169. PMID 8441677.
- ^ Кита К., Хираока Н., Кимидзука Ф., Обаяси А. (1984). «Определение сайта расщепления рестрикционного фермента AccII с использованием синтетического олигонуклеотида». Agric Biol Chem. 48 (2): 531–2. Дои:10.1271 / bbb1961.48.531.
- ^ Кита К., Хираока Н., Осима А., Кадониси С., Обаяси А. (декабрь 1985 г.). «AccIII, новая эндонуклеаза рестрикции из Acinetobacter calcoaceticus». Нуклеиновые кислоты Res. 13 (24): 8685–94. Дои:10.1093 / nar / 13.24.8685. ЧВК 318944. PMID 3001647.
- ^ Bath AJ, Milsom SE, Gormley NA, Halford SE (февраль 2002 г.). «Многие эндонуклеазы рестрикции типа II взаимодействуют с двумя сайтами узнавания перед расщеплением ДНК». J Biol Chem. 277 (6): 4024–33. Дои:10.1074 / jbc.M108441200. PMID 11729187.
- ^ Причодько Г.Г., Речнукова Н.И., Репин В.Е., Дегтярев С.К. (1991). «Определение субстратной специфичности эндонуклеазы рестрикции Acc65I». Сиб Биол Дж. 1: 59–60.
- ^ «Скрининг штаммов, продуцирующих эндонуклеазы рестрикции, в озере Байкал». Изв Сиб Отд Акад Наук СССР. 1: 35–37. 1990.
- ^ Абдурашитов М.А., Киселева Е.В., Мякишева Т.В., Дедков В.С., Шевченко А.В., Дегтярев С.К. (сентябрь – октябрь 1997 г.). «AccBSI - новая эндонуклеаза рестрикции из Acinetobacter calcoaceticus BS (статья на русском языке)». Прикл Биохим Микробиол. 33 (5): 556–8 (Перевод на английский на с. 496–8). PMID 9441298.
- ^ Polisson C, Morgan RD (октябрь 1990 г.). "AciI, уникальная эндонуклеаза рестрикции из Arthrobacter citreus, которая распознает 5 'CCGC3'". Нуклеиновые кислоты Res. 18 (19): 5911. Дои:10.1093 / nar / 18.19.5911. ЧВК 332357. PMID 2170952.
- ^ Дегтярев С.К., Абдурашитов М.А., Колыхалов А.А., Речкунова Н.И. (июль 1992 г.). "AclI, новая эндонуклеаза рестрикции из Acinetobacter calcoaceticus, распознающая 5'-AA ^ CGTT-3'". Нуклеиновые кислоты Res. 20 (14): 3787. Дои:10.1093 / nar / 20.14.3787. ЧВК 334039. PMID 1322531.
- ^ Дегтярев С.К., Колыхалов А.А., Речкунова Н.И., Абдурашитов М.А. (июль 1992 г.). «AcsI, новая эндонуклеаза рестрикции из Arthrobacter citreus 310, распознающая 5'-Pu, снижает AATTPy-3'". Нуклеиновые кислоты Res. 20 (14): 3789. Дои:10.1093 / nar / 20.14.3789. ЧВК 334041. PMID 1322532.
- ^ де Ваард А., Корсуиз Дж., ван Беверен С. П., Маат Дж. (декабрь 1978 г.). «Новая специфическая для последовательности эндонуклеаза из Anabaena cylindrica». FEBS Lett. 96 (1): 106–10. Дои:10.1016/0014-5793(78)81072-2. PMID 103749.
- ^ Доу Д., Инагати К., Кита К., Охима А., Хираока Н., Кишимото Н., Сугио Т., Тано Т. (сентябрь 1989 г.). «Эндонуклеаза рестрикции AfaI из Acidiphilium facilis, новый изошизомер RsaI: очистка и свойства». Biochim Biophys Acta. 1009 (1): 83–6. Дои:10.1016/0167-4781(89)90082-1. PMID 2790034.
- ^ Macícková-Cahová H, Hocek M (декабрь 2009 г.). «Расщепление аденин-модифицированной функционализированной ДНК эндонуклеазами рестрикции типа II». Нуклеиновые кислоты Res. 37 (22): 7612–22. Дои:10.1093 / нар / gkp845. ЧВК 2794189. PMID 19820117. S2CID 17925157.
- ^ а б c Уайтхед PR, Браун Н.Л. (апрель 1985 г.). «Три эндонуклеазы рестрикции из Anabaena flos-aquae». J Gen Microbiol. 131 (4): 951–8. Дои:10.1099/00221287-131-4-951. PMID 2985742.
- ^ а б c Rowland GC, Lim PP, Glass RE (июль 1992 г.). "'«Эндонуклеазы рестрикции, специфичные для стоп-кодонов: их использование для картирования и манипуляции с генами». Ген. 116 (1): 21–6. Дои:10.1016 / 0378-1119 (92) 90624-Х. PMID 1628840.
- ^ а б c Робертс Р.Дж. (март 1982 г.). «Ферменты рестрикции и модификации и их последовательности распознавания». Нуклеиновые кислоты Res. 10 (5): r117–44. Дои:10.1093 / nar / 10.5.1770. ЧВК 320569. PMID 6280143.
- ^ Ямада Y, Мидзуно Х, Сато Х, Акагава М, Ямасато К. (1989). «Новая эндонуклеаза рестрикции из Agrobacterium gelatinovorum, морской агробактерии (AgeI)». Agric Biol Chem. 53 (6): 1747–9. Дои:10.1271 / bbb1961.53.1747.
- ^ Соколов Н.Н. (1995). «Поиск, изоляция и изучение ограничений». Вестн Росс Акад Мед Наук (2): 47–51. PMID 7756931.
- ^ Уайтхед PR, Браун Н.Л. (июль 1982 г.). «AhaIII: эндонуклеаза рестрикции с последовательностью узнавания, содержащей только пары оснований A: T». FEBS Lett. 143 (2): 296–300. Дои:10.1016/0014-5793(82)80120-8. PMID 6288466.
- ^ Маркс П., МакГихан Дж, Уилсон Дж., Эррингтон Н., Нил Дж. (Июнь 2003 г.). «Очистка и характеристика новой ДНК-метилтрансферазы M.AhdI». Нуклеиновые кислоты Res. 31 (11): 2803–10. Дои:10.1093 / nar / gkg399. ЧВК 156732. PMID 12771207.
- ^ Богданова Э., Джорджевич М., Папапанагиоту И., Хейдук Т., Книле Г., Северинов К. (март 2008 г.). «Регуляция транскрипции системы рестрикции-модификации типа II AhdI». Нуклеиновые кислоты Res. 36 (5): 1429–42. Дои:10.1093 / нар / гкм1116. ЧВК 2275141. PMID 18203750. S2CID 5338430.
- ^ Цеснавичене Э., Петрусите М., Казлаускене Р., Манелиене З., Тиминскас А., Лубис А., Янулайтис А. (ноябрь 2001 г.). «Характеристика АлоИ, системы ограничения-модификации нового типа». Дж Мол Биол. 314 (2): 205–16. Дои:10.1006 / jmbi.2001.5049. PMID 11718555.
- ^ Юренайте-Урбанавичене С., Серкснайте Дж., Крюкиене Э., Гедриене Дж., Венцловас С., Лубис А. (июнь 2007 г.). «Создание специфичности расщепления ДНК эндонуклеаз рестрикции типа II путем перегруппировки целевых доменов узнавания». Proc Natl Acad Sci USA. 104 (25): 10358–63. Bibcode:2007PNAS..10410358J. Дои:10.1073 / pnas.0610365104. ЧВК 1965518. PMID 17553965.
- ^ Blakesley RW, Wells RD (октябрь 1975 г.). "'Одноцепочечная ДНК от phiX174 и M13 расщепляется определенными эндонуклеазами рестрикции ». Природа. 257 (5525): 421–2. Bibcode:1975Натура.257..421Б. Дои:10.1038 / 257421a0. PMID 809717. S2CID 24619091.
- ^ Робертс Р.Дж., Майерс П.А., Моррисон А., Мюррей К. (март 1976 г.). "Специфическая эндонуклеаза из Arthrobacter luteus". Дж Мол Биол. 102 (1): 157–65. Дои:10.1016/0022-2836(76)90079-6. PMID 1271462.
- ^ Грин П.Дж., Хейнекер Х.Л., Боливар Ф., Родригес Р.Л., Бетлах М.С., Коваррубиас А.А., Бакман К., Рассел Д.Д., Тейт Р., Бойер Х.В. (июль 1978 г.). «Общий метод очистки рестрикционных ферментов». Нуклеиновые кислоты Res. 5 (7): 2373–80. Дои:10.1093 / nar / 5.7.2373. ЧВК 342170. PMID 673857.
- ^ а б Хуанг Л.Х., Фарнет К.М., Эрлих К.С., Эрлих М. (март 1982 г.). «Переваривание сильно модифицированной ДНК бактериофага рестрикционными эндонуклеазами». Нуклеиновые кислоты Res. 10 (5): 1579–91. Дои:10.1093 / nar / 10.5.1579. ЧВК 320551. PMID 6280151.
- ^ Битинаит Дж., Манелиене З., Менкявичюс С., Климасаускас С., Буткус В., Янулайтис А. (октябрь 1992 г.). «Alw26I, Eco31I и Esp3I - метилтрансферазы типа II, модифицирующие цитозин и аденин в комплементарных цепях целевой ДНК». Нуклеиновые кислоты Res. 20 (19): 4981–5. Дои:10.1093 / nar / 20.19.4981. ЧВК 334273. PMID 1408816.
- ^ Морган Р.Д., Далтон М., Стоте Р. (сентябрь 1987 г.). "Уникальная эндонуклеаза рестрикции типа II от Acinetobacter lwoffi N ". Нуклеиновые кислоты Res. 15 (17): 7201. Дои:10.1093 / nar / 15.17.7201. ЧВК 306225. PMID 2821501.
- ^ Инагаки К., Хикита Т., Янагидани С., Номура Ю., Кисимото Н., Тано Т., Танака Х. (октябрь 1993 г.). «Эндонуклеаза рестрикции Aor13HI из Acidiphilium organovorum 13H, новый изошизомер BspMII: очистка и характеристика». Biosci Biotechnol Biochem. 57 (10): 1716–21. Дои:10.1271 / bbb.57.1716. PMID 7764267.
- ^ Сагава Х., Такаги М., Номура Ю., Инагаки К., Тано Т, Кисимато Н., Котани Х., Накадзима К. (январь 1992 г.). «Выделение и идентификация эндонуклеазы рестрикции Aor51HI из Acidiphilium organovorum 51H ". Нуклеиновые кислоты Res. 20 (2): 365. Дои:10.1093 / nar / 20.2.365. ЧВК 310379. PMID 1741262.
- ^ Серинк Дж., Ван, де Вурд А., Ван Монтегю М. (июль 1983 г.). "Новая эндонуклеаза рестрикции от Acetobacter pasteurianus". Нуклеиновые кислоты Res. 11 (13): 4409–15. Дои:10.1093 / nar / 11.13.4409. ЧВК 326055. PMID 6306590.
- ^ Гронес Дж., Турна Дж. (Март 1993 г.). «Некоторые свойства рестрикционной эндонуклеазы ApaBI от Acetobacter pasteurianus". Biochim Biophys Acta. 1162 (3): 323–5. Дои:10.1016/0167-4838(93)90297-5. PMID 8457597.
- ^ Сюй С.Ю., Сяо Дж. П., Эттвиллер Л., Холден М., Алиотта Дж., Пох К.Л., Далтон М., Робинсон Д. П., Петронцио Т. Р., Моран Л., Ганатра М., Уэр Дж., Слатко Б., Беннер Дж. (Ноябрь 1998 г.). «Клонирование и экспрессия систем рестрикционной модификации ApaLI, NspI, NspHI, SacI, ScaI и SapI в кишечная палочка". Мол Джен Генет. 260 (2–3): 226–31. Дои:10.1007 / s004380050890. PMID 9862476. S2CID 2275352.
- ^ Ся Й, Ван Эттен Дж. Л., Добос П., Линг Ю. Ю., Крелл П. Дж. (Октябрь 1993 г.). «Экспрессия аденин-ДНК-метилтрансферазы M.CviRI ускоряет апоптоз в клетках насекомых, инфицированных бакуловирусом». Вирусология. 196 (2): 817–24. Дои:10.1006 / viro.1993.1539. PMID 8372450.
- ^ Каварабаяси Й, Хино Й, Хорикава Х, Ямадзаки С., Хайкава Й, Дзин-но К., Такахаши М, Секин М, Баба С., Анкай А, Косуги Х, Хосояма А, Фукуи С, Нагай Й, Нисидзима К., Накадзава Х, Такамия М., Масуда С., Фунахаши Т., Танака Т., Кудох Й, Ямазаки Дж., Кусида Н., Огучи А., Аоки К., Кубота К., Накамура И., Номура Н., Сако Ю., Кикучи Х (апрель 1999 г.). "Полная последовательность генома аэробного гипертермофильного кренархея, Аэропирум перникс K1 ". ДНК Res. 6 (2): 83–101, 145–52. Дои:10.1093 / днарес / 6.2.83. PMID 10382966.
- ^ Полиссон С., Робинсон Д. (июнь 1992 г.). "ApoI, уникальная эндонуклеаза рестрикции из Arthrobacter protophormiae который распознает 5 'RAATTY-3'". Нуклеиновые кислоты Res. 20 (11): 2888. Дои:10.1093 / nar / 20.11.2888. ЧВК 336940. PMID 1614876.
- ^ Билкок Д.Т., Дэниэлс Л.Э., Бат А.Дж., Халфорд С.Е. (декабрь 1999 г.). «Реакции эндонуклеаз рестрикции типа II с сайтами узнавания из 8 пар оснований». J Biol Chem. 274 (51): 36379–86. Дои:10.1074 / jbc.274.51.36379. PMID 10593932.
- ^ а б Polisson C, Morgan RD (ноябрь 1988 г.). "AseI, эндонуклеаза рестрикции из Aquaspirillum serpens который распознает 5'AT — TAAT3'". Нуклеиновые кислоты Res. 16 (21): 10365. Дои:10.1093 / нар / 16.21.10365. ЧВК 338867. PMID 3264065.
- ^ Rexer BU, Jarsch M, Sagmeister C, Glück B, Berger G, Kessler C (август 1988 г.). "AsnI: новая эндонуклеаза рестрикции класса II от Артробактер sp., штамм N-CM, распознающий 5'-AT / TAAT-3'". FEBS Lett. 235 (1–2): 241–6. Дои:10.1016/0014-5793(88)81271-7. PMID 2841156.
- ^ Болтон Б.Дж., Шмитц Г.Г., Ярш М., Кесслер С. (июнь 1990 г.). "AspI, новый изошизомер Tth111I из Ахромобактерии вид 699, распознающий 5'-GACN / NNGTC-3'". Нуклеиновые кислоты Res. 18 (11): 3422. Дои:10.1093 / nar / 18.11.3422. ЧВК 330974. PMID 2162524.
- ^ Болтон Б.Дж., Комер М., Кесслер С. (ноябрь 1989 г.). "Asp700I, новый изошизомер XmnI из Ахромобактерии виды 700, распознающие 5'-GAANN / NNTTC-3'". Нуклеиновые кислоты Res. 17 (21): 8879. Дои:10.1093 / nar / 17.21.8879. ЧВК 335071. PMID 2587236.
- ^ Mural RJ (ноябрь 1987 г.). «Расщепление рестрикционной эндонуклеазой Asp718, изошизомером KpnI, чувствительно к кишечная палочка Метилирование Dcm ". Нуклеиновые кислоты Res. 15 (21): 9085. Дои:10.1093 / nar / 15.21.9085. ЧВК 306431. PMID 2825125.
- ^ Фрей Б., Калуца К., Ауэр Дж., Стратидакис И., Рина М., Буриотис В., Шмитц Г. (июль 1992 г.). "AspEI, новый изошизомер Eam11051 из Ауреобактерии виды, распознающие 5'-GACnnn / nnGTC-3'". Нуклеиновые кислоты Res. 20 (14): 3782. Дои:10.1093 / nar / 20.14.3782. ЧВК 334034. PMID 1641345.
- ^ Болтон Б.Дж., Хёлтке Х.Дж., Шмитц Г.Г., Ярш М., Кесслер С. (ноябрь 1989 г.). "AspHI, новый изошизомер HgiAI из Ахромобактерии вид H, распознающий 5'-GWGCW / C-3'". Нуклеиновые кислоты Res. 17 (22): 9500. Дои:10.1093 / nar / 17.22.9500. ЧВК 335177. PMID 2587281.
- ^ Хьюз С.Г., Брюс Т., Мюррей К. (январь 1980 г.). «Выделение и характеристика специфической для последовательности эндонуклеазы из Анабаена субцилиндрическая". Biochem J. 185 (1): 59–63. Дои:10.1042 / bj1850059. ЧВК 1161269. PMID 6246880.
- ^ Робертс Р.Дж. (март 1980 г.). «Ферменты рестрикции и модификации и их последовательности узнавания». Ген. 8 (4): 329–43. Дои:10.1016/0378-1119(80)90040-2. PMID 6245015.
- ^ а б Дедков В.С., Дегтярев С.К. (апрель – май 1998 г.). "Актинобациллы и Стрептококк: продуценты изошизомеров эндонуклеаз рестрикции R.HphI, R.SauI, R.NheI, R.MboI и R.SwaI ». Биол Хим. 379 (4–5): 573–4. PMID 9628357.
- ^ а б Канеко Т., Накамура И., Волк С.П., Куриц Т., Сасамото С., Ватанабе А., Иригути М., Исикава А., Кавасима К., Кимура Т., Кишида Ю., Кохара М., Мацумото М., Мацуно А., Мураки А., Накадзаки Н., Шимпо С , Сугимото М., Такадзава М., Ямада М., Ясуда М., Табата С. (октябрь 2001 г.). "Полная геномная последовательность нитчатой азотфиксирующей цианобактерии. Анабаена sp. штамм PCC 7120 ". ДНК Res. 8 (5): 227–53. Дои:10.1093 / днарес / 8.5.205. PMID 11759840.
- ^ а б Хьюз С.Г., Мюррей К. (январь 1980 г.). «Нуклеотидные последовательности, распознаваемые эндонуклеазами AvaI и AvaII из Анабаена вариабилис". Biochem J. 185 (1): 65–75. Дои:10.1042 / bj1850065. ЧВК 1161270. PMID 6246881.
- ^ Йошиока Х, Накамура Х, Сасаки Дж, Тахара И, Ямада Й (1983). «Очистка, свойства и узнаваемая последовательность сайт-специфической эндонуклеазы рестрикции от»Acetobacter xylinus"". Agric Biol Chem. 47 (12): 2871–9. Дои:10.1271 / bbb1961.47.2871.