WikiDer > Список сайтов разрезания рестрикционных ферментов: Bsp – Bss - Википедия
List of restriction enzyme cutting sites: Bsp–Bss - Wikipedia
| Легенда о азотистые основания | |
|---|---|
| Код | Нуклеотид представлен |
| А | Аденин (А) |
| C | Цитозин (С) |
| грамм | Гуанин (ГРАММ) |
| Т | Тимин (Т) |
| N | A, C, G или T |
| M | А или С |
| р | A или G |
| W | А или Т |
| Y | C или T |
| S | C или G |
| K | G или T |
| ЧАС | A, C или T |
| B | C, G или T |
| V | A, C или G |
| D | A, G или T |
В этой статье содержится список наиболее изученных рестрикционных ферментов, названия которых начинаются с Bsp до Bss включительно. Он содержит около 180 ферментов.
Приведена следующая информация:
- Фермент: Принятое название молекула, согласно международно принятой номенклатура[1][2], и библиографические ссылки. (Дальнейшее чтение: см. Раздел "Номенклатура"в статье"Фермент рестрикции".)
- Код PDB: Код, используемый для определения структуры белка в PDB база данных белковых структур. Трехмерная атомная структура белка предоставляет очень ценную информацию для понимания внутренних деталей механизма его действия.[3][4].
- Источник: Организм, который естественным образом производит фермент.
- Последовательность распознавания: Последовательность ДНК, распознаваемая ферментом и с которой он специфически связывается.
- Резать: Участок разреза и продукты ДНК разреза. В последовательность распознавания и место разрезания обычно совпадают, но иногда сайт разреза может находиться на расстоянии нескольких десятков нуклеотидов от сайта распознавания[5][6].
- Изошизомеры и неошизомеры: An изошизомер является фермент который распознает ту же последовательность, что и другой. А неошизомер представляет собой особый тип изошизомера, который распознает одну и ту же последовательность, но разрезает другим способом. Для каждого фермента указано не более 8-10 наиболее распространенных изошизомеров, но их может быть намного больше. Неошизомеры выделены жирным шрифтом зеленого цвета (например: BamHI). Когда "Нет на Дата", это означает, что на эту дату в базах данных не было зарегистрированных изошизомеров с четко определенным участком разрезания. Изошизомеры, указанные белым шрифтом и серым фоном, соответствуют ферментам, не указанным в текущих списках:
как в этом не перечисленном ферменте: EcoR70I
Ферменты рестрикции
Bsp
| Фермент | Код PDB | Источник | Последовательность распознавания | Резать | Изошизомеры | ||||||
| Bsp6I | Бациллы sp. RFL6 | 5 'GCNGC 3 'CGNCG | 5 '--- GC NGC --- 3 ' 3 '--- CGN CG --- 5 ' | ||||||||
| Bsp13I | Бациллы sp. 13 | 5 'TCCGGA 3 'AGGCCT | 5 '--- т CCGGA --- 3 ' 3 '--- AGGCC Т --- 5 ' | AccIII, BbvAIII, BlfI, BsiMI, BspMII, Bsu23I, Kpn2I, PinBII | |||||||
| Bsp19I | Бациллы sp. 19 | 5 'CCATGG 3 'GGTACC | 5 '--- С CATGG --- 3 ' 3 '--- GGTAC C --- 5 ' | ||||||||
| Bsp24I | Бациллы sp. 24 | 5 'GACN6TGG 3 'CTGN6АКК | 5 '--- GACN6TGGN6NNNNNN --- 3' 3 '--- CTGN6ACCN6N NNNNN --- 5 ' | ||||||||
| Bsp50I | Бациллы sp. RFL50 | 5 футов CGCG 3 'GCGC | 5 '--- CG CG --- 3 ' 3 '--- GC GC --- 5 ' | BceBI, Bsh1236I, BstFNI, BstUI, Bsu1532I, FalII, FnuDII, MvnI, ThaI | |||||||
| Bsp63I | Bacillus sphaericus 63 | 5 'CTGCAG 3 'GACGTC | 5 '--- CTGCA G --- 3 ' 3 '--- G ACGTC --- 5 ' | AjoI, Asp713I, BloHII, MhaAI, Pfl21I, PstI, SalPI, SflI, Sst12I, YenI | |||||||
| Bsp67I | Bacillus sphaericus 67 | 5 'GATC 3 'CTAG | 5' --- GATC --- 3 ' 3 '--- CTAG --- 5' | AspMDI, Bsp143I, BspJI, BtkII, DpnII, LlaAI, NlaII, SsiBI | |||||||
| Bsp68I | Бациллы sp. RFL68 | 5 'TCGCGA 3 'AGCGCT | 5 '--- TCG CGA --- 3 ' 3 '--- AGC GCT --- 5 ' | NruI | |||||||
| Bsp98I | Бациллы sp. RFL98 | 5 'GGATCC 3 'CCTAGG | 5 '--- G GATCC --- 3 ' 3 '--- CCTAG G --- 5 ' | AccEBI, AliI, BamHI, BnaI, BstI, CelI, OkrAI, NspSAIV, Pfl8I, SurI | |||||||
| Bsp105I | Bacillus sphaericus 105 | 5 'GATC 3 'CTAG | 5' --- GATC --- 3 ' 3 '--- CTAG --- 5' | Bfi57I, Bsp143I, BspJI, BtkII, DpnII, LlaAI, NlaII, SsiBI | |||||||
| Bsp106I | Bacillus sphaericus 106 | 5 'ATCGAT 3 'ТАГКТА | 5 '--- В CGAT --- 3 ' 3 '--- TAGC ТА --- 5 ' | BbvAII, Bci29I, BciBI, BcmI, BspOVII, BstNZ169I, Rme21I | |||||||
| Bsp119I | Бациллы sp. RFL119 | 5 'TTCGAA 3 'AAGCTT | 5 '--- ТТ CGAA --- 3 ' 3 '--- AAGC TT --- 5 ' | AcpI, Bim19I, Bpu14I, BspT104I, Csp45I, FspII, NspV, SspRFI | |||||||
| Bsp120I | Бациллы sp. RFL120 | 5 'GGGCCC 3 'CCCGGG | 5 '--- G GGCCC --- 3 ' 3 '--- CCCGG G --- 5 ' | Апай, PpeI, ПспОМИ | |||||||
| Bsp123I | Бациллы sp. 123 | 5 футов CGCG 3 'GCGC | 5 '--- CG CG --- 3 ' 3 '--- GC GC --- 5 ' | BceBI, Bsh1236I, BstFNI, BstUI, BtkI, Csp68KVI, FnuDII, MvnI, ThaI | |||||||
| Bsp143I | Бациллы sp. RFL143 | 5 'GATC 3 'CTAG | 5' --- GATC --- 3 ' 3 '--- CTAG --- 5' | Bce243I, Bsp105I, BspFI, БстКТИ, CpfI, HacI, NdeII, Sth368I, Sau3AI | |||||||
| Bsp143II | Бациллы sp. RFL143 | 5 'RGCGCY 3 'YCGCGR | 5 '--- RGCGC Y --- 3 ' 3 '--- Y CGCGR --- 5 ' |
| |||||||
| Bsp211I | Bacillus sphaericus 211 | 5 'GGCC 3 'CCGG | 5 '--- GG CC --- 3 ' 3 '--- CC GG --- 5 ' | ||||||||
| Bsp423I | Бациллы sp. 423 | 5 'GCAGC 3 'CGTCG | 5 '--- GCAGCN7N NNNN --- 3 ' 3 '--- CGTCGN7NNNNN --- 5' | AlwXI, BbvI, BseKI, BseXI, Bst12I, Bst71I, BstV1I | |||||||
| Bsp519I | Бациллы sp. 519 | 5 'GRGCYC 3 'CYCGRG | 5 '--- GRGCY C --- 3 ' 3 '--- С YCGRG --- 5 ' | ||||||||
| Bsp1286I | Bacillus sphaericus | 5 'ГДГЧК 3 'CHCGDG | 5 '--- ГДГЧ C --- 3 ' 3 '--- С HCGDG --- 5 ' | AocII, BmyI, BsoCI, Bsp1286I, BspLS2I, NspII, SduI | |||||||
| Bsp1407I | Bacillus stearothermophilus RFL1407 | 5 'TGTACA 3 'ACATGT | 5 '--- т GTACA --- 3 ' 3 '--- ACATG Т --- 5 ' |
| |||||||
| Bsp1720I | Бациллы sp. 1720 | 5 'GCTNAGC 3 'CGANTCG | 5 '--- GC TNAGC --- 3 ' 3 '--- CGANT CG --- 5 ' | ||||||||
| Bsp1894I | Bacillus sphaericus 1894 | 5 'GGNCC 3 'CCNGG | 5 '--- G GNCC --- 3 ' 3 '--- CCNG G --- 5 ' | AspS9I, Bac36I, BavBII, BshKI, BspBII, CcuI, MaeK81II, Pde12I | |||||||
| Bsp2095I | Bacillus sphaericus 2095 | 5 'GATC 3 'CTAG | 5' --- GATC --- 3 ' 3 '--- CTAG --- 5' | Bfi57I, Bsp143I, BspKT6I, BtkII, DpnII, LlaAI, NlaII, SsiBI | |||||||
| Bsp4009I | Бациллы sp. 4009 | 5 'GGATCC 3 'CCTAGG | 5 '--- G GATCC --- 3 ' 3 '--- CCTAG G --- 5 ' | AccEBI, AliI, ApaCI, BamHI, BstI, CelI, OkrAI, Pfl8I, RspLKII, SurI | |||||||
| BspAI | Bacillus sphaericus JL4B | 5 'GATC 3 'CTAG | 5' --- GATC --- 3 ' 3 '--- CTAG --- 5' | Bfi57I, Bsp2095I, BspKT6I, BtkII, DpnII, LlaAI, NlaII, SsiBI | |||||||
| BspA2I | Бациллы sp. A2 | 5 'CCTAGG 3 'GGATCC | 5 '--- С CTAGG --- 3 ' 3 '--- GGATC C --- 5 ' | AspA2I, AvrII, AvrBII, BlnI, XmaJI | |||||||
| Bsp153AI | Бациллы sp. 153A | 5 'CAGCTG 3 'GTCGAC | 5 '--- CAG CTG --- 3 ' 3 '--- GTC GAC --- 5 ' | ||||||||
| BspAAI | Бациллы sp. AA | 5 'CTCGAG 3 'GAGCTC | 5 '--- С TCGAG --- 3 ' 3 '--- GAGCT C --- 5 ' | AbrI, BluI, BstVI, PanI, SauLPII, Наука, SlaI, StrI, TliI | |||||||
| BspAAII | Бациллы sp. AA | 5 'TCTAGA 3 'АГАТКТ | 5 '--- т CTAGA --- 3 ' 3 '--- АГАТЦ Т --- 5 ' | ||||||||
| BspAAIII | Бациллы sp. AA | 5 'GGATCC 3 'CCTAGG | 5 '--- G GATCC --- 3 ' 3 '--- CCTAG G --- 5 ' | AccEBI, AliI, ApaCI, AsiI, BamHI, Bce751I, Pfl8I, RspLKII, SolI | |||||||
| BspANI | Бациллы sp. AN | 5 'GGCC 3 'CCGG | 5 '--- GG CC --- 3 ' 3 '--- CC GG --- 5 ' | ||||||||
| BspBI | Bacillus sphaericus JL14 | 5 'CTGCAG 3 'GACGTC | 5 '--- CTGCA G --- 3 ' 3 '--- G ACGTC --- 5 ' | AjoI, ApiI, Asp713I, BloHII, CfrA4I, Pfl21I, PstI, SalPI, Sst12I, YenI | |||||||
| BspBII | Bacillus sphaericus JL14 | 5 'GGNCC 3 'CCNGG | 5 '--- G GNCC --- 3 ' 3 '--- CCNG G --- 5 ' | AsuI, Bac36I, BavBII, BshKI, BspF4I, CcuI, MaeK81II, PspPI | |||||||
| BspBRI | Бациллы sp. | 5 'GGCC 3 'CCGG | 5 '--- GG CC --- 3 ' 3 '--- CC GG --- 5 ' | ||||||||
| BspBS31I | Бациллы sp. BS31 | 5 'GAAGAC 3 'CTTCTG | 5 '--- GAAGACNN NNNN --- 3 ' 3 '--- CTTCTGNNNNNN --- 5' | ||||||||
| BspCI | Бациллы sp. C1 | 5 'CGATCG 3 'GCTAGC | 5 '--- CGAT CG --- 3 ' 3 '--- GC TAGC --- 5 ' | Afa16RI, Afa22MI, EagBI, ErhB9I, NblI, Psu161I, RshI, XorII | |||||||
| BspCNI | Бациллы sp. 1310 | 5 'CTCAG 3 'GAGTC | 5 '--- CTCAGN6NNN --- 3' 3 '--- GAGTCN6N NN --- 5 ' | ||||||||
| BspDI | Бациллы sp. | 5 'ATCGAT 3 'ТАГКТА | 5 '--- В CGAT --- 3 ' 3 '--- TAGC ТА --- 5 ' | AagI, BanIII, BavCI, Bsa29I, BseCI, Bsu15I, BsuTUI, ClaI, ZhoI | |||||||
| BspD6I [7][8] | 2П14 | Бациллы sp. D6 | 5 'GACTC 3 'CTGAG | 5 '--- GACTCNNNN NN --- 3 ' 3 '--- CTGAGNNNNNN --- 5' | |||||||
| BspEI | Бациллы sp. | 5 'TCCGGA 3 'AGGCCT | 5 '--- т CCGGA --- 3 ' 3 '--- AGGCC Т --- 5 ' | AccIII, BlfI, BsiMI, Bsp13I, BspMII, CauB3I, MroI, PinBII | |||||||
| BspFI | Бациллы sp. | 5 'GATC 3 'CTAG | 5' --- GATC --- 3 ' 3 '--- CTAG --- 5' | Bfi57I, Bsp2095I, BspKT6I, BtkII, DpnII, LlaAI, NlaII, SsiBI | |||||||
| BspF4I | Бациллы sp. F4 | 5 'GGNCC 3 'CCNGG | 5 '--- G GNCC --- 3 ' 3 '--- CCNG G --- 5 ' | AsuI, Bac36I, BavBII, BsiZI, BspBII, CcuI, MaeK81II, PspPI | |||||||
| BspHI | Бациллы sp. H3 | 5 'TCATGA 3 'АГТАКТ | 5 '--- т CATGA --- 3 ' 3 '--- АГТАК Т --- 5 ' | ||||||||
| BspIS4I | Бациллы sp. IS4 | 5 'GAAGAC 3 'CTTCTG | 5 '--- GAAGACNN NNNN --- 3 ' 3 '--- CTTCTGNNNNNN --- 5' | ||||||||
| BspJI | Бациллы sp. | 5 'GATC 3 'CTAG | 5' --- GATC --- 3 ' 3 '--- CTAG --- 5' | BfuCI, Bsp2095I, BspKT6I, BtkII, DpnII, LlaAI, NmeCI, SsiAI | |||||||
| BspJII | Бациллы sp. | 5 'ATCGAT 3 'ТАГКТА | 5 '--- В CGAT --- 3 ' 3 '--- TAGC ТА --- 5 ' | Bsa29I, BseCI, Bsp106I, BspDI, BspOVII, BspXI, BspZEI | |||||||
| БспКИ | Бациллы sp. K | 5 'GGCC 3 'CCGG | 5 '--- GG CC --- 3 ' 3 '--- CC GG --- 5 ' | ||||||||
| BspKT5I | Бациллы sp. | 5 'CTGAAG 3 'GACTTC | 5 '--- CTGAAGN12NNNN --- 3' 3 '--- GACTTCN12NN NN --- 5 ' | ||||||||
| BspKT6I | Бациллы sp. КТ6 | 5 'GATC 3 'CTAG | 5 '--- GAT C --- 3 ' 3 '--- С ТЕГ --- 5 ' | BfuCI, Bsp2095I, Bst19II, БстКТИ, ДПНИИ, LlaAI, NmeCI, SsiAI | |||||||
| BspKT8I | Бациллы sp. KT8 | 5 'AAGCTT 3 'TTCGAA | 5 '--- А AGCTT --- 3 ' 3 '--- TTCGA А --- 5 ' | ||||||||
| BspLI | Бациллы sp. RJ3-212 | 5 'GGNNCC 3 'CCNNGG | 5 '--- GGN NCC --- 3 ' 3 '--- CCN NGG --- 5 ' |
| |||||||
| BspLAI | Бациллы sp. ЛА | 5 'GCGC 3 'CGCG | 5 '--- GCG C --- 3 ' 3 '--- С GCG --- 5 ' | AspLEI, BstHHI, CfoI, FnuDIII, HhaI, Hin6I, HinP1I, HsoI, HspAI, Наука | |||||||
| BspLAII | Бациллы sp. ЛА | 5 'TTCGAA 3 'AAGCTT | 5 '--- ТТ CGAA --- 3 ' 3 '--- AAGC TT --- 5 ' | ||||||||
| BspLAIII | Бациллы sp. ЛА | 5 'AAGCTT 3 'TTCGAA | 5 '--- А AGCTT --- 3 ' 3 '--- TTCGA А --- 5 ' | ||||||||
| BspLS2I | Бациллы sp. LS2 | 5 'ГДГЧК 3 'CHCGDG | 5 '--- ГДГЧ C --- 3 ' 3 '--- С HCGDG --- 5 ' | AocII, BmyI, BsoCI, BspLS2I, MhlI, NspII, SduI | |||||||
| BspLU4I | Бациллы sp. LU4 | 5 'CYCGRG 3 'GRGCYC | 5 '--- С YCGRG --- 3 ' 3 '--- GRGCY C --- 5 ' | Ama87I, AvaI, Bse15I, BsoBI, BstSI, NspIII, NspSAI, OfoI | |||||||
| BspLU11I | Бациллы sp. LU11 | 5 'ACATGT 3 'TGTACA | 5 '--- А CATGT --- 3 ' 3 '--- TGTAC А --- 5 ' | ||||||||
| BspLU11III | Бациллы sp. LU11 | 5 'GGGAC 3 'CCCTG | 5 '--- GGGACN8NN NNNN --- 3 ' 3 '--- CCCTGN8NNNNNN --- 5' | ||||||||
| BspMI | Бациллы sp. M | 5 'ACCTGC 3 'TGGACG | 5 '--- ACCTGCNNNN NNNN --- 3 ' 3 '--- TGGACGNNNNNNNN --- 5' | Acc36I, BfuAI, BveI | |||||||
| BspMII | Бациллы sp. M | 5 'TCCGGA 3 'AGGCCT | 5 '--- т CCGGA --- 3 ' 3 '--- AGGCC Т --- 5 ' | AccIII, BbvAIII, BlfI, BsiMI, BspEI, Bsu23I, CauB3I, MroI | |||||||
| BspM39I | Бациллы sp. M39 | 5 'CAGCTG 3 'GTCGAC | 5 '--- CAG CTG --- 3 ' 3 '--- GTC GAC --- 5 ' | ||||||||
| BspM90I | Бациллы sp. M90 | 5 'GTATAC 3 'CATATG | 5 '--- GTA TAC --- 3 ' 3 '--- КОШКА ПТГ --- 5 ' | ||||||||
| BspMAI | Bacillus stearothermophilus MA | 5 'CTGCAG 3 'GACGTC | 5 '--- CTGCA G --- 3 ' 3 '--- G ACGTC --- 5 ' | AjoI, Asp713I, BloHII, PaePI, Psp23I, PstI, SalPI, Sst12I, YenI | |||||||
| БспМКИ | Бациллы sp. МКИ | 5 'GTCGAC 3 'CAGCTG | 5 '--- G TCGAC --- 3 ' 3 '--- CAGCT G --- 5 ' | ||||||||
| БспНИ | Бациллы sp. N | 5 'CCWGG 3 'GGWCC | 5 '--- CC WGG --- 3 ' 3 '--- GGW CC --- 5 ' | AglI, BseBI, Bse17I, Bst2I, CbrI, CthII, ЭкоРИИ, MvaI, SspAI, TaqXI | |||||||
| BspO4I | Бациллы sp. О-4 | 5 'CAGCTG 3 'GTCGAC | 5 '--- CAG CTG --- 3 ' 3 '--- GTC GAC --- 5 ' | ||||||||
| BspOVI | Бациллы sp. OV | 5 'GACN5GTC 3 'CTGN5CAG | 5 '--- GACNNN NNGTC --- 3 ' 3 '--- CTGNN NNNCAG --- 5 ' |
| |||||||
| BspOVII | Бациллы sp. OV | 5 'ATCGAT 3 'ТАГКТА | 5 '--- В CGAT --- 3 ' 3 '--- TAGC ТА --- 5 ' | BanIII, BavCI, BciBI, BcmI, Bli86I, BliRI, BspJII, BstNZ169I, SpmI | |||||||
| BspPI | Бациллы sp. д 1-34 | 5 'GGATC 3 'CCTAG | 5 '--- GGATCNNNN N --- 3 ' 3 '--- CCTAGNNNNN --- 5' |
| |||||||
| BspRI | Bacillus sphaericus р | 5 'GGCC 3 'CCGG | 5 '--- GG CC --- 3 ' 3 '--- CC GG --- 5 ' | ||||||||
| BspR7I | Бациллы sp. R7 | 5 'CCTNAGG 3 'GGANTCC | 5 '--- CC TNAGG --- 3 ' 3 '--- ГГАНТ CC --- 5 ' | AocI, AxyI, Bse21I, Bsu36I, Eco81I, MstII, SauI, SshAI | |||||||
| BspST5I | Бациллы sp. ST5 | 5 'GCATC 3 'CGTAG | 5 '--- GCATCN4N NNNN --- 3 ' 3 '--- CGTAGN4NNNNN --- 5' | ||||||||
| БСПТИ | Бациллы sp. RFL1265 | 5 'CTTAAG 3 'GAATTC | 5 '--- С TTAAG --- 3 ' 3 '--- ГААТТ C --- 5 ' | AflII | |||||||
| BspT104I | Бациллы sp. T104 | 5 'TTCGAA 3 'AAGCTT | 5 '--- ТТ CGAA --- 3 ' 3 '--- AAGC TT --- 5 ' | AcpI, Bim19I, Bpu14I, BstBI, Csp45I, LspI, NspV, SspRFI | |||||||
| BspT107I | Бациллы sp. T107 | 5 'GGYRCC 3 'CCRYGG | 5 '--- G GYRCC --- 3 ' 3 '--- CCRYG G --- 5 ' | AccB1I, BanI, BbvBI, Eco64I, HgiCI, HgiHI, MspB4I, PfaAI | |||||||
| BspTNI | Бациллы sp. TN | 5 'GGTCTC 3 'CCAGAG | 5 '--- GGTCTCN NNNN --- 3 ' 3 '--- CCAGAGNNNNN --- 5' | ||||||||
| BspTS514I | Бациллы sp. TS514 | 5 'GAAGAC 3 'CTTCTG | 5 '--- GAAGACNN NNNN --- 3 ' 3 '--- CTTCTGNNNNNN --- 5' | ||||||||
| BspWI | Бациллы sp. 3456 | 5 'GCN7GC 3 'CGN7CG | 5 '--- GCNNNNN NNGC --- 3 ' 3 '--- CGNN NNNNNCG --- 5 ' | ||||||||
| BspXI | Bacillus sphaericus Икс | 5 'ATCGAT 3 'ТАГКТА | 5 '--- В CGAT --- 3 ' 3 '--- TAGC ТА --- 5 ' | BliAI, BliRI, BscI, Bst28I, Bsu15I, LcaI, PgaI, Ssp27144I, ZhoI | |||||||
| BspXII | Bacillus sphaericus Икс | 5 'ТГАТКА 3 'ACTAGT | 5 '--- т GATCA --- 3 ' 3 '--- ACTAG Т --- 5 ' |
| |||||||
| BspZEI | Бациллы sp. ZE | 5 'ATCGAT 3 'ТАГКТА | 5 '--- В CGAT --- 3 ' 3 '--- TAGC ТА --- 5 ' | Bsa29I, BseCI, BspDI, BspXI, Bst28I, BstNZ169I, BsuTUI, LplI | |||||||
БСР - БСС
| Фермент | Код PDB | Источник | Последовательность распознавания | Резать | Изошизомеры | ||||||
| BsrI | Bacillus stearothermophilus | 5 'ACTGG 3 'TGACC | 5 '--- ACTGGN --- 3' 3 '--- TGAC CN --- 5 ' | ||||||||
| БсрАИ | Bacillus stearothermophilus CPW7 | 5 'GGWCC 3 'CCWGG | 5 '--- G GWCC --- 3 ' 3 '--- CCWG G --- 5 ' | BamNxI, BcuAI, Csp68KI, Eco47I, FssI, HgiCII, HgiJI, SinI | |||||||
| БСРБИ | Bacillus stearothermophilus CPW193 | 5 'CCGCTC 3 'GGCGAG | 5 '--- CCG CTC --- 3 ' 3 '--- GGC GAG --- 5 ' | AccBSI, BstD102I, Bst31NI, MbiI | |||||||
| БсрБРИ | Bacillus stearothermophilus BR | 5 'ГАТН4УВД 3 'CTAN4ТЕГ | 5 '--- ГАТНН NNATC --- 3 ' 3 '--- CTANN NNTAG --- 5 ' | ||||||||
| BsrDI | Bacillus stearothermophilus D70 | 5 'GCAATG 3 'CGTTAC | 5 '--- GCAATGNN --- 3' 3 '--- CGTTAC NN --- 5 ' | ||||||||
| БСРФИ | Bacillus stearothermophilus CPW16 | 5 'RCCGGY 3 'YGGCCR | 5 '--- R CCGGY --- 3 ' 3 '--- YGGCC R --- 5 ' | ||||||||
| БСРГИ | Bacillus stearothermophilus GR75 | 5 'TGTACA 3 'ACATGT | 5 '--- т GTACA --- 3 ' 3 '--- ACATG Т --- 5 ' |
| |||||||
| БСРСИ | Bacillus stearothermophilus CPW19 | 5 'ACTGG 3 'TGACC | 5 '--- ACTGGN --- 3' 3 '--- TGAC CN --- 5 ' | ||||||||
| BssAI | Бациллы sp. | 5 'RCCGGY 3 'YGGCCR | 5 '--- R CCGGY --- 3 ' 3 '--- YGGCC R --- 5 ' | ||||||||
| BssECI | Bacillus stearothermophilus EC | 5 'CCNNGG 3 'GGNNCC | 5 '--- С CNNGG --- 3 ' 3 '--- GGNNC C --- 5 ' | ||||||||
| BssHI | Bacillus stearothermophilus H3 | 5 'CTCGAG 3 'GAGCTC | 5 '--- С TCGAG --- 3 ' 3 '--- GAGCT C --- 5 ' | AbrI, BluI, BstVI, PanI, SauLPII, Наука, SlaI, StrI, TliI | |||||||
| BssHII | Bacillus stearothermophilus H3 | 5 'GCGCGC 3 'CGCGCG | 5 '--- G CGCGC --- 3 ' 3 '--- CGCGC G --- 5 ' | ||||||||
| BssIMI | Bacillus stearothermophilus Я | 5 'GGGTC 3 'CCCAG | 5 '--- GG GTC --- 3 ' 3 '--- CCCAG --- 5' | ||||||||
| БссКИ | Bacillus stearothermophilus TBI | 5 'CCNGG 3 'GGNCC | 5' --- CCNGG --- 3 ' 3 '--- GGNCC --- 5' | ||||||||
| BssNAI | Bacillus stearothermophilus NA | 5 'GTATAC 3 'CATATG | 5 '--- GTA TAC --- 3 ' 3 '--- КОШКА ПТГ --- 5 ' | ||||||||
| БссНИ | Bacillus sphaericus KTN | 5 футов GRCGYC 3 'CYGCRG | 5 '--- GR CGYC --- 3 ' 3 '--- CYGC RG --- 5 ' | AcyI, AhaII, AosII, AstWI, AsuIII, BsaHI, HgiI, Hsp92I, Msp17I | |||||||
| BssSI | Bacillus stearothermophilus S719 | 5 'CACGAG 3 'GTGCTC | 5 '--- С ACGAG --- 3 ' 3 '--- GTGCT C --- 5 ' | ||||||||
| BssT1I | Bacillus stearothermophilus Т1 | 5 'CCWWGG 3 'GGWWCC | 5 '--- С CWWGG --- 3 ' 3 '--- GGWWC C --- 5 ' | ||||||||
Примечания
- ^ Смит Х.О., Натанс Д. (декабрь 1973 г.). «Письмо: Предлагаемая номенклатура для бактериальных систем модификации и рестрикции и их ферментов». J. Mol. Биол. 81 (3): 419–23. Дои:10.1016/0022-2836(73)90152-6. PMID 4588280.
- ^ Робертс Р.Дж., Белфорт М., Бестор Т., Бхагват А.С., Бикл Т.А., Битинаит Дж., Блюменталь Р.М., Дегтярев С.К., Драйден Д.Т., Дибвиг К., Фирман К., Громова Е.С., Гампорт Р.И., Халфорд С.Е., Хаттман С., Хейтман Дж., Хорнби Д.П. , Janulaitis A, Jeltsch A, Josephsen J, Kiss A, Klaenhammer TR, Kobayashi I, Kong H, Krüger DH, Lacks S, Marinus MG, Miyahara M, Morgan RD, Murray NE, Nagaraja V, Piekarowicz A, Pingoud A, Raleigh Э, Рао Д. Н., Райх Н., Репин В. Е., Селкер ЕС, Шоу П. К., Штейн Д. К., Стоддард Б. Л., Шибальский В., Траутнер Т. А., Ван Эттен Д. Л., Витор Д. М., Уилсон Г. Г., Сюй С.Ю. (апрель 2003 г.) «Номенклатура рестрикционных ферментов, ДНК-метилтрансфераз, самонаводящихся эндонуклеаз и их генов». Нуклеиновые кислоты Res. 31 (7): 1805–12. Дои:10.1093 / nar / gkg274. ЧВК 152790. PMID 12654995.
- ^ Джереми МБ, Джон LT, Люберт S (2002). «3. Структура и функции белка». Биохимия. Сан-Франциско: В. Х. Фриман. ISBN 0-7167-4684-0.
- ^ Анфинсен К. Б. (1973). «Принципы, регулирующие сворачивание белковых цепей». Наука. 181 (4096): 223–30. Дои:10.1126 / science.181.4096.223. PMID 4124164.
- ^ Кесслер C, Манта V (август 1990 г.). «Специфичность рестрикционных эндонуклеаз и модификации ДНК метилтрансфераз - обзор (издание 3)». Ген. 92 (1–2): 1–248. Дои:10.1016 / 0378-1119 (90) 90486-Б. PMID 2172084.
- ^ Pingoud A, Jeltsch A (сентябрь 2001 г.). «Структура и функция эндонуклеаз рестрикции II типа». Нуклеиновые кислоты Res. 29 (18): 3705–27. Дои:10.1093 / nar / 29.18.3705. ЧВК 55916. PMID 11557805.
- ^ Качалова Г.С., Рогулин Е.А., Юнусова А.К., Артюх Р.И., Перевязова Т.А., Матвиенко Н.И., Железная Л.А., Бартуник HD (декабрь 2008 г.). «Структурный анализ эндонуклеазы рестрикции гетеродимерного типа IIS R.BspD6I, действующей как комплекс между мономерной сайт-специфической никазой и каталитической субъединицей». Дж Мол Биол. 384 (2): 489–502. Дои:10.1016 / j.jmb.2008.09.033. PMID 18835275.
- ^ Качалова Г.С., Рогулин Е.А., Юнусова А.К., Артюх Р.И., Перевязова Т.А., Матвиенко Н.И., Железная Л.А., Бартуник HD (сентябрь 2007 г.). «Кристаллизация и предварительный рентгеноструктурный анализ малой субъединицы гетеродимерной эндонуклеазы рестрикции R.BspD6I». Acta Crystallogr F. 63 (Пт 9): 795–7. Дои:10.1107 / S174430910704016X. ЧВК 2376331. PMID 17768358.