WikiDer > MORT (длинная некодирующая РНК)

MORT (long non-coding RNA)
ZNF667-AS1
Идентификаторы
ПсевдонимыZNF667-AS1, MORT, антисмысловая РНК 1 ZNF667 (голова к голове)
Внешние идентификаторыГенные карты: ZNF667-AS1
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_198879

н / д

RefSeq (белок)

н / д

н / д

Расположение (UCSC)н / дн / д
PubMed поиск[1]н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

СМЕРТЬ (Транскрипт РНК Mortal Obligate (также известный как ZNF667-AS1)) это длинная некодирующая РНК (днРНК) межгенного типа (линкРНК), характерный для людей и человекообразных обезьян.[2] В СМЕРТЬ транскрипт продуцируется во всех типах смертных клеток, но теряется в значительной части наиболее распространенных видов рака человека и, следовательно, может иметь опухолевый супрессивный функция.

Геномное расположение

В СМЕРТЬ ген расположен на хромосома человека 19, на позиции 56 989 000–57 007 000 (hg19) в кластере генов цинковых пальцев (гены ZNF). В СМЕРТЬ ген состоит из 2 экзоны, 260 и 1270 п.н. соответственно, которые разделены интрон. Большая часть второго СМЕРТЬ экзон образован повторяющимися элементами - двумя LINE и элементом LTR.[2]В СМЕРТЬ промоутер расположен в Остров CpG который делится с ZNF667 ген; два гена расположены в ориентации голова к голове друг с другом. Несмотря на СМЕРТЬ расположение гена внутри кластера генов ZNF, СМЕРТЬ ген не гомологичен каким-либо генам ZNF. В то время СМЕРТЬ ген находится в ориентации голова к голове с ZNF667, СМЕРТЬ не перекрывает ZNF667 ген, и при этом он не имеет антисмысловой гомологии с ZNF667, поэтому официально используемый символ ZNF667-AS1 несколько вводит в заблуждение.

Эволюция

СМЕРТЬ имеет ортологи только в большие обезьянышимпанзе, гориллы и орангутаны, а данные экспрессии РНК указывают на то, что СМЕРТЬ транскрипт экспрессируется у этих видов.[2] Таким образом, с филогенетической точки зрения, СМЕРТЬ вероятно, молодой ген lincRNA, возникший во время эволюции человекообразных обезьян. Возможно, что большая продолжительность жизни человекообразных обезьян потребовала эволюции дополнительных генов с активностью подавления опухолей, и что СМЕРТЬ вот такой пример.

Молчание при раке

СМЕРТЬ экспрессируется во всех 16 нормальных тканях человека, о которых сообщается в Иллюмина данные карты тела,[3] как и все in vitro проанализированные культивированные штаммы клеток человека с конечной продолжительностью жизни. В отличие, СМЕРТЬ Экспрессия генов теряется в большом проценте раковых опухолей человека и линий раковых клеток человека. Использование данных о человеческих раковых заболеваниях, собранных в TCGA, СМЕРТЬ Экспрессия РНК и Метилирование ДНК состояние были оценены по 10 наиболее распространенным раковым заболеваниям у мужчин и 10 наиболее распространенным раковым заболеваниям у женщин.[4] (всего 17 различных типов рака по классификации TCGA). Анализ показывает, что СМЕРТЬ Экспрессия гена подавляется гиперметилированием ДНК его промотора CpG-островка в большинстве образцов опухолей человека в 15 из этих 17 видов рака человека.[2]

15 типов опухолей, где СМЕРТЬ часто заглушают острый миелоидный лейкоз, уротелиальная карцинома мочевого пузыря, инвазивная карцинома груди, аденокарцинома толстой кишки, плоскоклеточный рак головы и шеи, почечная светлоклеточная карцинома почки, папиллярно-клеточная карцинома почки, гепатоцеллюлярная карцинома печени, аденокарцинома легких, плоскоклеточный рак легкого, лимфоидное новообразование диффузная В-крупноклеточная лимфома, аденокарцинома поджелудочной железы, аденокарцинома прямой кишки, кожная меланома кожи, и Карцинома тела матки эндометрия.[2] MORT не используется при раке шейки матки и поэтому может служить независимым прогностический фактор с низкой экспрессией MORT может быть связано с уменьшением общей выживаемости.[5]

Поскольку бессмертие клеток является обязательным признаком раковой клетки и СМЕРТЬ был обнаружен как цель эпигенетического молчания на границе перехода человеческих клеток с конечной продолжительностью жизни от смертных к бессмертным, MORT’s эпигенетическая инактивация может создавать клеточное состояние, допускающее иммортализацию клеток, и предполагает возможный механизм подавления опухоли. СМЕРТЬДействие. Если это предсказание верно, то эпигенетическое молчание СМЕРТЬ должно быть ранним идентифицируемым поражением во время канцерогенеза у человека и, по прогнозам, возникнет при предраковых поражениях, когда клетки приобрели патологическое бессмертие на своем пути к злокачественной трансформации. Действительно, недавние исследования показали, что СМЕРТЬ эпигенетически замалчивается в обоих DCIS, предраковое поражение инвазивного рака молочной железы и аденомы толстой кишки, предраковое поражение аденокарциномы толстой кишки.[6] Кроме того, эпигенетическое молчание СМЕРТЬ связан с люминальным раком груди, положительным по рецепторам гормонов, сверхэкспрессией онкогена CCND1, и GATA3 мутации, но отрицательно коррелирует с p53 мутации.[6] Таким образом, аберрантное эпигенетическое молчание, опосредованное гиперметилированием ДНК. СМЕРТЬ происходит рано во время человеческого канцерогенез очевидно совпадает с тем, когда смертная клетка патологически переходит в бессмертную клетку.

Сотовая функция

Точная молекулярная функция СМЕРТЬ остается загадочным; однако известно, что СМЕРТЬ обнаруживается преимущественно в цитоплазме клетки при центрифугировании с дифференциальной плотностью, показывающим, что СМЕРТЬ обогащен фракцией 100 000 г, которая содержит полисомы, микросомы, эндоплазматический ретикулум и плазматическую мембрану.[7] Доказательства растут, что СМЕРТЬ действует как регулятор трансляции белков за счет взаимодействия с белками, связывающими РНК.

Рекомендации

  1. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  2. ^ а б c d е Vrba L, Garbe JC, Stampfer MR, Futscher BW (2015). «ЛинкРНК связана с гибелью клеток и подавляется эпигенетически при большинстве распространенных раковых заболеваний человека». Эпигенетика. 10 (11): 1074–1083. Дои:10.1080/15592294.2015.1106673. ЧВК 4844203. PMID 26646903.
  3. ^ "Выражение MORT в картографических данных Illumina Body".
  4. ^ "Факты и цифры о раке" (PDF). Атланта: Американское онкологическое общество. 2015 г.
  5. ^ Чжао Л.П., Ли РХ, Хан ДМ, Чжан XQ, Нянь Джи, Ву МХ, Фэн Й, Чжан Л., Сунь З.Г. (2017). «Независимый прогностический фактор низкоэкспрессируемой LncRNA ZNF667-AS1 для рака шейки матки и ингибиторной функции в отношении пролиферации рака шейки матки». Европейский обзор медицинских и фармакологических наук. 21 (23): 5353–5360. Дои:10.26355 / eurrev_201712_13920. PMID 29243775.
  6. ^ а б Vrba L, Futscher BW (июнь 2017 г.). «Эпигенетическое замалчивание СМОРТ является ранним событием при раке и связано с подтипами опухолей молочной железы с положительными рецепторами просвета». Журнал рака груди. 20 (2): 198–202. Дои:10.4048 / jbc.2017.20.2.198. ЧВК 5500404. PMID 28690657.
  7. ^ Лодиш Х, Берк А, Зипурски С.Л., Мацудаира П., Балтимор Д., Дарнелл Дж. (2000). Молекулярная клеточная биология (4-е изд.). Нью-Йорк: У. Х. Фриман. ISBN 978-0-7167-3136-8.