WikiDer > Ногаламицин
 | |
| Идентификаторы | |
|---|---|
3D модель (JSmol) | |
| ЧЭБИ | |
| ChemSpider | |
| ECHA InfoCard | 100.162.283  |
PubChem CID | |
| UNII | |
| |
| |
| Характеристики | |
| C39ЧАС49НЕТ16 | |
| Молярная масса | 787,80 г / моль |
| Опасности | |
| Главный опасности | кардиотоксический |
| Родственные соединения | |
Родственные соединения | меногарил |
Если не указано иное, данные для материалов приведены в их стандартное состояние (при 25 ° C [77 ° F], 100 кПа). | |
 проверять (что   ?) | |
| Ссылки на инфобоксы | |
Ногаламицин является антрациклин антибиотик, вырабатываемый почвой бактерии Streptomyces nogalater. Он обладает противоопухолевыми свойствами, но также очень кардиотоксичен. Менее кардиотоксичный полусинтетический аналог меногарил был разработан в 1970-х годах. В настоящее время ногаламицин и меногарил клинически не применяются.[1]
Биосинтез
Биосинтез антрациклина включает построение ядра агликона (посредством поликетидсинтаза II типа), к которому присоединены один или несколько остатков сахара. Ногаламицин состоит из трех компонентов:
- ногаламицинон (черный), ядро агликона
- ногалоза (пурпурный)
- ногаламин (зеленый)
Каждый компонент строится отдельно, а затем лигируется двумя гликозилтрансферазами.[2] Все механизмы, связанные с биосинтезом ногаламицина, расположены в одном кластере биосинтетических генов С. ногалатер.
Биосинтез ногаламицинона
Путь биосинтеза к агликоновому ядру ногаламицина был определен путем сочетания биоинформатического анализа и клонирования отдельных компонентов пути биосинтеза.[3][4][5] Биосинтетический путь аналогичен пути аклавинона (агликоновое ядро большинства антрациклинов, включая доксорубицин), единственное отличие состоит в том, что первая ацильная группа, которая загружается в PKS, представляет собой ацетат, а не пропионат. Следующие гены участвуют в биосинтезе основных видов ногаламицинона:[3][6]
- snoa1 (кетосинтаза-α)
- snoa2 (фактор длины цепи кетосинтазы-β)
- snoa3 (белок-носитель ацила)
- snoaD (кеторедуктаза)
- snoаЕ (ароматаза)
- snoAM (циклаза)
- snoaB (оксигеназа)
- snoаС (метилтрансфераза)
- snoaL (циклаза)
- snoaF (кеторедуктаза)
Биосинтез ногаламина и ногалозы
Фрагменты сахара, которые присоединены к ногаламицинону, производятся из глюкозо-1-фосфат. Хотя шаги, следующие за dTDP-4-кето-6-дезоксиглюкозой, не были подтверждены in vitro, высокая степень сходства последовательностей с гомологичными ферментами других организмов предполагает, что механизм действует, как показано справа.[7] В биосинтезе ногаламина и ногалозы участвуют следующие ферменты:[6]
- snogJ (dTDP-глюкозосинтаза)
- snogK (4,6-дегидратаза)
- snogF (3,5-эпимераза)
- snogH (2,3-дегидратаза)
- snogN (неизвестно)
- snogI (аминотрансфераза)
- snogG (кеторедуктаза)
- snogC (кеторедуктаза)
- snogA (N-метилтрансфераза)
- snogX (N-метилтрансфераза)
- snogG2 (C-метилтрансфераза)
Обратите внимание, что хотя большая часть литературы относится к конечной, перметилированной углеводной части как «ногалоза»,[8] более свежие данные предполагают, что ногалозный фрагмент на ногаламицине метилируется после гликозилирования ядра ногаламицинона.[2]
Гликозилирование и адаптация ногаламицинона
Наиболее примечательным аспектом структуры ногаламицина является двойное присоединение ногаламина как через О-гликозилирование, а также через углерод-углеродную связь в положении C2 ядра ногаламицинона,[2] Следующие ферменты участвуют в финальных этапах адаптации ногаламицина. СноN и snoT - это гены в кластере генов ногаламицина, которые могут катализировать окончательное гидроксилирование:
- snogE (гликозилтрансфераза)
- snoaL2 (гидроксилаза)
- snogY (O-метилтрансфераза)
- snogM (предполагаемая O-метилтрансфераза)
- snogL (предполагаемая O-метилтрансфераза)
- snogD (гликозилтрансфераза)
- snoN / T
Рекомендации
- ^ НОГАЛАМИЦИН. ChemicalBook.com. По состоянию на 28 ноября 2012 г.
- ^ а б c Siitonen, V. et al. Идентификация стадий позднего гликозилирования в биосинтетическом пути антрациклина ногаламицина. ХимБиоХим 13, 120–128 (2011).
- ^ а б Torkkell, S. et al. Полный кластер биосинтетических генов ногаламицина Streptomyces nogalater: характеристика области ДНК размером 20 т.п.н. и создание гибридных структур. Mol Gen Genomics 266, 276–288 (2001).
- ^ Räty, K. et al. Клонирование и характеристика кластера поликетидсинтазы (PKS) Streptomyces galilaeus aclacinomycins. Gene 293, 115–122 (2002).
- ^ Мется-Кетеля, М., Палму, К., Куннари, Т., Юлихонко, К. и Мянцяля, П. Разработка биосинтеза антрациклинов в отношении ангуциклинов. Антимикробный. Агенты Chemother. 47, 1291–1296 (2003).
- ^ а б Султана, А. Механистические взгляды на биосинтез поликетидных антибиотиков. (2006).
- ^ К. Харель, М., Лиан, Х. и Рор, Дж. Характеристика пути биосинтеза TDP-d-равидозамина: ферментативный синтез TDP-d-равидозамина из тимидин-5-фосфата и глюкозо-1-фосфата . Органическая и биомолекулярная химия 9, 1799–1808 (2011).
- ^ Дюшан Д. Дж., Вили П. Ф., Сюн В. и Чидестер С. Г. Структура, абсолютная конфигурация и химический состав ногалозы. J. Org. Chem. 36, 2670–2673 (1971).
 | Этот противоинфекционный препарат, средство, медикамент статья - это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |