WikiDer > Ортобунявирус - Википедия
Ортобунявирус | |
---|---|
Структура ортобунявируса (слева); трансмиссионная электронная микрофотография из Вирус калифорнийского энцефалита (верно) | |
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Область: | Рибовирия |
Королевство: | Орторнавиры |
Тип: | Негарнавирикота |
Учебный класс: | Ellioviricetes |
Заказ: | Буньявиралес |
Семья: | Peribunyaviridae |
Род: | Ортобунявирус |
Типовой вид | |
Ортобуньявирус Буньямвера | |
Разновидность[1] | |
Ортобунявирус это род из Peribunyaviridae семья[2] в порядке Буньявиралес. В настоящее время известно около 170 вирусов этого рода. Всего насчитывается 97 видов.[1] и 20 серогрупп.
Название Ортобунявирус происходит от Буньямвера, Уганда,[3] где оригинал типовой вид Ортобуньявирус Буньямвера был впервые обнаружен,[4] вместе с префиксом Ортопеды (ορϑοϛ), что означает «прямой».[5]
В типовой вид является Ортобуньявирус Буньямвера.
Эпидемиология
Наиболее разнообразен род по Африка, Австралия и Океания, но встречается почти во всем мире. Самый ортобуньявирус разновидность передаются комары и вызывают болезни крупный рогатый скот.[нужна цитата] В Вирус калифорнийского энцефалита, то Вирус Ла Кросса и Вирус Джеймстаунского каньона находятся североамериканский виды, которые вызывают энцефалит в людях.
Вирусология
- Типовой вид Ортобуньявирус Буньямвера.[6]
- Вирус имеет сферическую форму, диаметр от 80 до 120 нм, и состоит из трех одноцепочечных молекул РНК с отрицательным смыслом, инкапсулированных в рибонуклеокапсид.[7]
- Три РНК обозначены как S, M и L (для малых, средних и больших) и имеют длину около 1 килобаз, 4,5 и 6,9 килобайт.[8][7][9]
- S-РНК кодирует белок нуклеокапсида (белок N) и неструктурный белок (белок NS).[10]
- М РНК кодирует полипротеин, который расщепляется протеазой хозяина на белки Gn, NSm и Gc.[7]
- L-РНК кодирует вирусную РНК-зависимую РНК-полимеразу или L-белок.[11]
Жизненный цикл
Векторы
Первичные переносчики ортобуньявирусов: гематофаг насекомые Culicidae семья, в том числе представители ряда родов комаров (в том числе Aedes, Coquillettidia, Culex, Кулисета, и Анофелес) и мокрецов (таких как Куликоидес параенсис).[12][9] Хотя также возможна передача клещами и постельными клопами. Предпочтение вирусных векторов обычно строгое, только один или очень небольшое количество векторов передают конкретный вирус в регионе, даже если несколько вирусов и векторов перекрываются.[13] Организмы, относящиеся к предпочтительному переносчику, могут переносить вирус, но не могут передавать его компетентно.[9]
Членистоногие-переносчики заражаются вирусом, питаясь кровью инфицированного хозяина. У комаров репликация ортобуньявирусов усиливается за счет иммуномодуляции, которая возникает в результате переваривания белков крови, производящих ГАМК и активация ГАМКергической передачи сигналов.[14] Инфекция передается новому хозяину через вирусные частицы в слюне переносчиков.[14] Ортобунявирусная инфекция в членистоногие клетки до конца не изучены, но обычно не являются цитопатологическими и вредные эффекты минимальны.[15][13] Зараженные комары могут улучшить физическую форму.[13] Трансорвариальная передача наблюдалась среди москитов, инфицированных ортобуньявирусами калифорнийской серогруппы.[9] Подобно комарам, кровью питаются только самки куликоидных мошек; они предпочитают кормление в помещении, особенно во время дождя.[9]
Хосты Sylvatic Cycle
в сливатический цикл, вирусы передаются между млекопитающими-хозяевами посредством членистоногих векторов. В качестве хозяев или резервуаров ортобуньявирусов был идентифицирован широкий круг млекопитающих, включая приматов, ленивцев, диких и домашних птиц, мартышек, грызунов и крупных млекопитающих, таких как олени, лоси и лоси.[12][9]
Инфекционное заболевание
Заражение начинается с укуса инфицированного компетентного переносчика. Проникновение вируса происходит посредством рецептор-опосредованного (клатрин-зависимого) эндоцитоза, но рецепторы неизвестны.[15] Несмотря на то что, Гепаран сульфат и DC-SIGN (CD209 или Дендритная клетка-специфическая молекула внутриклеточной адгезии -3-захватывающий неинтегрин) были идентифицированы как компоненты проникновения вируса в некоторых ортобуньявирусах.[13][15] Гетеродимеры Gn / Gc на вирусной поверхности ответственны за распознавание клеток-мишеней[16], с Gc считается первичным белком прикрепления, хотя Gn был предложен как белок прикрепления для LACV в клетках членистоногих.[13] Подкисление эндосомы запускает конформационные изменения в пептиде слияния Gc, освобождая рибонуклеарный белок (RNP), когда он высвобождается в цитоплазму.[16]
После высвобождения в цитоплазму первичная транскрипция начинается с того, что эндонуклеазный домен на L-белке участвует в процессе, известном как «захват крышки».[13][16] Во время захвата кэпа 10-18 нуклеотидов 5'-7-метилгуанилатных праймеров отщепляются от мРНК хозяина и прикрепляются к 5'-концу вирусных РНК.[9] Как и все РНК-вирусы с отрицательным смыслом, ортобуньявирусы требуют непрерывной параллельной трансляции клеткой-хозяином для получения полноразмерных вирусных мРНК, следовательно, на 3'-конце мРНК ортобуньявируса отсутствует полиаденилирование.[9] Примечательно, что у них также отсутствует сигнал полиаденилирования; вместо этого считается, что 3'-концы образуют структуру стержень-петля.[9][13] Антигеномы (полная длина положительный-смысловые РНК), используемые в качестве матриц для репликации вирусного генома, продуцируются L-белком RdRp без необходимости использования праймеров.[9] Как геномы с отрицательным смыслом, так и антигеномы с положительным смыслом связаны с N белками (образующими RNP) на всех этапах цикла репликации.[17] Таким образом, N и L - это минимальные белки, необходимые для транскрипции и репликации.[16][13]
Сегмент генома М кодирует полипротеин Gn-NSm-Gc на единственной открытой рамке считывания (ORF), кото-рый котрансляционно расщепляется внутренними сигнальными пептидами и сигнальной пептидазой хозяина.[16][9] Свободные гликопротеины Gc и Gn вставляются в мембрану эндоплазматического ретикулума и образуют гетеродимеры. Сигнал удержания Гольджи на Gn позволяет транспортировать гетеродимеры к аппарату Гольджи, где происходит гликозилирование. Присутствие вирусных гликопротеинов модифицирует мембрану Гольджи, позволяя отрастать РНП в производную Гольджи трубчатую вирусную фабрику (вироплазма).[15][9] Ортобуйнавирусы, как сегментированные вирусы, требуют точной упаковки одного из трех геномных сегментов в конечный вирион для образования зрелой инфекционной частицы. Кажется, что упаковка направляется сигналами, полностью содержащимися в последовательностях UTR.[13] Упакованные геномы приобретают липидную мембрану по мере того, как попадают в вирусные фабрики, затем транспортируются к плазматической мембране клетки-хозяина и высвобождаются посредством экзоцитоза. Последняя модификация гилкопротеина после высвобождения дает зрелую инфекционную частицу.[13]
Эволюция
Ортобунявирусы частично эволюционируют с помощью ключевого механизма, известного как геномная реассортация, который также имеет место в других сегментированных вирусах. Когда вирусы одной и той же группы одновременно инфицируют клетку-хозяина, могут образовываться смеси и новые комбинации сегментов S, M и L, увеличивая разнообразие. Наиболее частые события перераспределения связаны с сегментами L и S.[18]
Таксономия
Разновидность
Таксономия остается несколько гибкой, поскольку секвенировано относительно небольшое количество вирусных геномов этого рода. Было показано, что некоторые из перечисленных вирусов являются рекомбинантами других вирусов и могут быть переклассифицированы. В роду 88 видов:[1]
- Acara orthobunyavirus
- Айно ортобуньявирус
- Ортобуньявирус Акабане
- Ортобуньявирус Алахуэлы
- Анадырь ортобунявирус
- Анхемби ортобуньявирус
- Anopheles A orthobunyavirus
- Ортобуньявирус Anopheles B
- Бакау ортобуньявирус
- Батайский ортобуньявирус
- Батама ортобуньявирус
- Ортобуньявирус Bellavista
- Беневидес ортобуньявирус
- Бертиога ортобуньявирус
- Бимити ортобуньявирус
- Бирао ортобуньявирус
- Ортобуньявирус Botambi
- Бозо ортобуньявирус
- Ортобуньявирус Буньямвера
- Ортобуньявирус кустарника
- Ортобуниавирус пуговичной ивы
- Бвамба ортобуньявирус
- Ортобуниавирус Cache Valley
- Ортобуньявирус Cachoeira Porteira
- Ортобуньявирус Калифорнийского энцефалита
- Capim orthobunyavirus
- Ортобуньявирус карапару
- Кошка Que ортобуньявирус
- Кату ортобуньявирус
- Энсеада ортобуньявирус
- Фейсис загон ортобуньявирус
- Ортобунявирус форта Шерман
- Гамбоа ортобуньявирус
- Ортобуньявирус гуахары
- Гуама ортобуньявирус
- Ортобуньявирус гуароа
- Яко ортобуньявирус
- Илеша ортобуньявирус
- Ортобуньявирус Ingwavuma
- Ортобуньявирус Джеймстаунского каньона
- Ортобуньявирус ятобала
- Kaeng Khoi orthobunyavirus
- Кайри ортобуньявирус
- Краеугольный ортобуниавирус
- Кунгол ортобуньявирус
- Ортобуньявирус Ла-Кросс
- Ортобуниавирус Leanyer
- Lumbo orthbunyavirus
- Ортобуньявирус макауа
- Мадридский ортобуньявирус
- Ортобуниавирус магуари
- Ортобунявирус главного стока
- Мансанилла ортобуньявирус
- Маритуба ортобуньявирус
- Мелао ортобуньявирус
- Ортобунявирус мермет
- Минатитлан ортобуньявирус
- MPoko orthobunyavirus
- Няндо ортобуньявирус
- Олифанцвлей ортобуньявирус
- Орибока ортобуньявирус
- Оропуш ортобуньявирус
- Патуа ортобуньявирус
- Ортобунявирус торфяника
- Ортобуньявирус Потоси
- Сабо ортобуньявирус
- Ортобуньявирус Сан-Анджело
- Санго ортобуньявирус
- Ортобуниавирус Шмалленберга
- Серра-ду-Навио ортобуньявирус
- Шуни ортобуньявирус
- Симбу ортобуньявирус
- Заяц на снегоступах ортобунявирус
- Соророка ортобуньявирус
- Tacaiuma orthobunyavirus
- Ортобуньявирус тахины
- Татагинэ ортобуньявирус
- Ортобунявирус Tensaw
- Тете ортобуньявирус
- Ортобуньявирус тимири
- Timboteua orthobunyavirus
- Trivittatus orthobunyavirus
- Ортобуниавирус турлока
- Утинга ортобуньявирус
- Витватерсранд ортобуньявирус
- Ортобуньявирус Волькберга
- Виемия ортобуньявирус
- Зегла ортобуньявирус
Организовано по серогруппам
На основании результатов ингибирования перекрестной гемагглютинации и нейтрализации антител были определены 18 серогрупп. Другой - Виемия - с тех пор был признан. Некоторые вирусы еще не отнесены к одной из серогрупп. Серогруппа Симбу является самой крупной и насчитывает не менее 25 членов. Серогруппа группы C состоит как минимум из 13 человек. Важные с медицинской точки зрения вирусы принадлежат к серогруппам Bwamba, Bunyamwera, California, Group C и Simbu.
Анофелес серогруппы
- Вирус Anopheles A
- Вирус такайума
- Вирус реки Вирджин
- Комплекс Тромбетас
- Вирус Аруматеуа
- Вирус Караипе
- Вирус тромбета
- Вирус Тукуруи
Anopheles B серогруппы
- Вирус Anopheles B
- Вирус борасеи
Бакау серогруппа
- Вирус Бакау
- Вирус нола
Серогруппа Буньямвера
- Вирус Бирао
- Бозо вирус
- Вирус Буньямвера
- Вирус Cache Valley
- Вирус форта Шерман
- Вирус Джермистон
- Вирус гуароа
- Вирус Илеши
- Вирус Кайри
- Вирус Магуари
- Вирус Main Drain
- Локерн вирус
- Вирус Нортвей
- Вирус Playas
- Вирус Потоси
- Вирус шокве
- Стэнфилд вирус
- Вирус Тенсо
- Вирус Xingu
- Батайский комплекс
- Вирус Батай
- Чалово вирус
- Chittoor вирус
- Комплекс Нгари
- Вирус Гарисса
- КВ-141 вирус
- Вирус Нгари
Бвамба серогруппа
- Вирус Бвамба
- Вирус понгола
Калифорнийская серогруппа
- Вирус калифорнийского энцефалита
- Вирус Чатанга
- Inkoo вирус
- Вирус Джеймстаунского каньона
- Вирус Джерри Слау
- Keystone вирус
- Хатангский вирус
- Вирус Ла Кросса
- Lumbo вирус
- Вирус Мелао
- Вирус Морро Бэй
- Вирус Сан-Анджело
- Вирус Серра-ду-Навио
- Вирус зайца-снегоступа
- Вирус Саут-Ривер
- Вирус тахина
- Вирус Trivittatus
Капим серогруппа
- Акара вирус
- Беневидес вирус
- Capim вирус
Серогруппа гамбоа
- Вирус Алахуэла
- Вирус гамбоа
- 75V 2621 вирус напряжение
- Вирус Пуэбло Вьехо
- Вирус Сан-Хуан
Группа C серогруппа
- Вирус Bruconha
- Осса вирус
- Комплекс Карапару
- Вирус апеу
- Вирус Bruconha
- Вирус Карапару
- Винсес вирус
- Мадридский комплекс
- Мадридский вирус
- Комплекс Маритуба
- Гамбо вирус лимбо
- Вирус Маритуба
- 63U-11 вирус напряжение
- Вирус Мурутюку
- Непуйо вирус
- Вирус Рестана
- Орибока комплекс
- Вирус Итаки
- Орибока вирус
Серогруппа Гуама
- Вирус Ananindeua
- Вирус Бертиоги
- Вирус Бимити
- Вирус кананеи
- Кату вирус
- Вирус Ган Гана
- Вирус Гуама
- Вирус Гуаратуба
- Итимирим вирус
- Вирус гамака красного дерева
- Вирус Мирим
- Тимботуа вирус
- Вирус Трубанамана
Кунгол серогруппа
- Кунгол вирус
- Вонгал вирус
Маппутта серогруппа
- Вирус Buffalo Creek
- Вирус Маппутта
- Вирус Маприк
- Вирус Муррамбиджи
- Вирус солевой золы
Минатитлан серогруппа
- Вирус Минатитлан
- Вирус Палестины
Ньяндо серогруппа
- Вирус эретмаподитов
- Вирус Нямдо
Олифанстлей серогруппа
- Вирус Ботамби
- Olifanstlei вирус
Патуа серогруппа
- Вирус абраса
- Вирус Бабахойо
- Вирус Пахайоке
- Вирус Патуа
- Вирус Shark River
- Zegla вирус
Симбу серогруппа
- Икитос вирус
- Вирус Ятобаль
- Leanyer вирус
- Вирус Мермет
- Оя вирус
- Вирус тимири
- Серокомплекс Акабане
- Вирус Акабане
- Вирус Тинару
- Серокомплекс оропуша
- Вирус Мадре де Диос (MDDV)
- Вирус Оропуш
- Серокомплекс Sathuperi
- Серокомплекс Шамонда
- Вирус торфа
- Вирус Шамонда
- Серокомплекс шуни
- Вирус Айно
- Вирус шуни
- Комплекс Симбу
- Вирус Шмалленберга[19]
- Симбу вирус
Тете серогруппа
- Вирус Bahig
- Вирус Батама
- Вирус Матруха
- Тете вирус
- Цурусэ вирус
- Вирус Велдона
Серогруппа турлока
- Кедах вирус
- Вирус Леднице
- M'Poko вирус
- Turlock вирус
- Umbre вирус
Виемия серогруппа
- Вирус Анхемби
- Вирус Cachoeira Porteira
- Вирус Иако
- Вирус макауа
- Соророка вирус
- Вирус Тайассуи
- Вирус Тукундуба
- Виемия вирус
Неклассифицированный
- Вирус Батама
- Вирус Беллависта
- Вирус Бельмона
- Энсеада вирус
- Эстеро Реал вирус
- Вирус Герберта
- Jonchet вирус
- Вирус Юрона
- Вирус Kaeng Khei
- Вирус Кибале
- Вирус Кованьяма
- Вирус Mojuí dos Campos
- Вирус Ntwetwe[20]
- Вирус Taï
- Tataguine вирус
- Вирус Тринити
- Вирус Витватерсранда
- Вирус Волькберга
- Вирус Якааба
Рекомендации
- ^ а б c «Таксономия вирусов: выпуск 2019 г.». talk.ictvonline.org. Международный комитет по таксономии вирусов. Получено 6 мая 2020.
- ^ Хьюз, HR; Адкинс, S; Альховский, С; Пиво, M; Блэр, C; Калишер, Швейцария; Дребот, М; Ламберт, AJ; де Соуза, ВМ; Marklewitz, M; Nunes, MRT; Shí 石晓宏, X; Консорциум отчетов ICTV (январь 2020 г.). "Профиль таксономии вирусов ICTV: Peribunyaviridae". Журнал общей вирусологии. 101 (1): 1–2. Дои:10.1099 / jgv.0.001365. PMID 31846417.
- ^ а б "Отчет ICTV Peribunyaviridae".
- ^ Smithburn KC, Haddow AJ, Mahaffy AF (март 1946 г.). «Нейротропный вирус, выделенный из комаров Aedes, пойманных в лесу Семлики». Американский журнал тропической медицины и гигиены. 26 (2): 189–208. Дои:10.4269 / ajtmh.1946.s1-26.189. OCLC 677158400. PMID 21020339.
- ^ Гриффит С (2005). «Словарь ботанических эпитетов». Словарь ботанических эпитетов. Получено 31 января 2019.
orthos orth adj ορϑοϛ прямо
- ^ «Международный комитет по таксономии вирусов, Bunyaviridae». bio-mirror.cn. Архивировано из оригинал 9 сентября 2013 г.. Получено 20 декабря 2018.
- ^ а б c "Страница ViralZone". viralzone.expasy.org. Получено 20 декабря 2018.
- ^ Kascsak RJ, Lyons MJ (октябрь 1977 г.). «Вирус Буньямвера. I. Молекулярная сложность РНК вириона». Вирусология. 82 (1): 37–47. Дои:10.1016/0042-6822(77)90030-7. PMID 898678.
- ^ а б c d е ж грамм час я j k л Эванс А.Б., Петерсон К.Е. (август 2019 г.). «Выбросьте карту: нейропатогенез глобально расширяющейся калифорнийской серогруппы ортобуньявирусов». Вирусы. 11 (9): 794. Дои:10.3390 / v11090794. ЧВК 6784171. PMID 31470541.
- ^ Генбанк: Сегмент S вируса Буньямвера, полная последовательность
- ^ Генбанк: L-сегмент вируса Буньямвера, полная последовательность
- ^ а б Саккас Х., Бозидис П., Фрэнкс А., Пападопулу С. (апрель 2018 г.). "Лихорадка оропуша: обзор". Вирусы. 10 (4): 175. Дои:10.3390 / v10040175. ЧВК 5923469. PMID 29617280.
- ^ а б c d е ж грамм час я j Эллиотт Р.М. (октябрь 2014 г.). «Ортобунявирусы: последние генетические и структурные открытия». Обзоры природы. Микробиология. 12 (10): 673–85. Дои:10.1038 / nrmicro3332. PMID 25198140.
- ^ а б У П, Ю Икс, Ван П, Ченг Джи (март 2019 г.). «Жизненный цикл арбовируса у комаров: приобретение, распространение и передача». Обзоры экспертов в области молекулярной медицины. 21: e1. Дои:10.1017 / erm.2018.6. PMID 30862324.
- ^ а б c d Дутузе М.Ф., Нзайирамбахо М., Морес С.Н., Кристоферсон Р.К. (2018-04-12). "Ортобунявирусы, потенциально опасные для здоровья". Границы ветеринарии. 5: 69. Дои:10.3389 / fvets.2018.00069. ЧВК 5906542. PMID 29707545.
- ^ а б c d е Павайя Р.В., Гупта В.К. (21.11.2013). «Обзор вирусной инфекции Шмалленберга: недавно возникшего заболевания крупного рогатого скота, овец и коз». Veterinární Medicína. 58 (10): 516–526. Дои:10.17221 / 7083-ветмед. ISSN 0375-8427.
- ^ Чжэн В., Тао Ю. Дж. (Май 2013 г.). «Инкапсидация генома нуклеопротеинами ортобуньявируса». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 110 (22): 8769–70. Bibcode:2013PNAS..110.8769Z. Дои:10.1073 / pnas.1306838110. ЧВК 3670359. PMID 23696659.
- ^ да Роса, Хорхе Фернандо Травассос; де Соуза, Уильям Марсель; де Паула Пиньейро, Франсиско; Фигейредо, Марио Луис; Кардосо, Джедсон Феррейра; Акрани, Густаво Ольшанский; Нуньес, Марсио Роберто Тейшейра (06.02.2017). «Вирус оропуша: клинические, эпидемиологические и молекулярные аспекты забытого ортобуниавируса». Американский журнал тропической медицины и гигиены. 96 (5): 16–0672. Дои:10.4269 / ajtmh.16-0672. ISSN 0002-9637. ЧВК 5417190. PMID 28167595.
- ^ Nachrichten, n-tv. "Unbekanntes Virus entdeckt". n-tv.de. Получено 20 декабря 2018.
- ^ Эдридж А.В., Дейс М., Намаззи Р., Кристелла С., Джеббинк М.Ф., Маурер И. и др. (Январь 2019). «Новый ортобуниавирус, обнаруженный в спинномозговой жидкости ребенка из Уганды с тяжелой энцефалопатией». Клинические инфекционные болезни. 68 (1): 139–142. Дои:10.1093 / cid / ciy486. ЧВК 6293039. PMID 29893821.