WikiDer > PCDH15

PCDH15
PCDH15
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыPCDH15, CDHR15, DFNB23, USH1F, связанный с протокадгерином 15, связанный с протокадгерином 15
Внешние идентификаторыOMIM: 605514 MGI: 1891428 ГомолоГен: 23401 Генные карты: PCDH15
Расположение гена (человек)
Хромосома 10 (человек)
Chr.Хромосома 10 (человек)[1]
Хромосома 10 (человек)
Геномное расположение PCDH15
Геномное расположение PCDH15
Группа10q21.1Начинать53,802,771 бп[1]
Конец55,627,942 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (белок)
Расположение (UCSC)Chr 10: 53,8 - 55,63 МбChr 10: 73,1 - 74,65 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Протокадгерин-15 это белок что у людей кодируется PCDH15 ген.[5][6][7]

Функция

Этот ген является членом кадгерин надсемейство. Члены семейства кодируют интегральные мембранные белки, которые опосредуют кальций-зависимая клетка-клетка адгезия. Белковый продукт этого гена состоит из сигнальный пептид, 11 внеклеточных кальций-связывающих доменов, a трансмембранный домен и уникальный цитоплазматический домен. Он играет важную роль в поддержании нормального сетчатка и кохлеарный функция.[7] Считается, что взаимодействует с CDH23 формировать подсказка нити.[8]

Клиническое значение

Мутации в этом гене были связаны с потерей слуха, что согласуется с его местоположением в Синдром Ашера критическая область типа 1F (USH1F) на хромосоме 10.[7] Также было обнаружено, что его вариации связаны с нормальными различиями во внешности людей.[9]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000150275 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000052613 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Ахмед З.М., Риазуддин С., Бернштейн С.Л., Ахмед З., Хан С., Гриффит А.Дж. и др. (Июль 2001 г.). «Мутации гена протокадгерина PCDH15 вызывают синдром Ушера типа 1F». Американский журнал генетики человека. 69 (1): 25–34. Дои:10.1086/321277. ЧВК 1226045. PMID 11398101.
  6. ^ Ахмед З.М., Риазуддин С., Ахмад Дж., Бернштейн С.Л., Го Й., Сабар М.Ф. и др. (Декабрь 2003 г.). «PCDH15 экспрессируется в нейросенсорном эпителии глаза и уха, а мутантные аллели ответственны как за USH1F, так и за DFNB23». Молекулярная генетика человека. 12 (24): 3215–23. Дои:10.1093 / hmg / ddg358. PMID 14570705. S2CID 14028314.
  7. ^ а б c "Entrez Gene: PCDH15 протокадгерин 15".
  8. ^ Kazmierczak P, Sakaguchi H, Tokita J, Wilson-Kubalek EM, Milligan RA, Müller U, Kachar B (сентябрь 2007 г.). «Кадгерин 23 и протокадгерин 15 взаимодействуют с образованием филаментов концевого звена в сенсорных волосковых клетках». Природа. 449 (7158): 87–91. Bibcode:2007Натура 449 ... 87K. Дои:10.1038 / природа06091. PMID 17805295. S2CID 4414814.
  9. ^ Crouch DJ, Winney B, Koppen WP, Christmas WJ, Hutnik K, Day T и др. (Январь 2018). «Генетика человеческого лица: идентификация вариантов одного гена с большим эффектом». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 115 (4): E676 – E685. Дои:10.1073 / pnas.1708207114. ЧВК 5789906. PMID 29301965.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка