WikiDer > PCLO

PCLO
PCLO
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыPCLO, ACZ, PCH3, пикколо пресинаптический белок цитоматрикс
Внешние идентификаторыOMIM: 604918 MGI: 1349390 ГомолоГен: 69111 Генные карты: PCLO
Расположение гена (человек)
Хромосома 7 (человек)
Chr.Хромосома 7 (человек)[1]
Хромосома 7 (человек)
Геномное расположение PCLO
Геномное расположение PCLO
Группа7q21.11Начинать82,754,012 бп[1]
Конец83,162,930 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE PCLO gnf1h01744 на fs.png

PBB GE PCLO 213558 в формате fs.png

PBB GE PCLO 210650 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_033026
NM_014510

NM_001110796
NM_011995

RefSeq (белок)

NP_055325
NP_149015

NP_001104266
NP_036125

Расположение (UCSC)Chr 7: 82,75 - 83,16 МбChr 5: 14,51 - 14,86 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Белковый пикколо это белок что у людей кодируется PCLO ген.[5][6][7]

Функция

Синаптические везикулы стыкуются и сливаются в активной зоне плазматической мембраны в химических синапсах. Пресинаптический цитоскелетный матрикс (ПКМ), который связан с активной зоной и расположен между синаптическими пузырьками, как полагают, участвует в поддержании сайта высвобождения нейромедиатора в соответствии с постсинаптическим приемным аппаратом. Цикл синаптических пузырьков - это многоступенчатый процесс, в котором участвует ряд белков (см. MIM 603215). Среди компонентов PCM, которые организуют эти события, являются фагот (BSN; MIM 604020), RIM (RIMS1; MIM 606629), гобой (RIMS2; MIM 606630) и Piccolo (PCLO). [Предоставлено OMIM].[7]

Взаимодействия

Белковый продукт PCLO под названием Piccolo было показано взаимодействовать с количеством белков, включая GIT1,[8] F-актин-связывающий белок Abp1,[9] PRA1,[10] ТРИО,[11] DAAM1,[12] и Профилин.[13]

Клиническая значимость

Рецидивирующие мутации в этом гене были связаны со случаями диффузная В-клеточная лимфома большого размера.[14] Последние данные показали, что гомозиготная бессмысленная мутация PCLO является генетической причиной аутосомно-рецессивного нейродегенеративного расстройства, понтоцеребеллярной гипоплазии III типа (PCH3).[15]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000186472 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000061601 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Cases-Langhoff C, Voss B, Garner AM, Appeltauer U, Takei K, Kindler S, Veh RW, De Camilli P, Gundelfinger ED, Garner CC (март 1996 г.). «Piccolo, новый белок 420 кДа, связанный с пресинаптической цитоматриксой». Европейский журнал клеточной биологии. 69 (3): 214–23. PMID 8900486.
  6. ^ Нагасе Т., Исикава К., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О. (февраль 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. IX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК исследования. 5 (1): 31–9. Дои:10.1093 / днарес / 5.1.31. PMID 9628581.
  7. ^ а б «Ген Entrez: PCLO piccolo (пресинаптический цитоматричный белок)».
  8. ^ Kim S, Ko J, Shin H, Lee JR, Lim C, Han JH, Altrock WD, Garner CC, Gundelfinger ED, Premont RT, Kaang BK, Kim E (февраль 2003 г.). «Семейство белков GIT образует мультимеры и ассоциируется с пресинаптическим белком цитоматрицы Piccolo». Журнал биологической химии. 278 (8): 6291–300. Дои:10.1074 / jbc.M212287200. PMID 12473661.
  9. ^ Фенстер, Стивен Д .; Кессельс, Майкл М .; Квалманн, Бритта; Чанг, Ук Дж .; Нэш, Джоанна; Gundelfinger, Eckart D .; Гарнер, Крейг С. (30 мая 2003 г.). «Взаимодействие между Piccolo и актин / динамин-связывающим белком Abp1 связывает эндоцитоз везикул с пресинаптическими активными зонами». Журнал биологической химии. 278 (22): 20268–20277. Дои:10.1074 / jbc.M210792200. PMID 12654920.
  10. ^ Fenster, S.D .; Chung, W. J .; Zhai, R .; Cases-Langhoff, C .; Voss, B .; Гарнер, А. М .; Kaempf, U .; Киндлер, С .; Гундельфингер, Э. Д. (01.01.2000). «Piccolo, пресинаптический белок цинкового пальца, структурно связанный с фаготом». Нейрон. 25 (1): 203–214. Дои:10.1016 / s0896-6273 (00) 80883-1. PMID 10707984. S2CID 10177138.
  11. ^ Терри-Лоренцо, Райан Т .; Торрес, Вивиана I .; Ваг, Дхананджай; Галаз, Хосе; Swanson, Selene K .; Флоренс, Лоуренс; Уошберн, Майкл П .; Уэйтс, Кларисса Л .; Гундельфингер, Эккарт Д. (01.01.2016). «Трио, семейство Ро GEF, взаимодействует с белками пресинаптической активной зоны пикколо и фагот». PLOS ONE. 11 (12): e0167535. Дои:10.1371 / journal.pone.0167535. ЧВК 5132261. PMID 27907191.
  12. ^ Ваг, Дхананджай; Терри-Лоренцо, Райан; Уэйтс, Кларисса Л .; Leal-Ortiz, Sergio A .; Маас, Кристоф; Реймер, Ричард Дж .; Гарнер, Крейг С. (01.01.2015). «Piccolo направляет зависимую от активности сборку F-актина из пресинаптических активных зон через Daam1». PLOS ONE. 10 (4): e0120093. Дои:10.1371 / journal.pone.0120093. ЧВК 4405365. PMID 25897839.
  13. ^ Ван, X .; Kibschull, M .; Laue, M. M .; Lichte, B .; Petrasch-Parwez, E .; Килиманн, М. В. (1999-10-04). «Aczonin, предполагаемый каркасный белок массой 550 кДа пресинаптических активных зон, имеет общие области гомологии с Rim и Bassoon и связывает профилин». Журнал клеточной биологии. 147 (1): 151–162. Дои:10.1083 / jcb.147.1.151. ЧВК 2164979. PMID 10508862.
  14. ^ Лор Дж. Г., Стоянов П., Лоуренс М. С., Оклер Д., Чапуи Б., Сугнез К., Круз-Гордилло П., Кнечел Б., Асманн Ю. В., Слэджер С. Л., Новак А. Дж., Доган А., Анселл С. М., Линк Б. К., Зоу Л., Гулд Дж., Saksena G, Stransky N, Rangel-Escareño C, Fernandez-Lopez JC, Hidalgo-Miranda A, Melendez-Zajgla J, Hernández-Lemus E, Schwarz-Cruz y Celis A, Imaz-Rosshandler I, Ojesina AI, Jung J, Pedamallu CS, Lander ES, Habermann TM, Cerhan JR, Shipp MA, Getz G, Golub TR (март 2012 г.). «Обнаружение и приоритезация соматических мутаций в диффузной большой B-клеточной лимфоме (DLBCL) путем секвенирования всего экзома». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 109 (10): 3879–84. Дои:10.1073 / pnas.1121343109. ЧВК 3309757. PMID 22343534.
  15. ^ Ахмед, Мустафа Й .; Chioza, Barry A .; Раджаб, Анна; Шмитц-Абэ, Клаус; Аль-Хаят, Аиша; Ат-Турки, Саид; Baple, Emma L .; Паттон, Майкл А .; Аль-Мемар, Али Ю. (28 апреля 2015 г.). «Потеря функции PCLO лежит в основе понтоцеребеллярной гипоплазии III типа». Неврология. 84 (17): 1745–1750. Дои:10.1212 / WNL.0000000000001523. ЧВК 4424132. PMID 25832664.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q9Y6V0 (Протеин пикколо) в PDBe-KB.