WikiDer > PDLIM5
PDLIM5
PDZ и белок домена LIM 5 это белок что у людей кодируется PDLIM5 ген.[5][6]
Белок, кодируемый этим геном, представляет собой белок домена LIM. LIM-домены представляют собой богатые цистеином двойные цинковые пальцы, состоящие из 50-60 аминокислот, которые участвуют во взаимодействиях белок-белок. Белки, содержащие домен LIM, являются каркасом для образования мультибелковых комплексов. Белки участвуют в организации цитоскелета, спецификации клеточных клонов, развитии органов и онкогенезе. Кодируемый белок также является членом класса белков Enigma, семейства белков, которые содержат 100-аминокислотный домен PDZ на N-конце и от 1 до 3 доменов LIM на С-конце. Для этого гена было обнаружено множество вариантов транскриптов, кодирующих разные изоформы, хотя не все из них полностью охарактеризованы.[6]
Взаимодействия
PDLIM5 был показан взаимодействовать с участием PRKCB1.[7]
использованная литература
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000163110 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028273 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ У М., Ли И, Цзи Ц, Сюй Дж, Чжэн Х, Цзоу Х, Гу С, Лу И, Се И, Мао И (сентябрь 2004 г.). «Клонирование и идентификация нового человеческого гена PDLIM5, гомолога AD-ассоциированного белка нейронной нити (AD7c-NTP)». ДНК Seq. 15 (2): 144–7. Дои:10.1080/10425170310001656756. PMID 15346770. S2CID 36916587.
- ^ а б «Ген Entrez: PDLIM5, PDZ и LIM домен 5».
- ^ Курода, S; Tokunaga C; Kiyohara Y; Хигучи О; Konishi H; Mizuno K; Gill G N; Киккава У (декабрь 1996 г.). «Белково-белковое взаимодействие LIM-доменов цинкового пальца с протеинкиназой C». J. Biol. Chem. 271 (49): 31029–32. Дои:10.1074 / jbc.271.49.31029. ISSN 0021-9258. PMID 8940095.
дальнейшее чтение
- Судо К., Чинен К., Накамура Ю. (1995). «2058 экспрессированных тегов последовательности (EST) из библиотеки кДНК легкого плода человека». Геномика. 24 (2): 276–9. Дои:10.1006 / geno.1994.1616. PMID 7698749.
- Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID 8889548.
- Курода С., Токунага С., Киёхара Ю. и др. (1997). «Белково-белковое взаимодействие LIM-доменов цинкового пальца с протеинкиназой C». J. Biol. Chem. 271 (49): 31029–32. Дои:10.1074 / jbc.271.49.31029. PMID 8940095.
- Уэки Н., Секи Н., Яно К. и др. (1999). «Выделение, тканевая экспрессия и хромосомная принадлежность гена белка LIM человека, демонстрирующая гомологию с гомологом загадки крысы (ENH)». J. Hum. Genet. 44 (4): 256–60. Дои:10.1007 / с100380050155. PMID 10429367.
- Накагава Н., Хосидзима М., Оясу М. и др. (2000). «ENH, содержащий домены PDZ и LIM, белок, специфичный для сердца / скелетных мышц, связывается с белками цитоскелета через домен PDZ». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 272 (2): 505–12. Дои:10.1006 / bbrc.2000.2787. PMID 10833443.
- Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК 310948. PMID 11076863.
- Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК 311072. PMID 11230166.
- Симпсон Дж. К., Велленройтер Р., Поустка А. и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Rep. 1 (3): 287–92. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК 1083732. PMID 11256614.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
- Маэно-Хикичи Й., Чанг С., Мацумура К. и др. (2003). «Комплекс PKC эпсилон-ENH-канал специфически модулирует каналы Ca2 + N-типа». Nat. Неврологи. 6 (5): 468–75. Дои:10.1038 / nn1041. PMID 12665800. S2CID 19964052.
- Ивамото К., Какиучи С., Бандо М. и др. (2004). «Молекулярная характеристика биполярного расстройства путем сравнения профилей экспрессии генов в головном мозге после смерти при основных психических расстройствах». Мол. Психиатрия. 9 (4): 406–16. Дои:10.1038 / sj.mp.4001437. PMID 14743183.
- Петрозиелло Дж., Ямане А., Вестендорф Л. и др. (2004). «Подавляющая субтрактивная гибридизация и профилирование экспрессии идентифицируют уникальный набор генов, сверхэкспрессируемых при немелкоклеточном раке легкого». Онкоген. 23 (46): 7734–45. Дои:10.1038 / sj.onc.1207921. PMID 15334068.
- Ивамото К., Бандо М., Васидзука С. и др. (2004). «Экспрессия HSPF1 и LIM в лимфобластоидных клетках, полученных от пациентов с биполярным расстройством и шизофренией». J. Hum. Genet. 49 (5): 227–31. Дои:10.1007 / s10038-004-0136-5. PMID 15362566.
- Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
- Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК 528930. PMID 15489336.
- Niederländer N, Fayein NA, Auffray C, Pomiès P (2005). «Характеристика новой человеческой изоформы семейства гомологов enigma, специфически экспрессируемой в скелетных мышцах». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 325 (4): 1304–11. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.10.178. PMID 15555569.
- Като Т., Иваяма Ю., Какиучи С. и др. (2005). «Анализ экспрессии генов и ассоциации LIM (PDLIM5) при биполярном расстройстве и шизофрении». Мол. Психиатрия. 10 (11): 1045–55. Дои:10.1038 / sj.mp.4001719. PMID 16044170.
- Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- Хориучи Ю., Араи М., Нийзато К. и др. (2006). «Полиморфизм в гене PDLIM5, связанный с экспрессией гена и шизофренией». Биол. Психиатрия. 59 (5): 434–9. Дои:10.1016 / j.biopsych.2005.07.041. PMID 16213469. S2CID 22930796.
Галерея PDB | |
|---|---|
|
