WikiDer > PDLIM7

PDLIM7
PDLIM7
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыPDLIM7, LMP1, LMP3, PDZ и LIM домен 7
Внешние идентификаторыOMIM: 605903 MGI: 1914649 ГомолоГен: 3980 Генные карты: PDLIM7
Расположение гена (человек)
Хромосома 5 (человек)
Chr.Хромосома 5 (человек)[1]
Хромосома 5 (человек)
Геномное расположение PDLIM7
Геномное расположение PDLIM7
Группа5q35.3Начните177,483,394 бп[1]
Конец177,497,606 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE PDLIM7 203370 s в формате fs.png

PBB GE PDLIM7 203369 x at fs.png

PBB GE PDLIM7 214266 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_005451
NM_203352
NM_203353
NM_213636

NM_001114087
NM_001114088
NM_026131

RefSeq (белок)

NP_005442
NP_976227
NP_998801

NP_001107559
NP_001107560
NP_080407

Расположение (UCSC)Chr 5: 177,48 - 177,5 МбChr 13: 55,5 - 55,51 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

PDZ и белок домена LIM 7 это белок что у людей кодируется PDLIM7 ген.[5][6]

Белок, кодируемый этим геном, является представителем семейства белков, состоящих из консервативных доменов PDZ и LIM. Предполагается, что LIM домены функционируют при узнавании белок-белок в различных контекстах, включая транскрипцию и развитие генов, а также в цитоскелетном взаимодействии. Домены LIM этого белка связываются с протеинкиназами, тогда как домен PDZ связывается с актиновыми филаментами. Продукт гена участвует в сборке комплекса, связанного с актиновыми филаментами, необходимого для передачи митогенного сигнала ret / ptc2. Биологическая функция, вероятно, будет функцией адаптера с доменом PDZ, локализующим LIM-связывающие белки в актиновых филаментах как скелетных мышц, так и немышечных тканей. Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к множеству вариантов транскриптов.[6]

Взаимодействия

PDLIM7 был показан взаимодействовать с TPM2.[7]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000196923 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021493 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Лю Ю., Волос Г.А., Боден С.Д., Виггесварапу М., Титус Л. (март 2002 г.). «Сверхэкспрессированные белки минерализации LIM не требуют доменов LIM для индукции костной ткани». Журнал исследований костей и минералов. 17 (3): 406–14. Дои:10.1359 / jbmr.2002.17.3.406. PMID 11874232. S2CID 26089809.
  6. ^ а б «Ген Entrez: PDLIM7, PDZ и LIM домен 7 (загадка)».
  7. ^ Гай PM, Кенни Д.А., Гилл Г.Н. (июнь 1999 г.). «Домен PDZ загадки белка LIM связывается с бета-тропомиозином». Молекулярная биология клетки. 10 (6): 1973–84. Дои:10.1091 / mbc.10.6.1973. ЧВК 25398. PMID 10359609.

дальнейшее чтение