WikiDer > PDZD11

PDZD11

PDZD11

Белок PDZD11 PDB 1wi2.png

Доступные конструкции

Поиск ортолога: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
1WI2

Идентификаторы

Псевдонимы

PDZD11, AIPP1, PDZK11, PISP, домен PDZ, содержащий 11

Внешние идентификаторы

OMIM: 300632 MGI: 1919871 ГомолоГен: 9530 Генные карты: PDZD11

Расположение гена (человек)

Chr.	Х-хромосома (человек)^[1]

Группа	Xq13.1	Начинать	70,286,595 бп^[1]
Группа	Xq13.1	Конец	70,290,514 бп^[1]

Расположение гена (Мышь)

Chr.	Х-хромосома (мышь)^[2]

Группа	X \| X C3	Начинать	100,622,883 бп^[2]
Группа	X \| X C3	Конец	100,626,568 бп^[2]

Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание с С-концом белка • GO: 0001948 связывание с белками
Сотовый компонент	• цитоплазма • внеклеточная область • цитозоль • синапс • межклеточное соединение • пресинапс • базолатеральная плазматическая мембрана
Биологический процесс	• поддержание апикальной / базальной полярности эпителиальных клеток • локализация белка в базолатеральной плазматической мембране • GO: 0010554 секреция нейротрансмиттера • метаболический процесс биотина • пантотенатный метаболический процесс • антимикробный гуморальный ответ • трансмембранный перенос ионов • трансмембранный транспорт
Источники:Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь


51248


72621

Ансамбль


ENSG00000120509


ENSMUSG00000015668


Q5EBL8


Q9CZG9

RefSeq (мРНК)


NM_016484


NM_028303 NM_001356384

RefSeq (белок)

NP_057568 NP_001357103 NP_001357104 NP_001357105 NP_001357106
NP_001357107


NP_082579 NP_001343313

Расположение (UCSC)

Chr X: 70.29 - 70.29 Мб

Chr X: 100.62 - 100.63 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

PDZ-домен-содержащий белок 11 это белок что у людей кодируется PDZD11 ген.^[5]^[6]^[7]

Рекомендации

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000120509 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015668 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Чжан QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Ху GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (ноябрь 2000 г.). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в CD34 + гемопоэтических стволовых / клетках-предшественниках». Genome Res. 10 (10): 1546–60. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК 310934. PMID 11042152.
^ Кларк Х.Ф., Гурни А.Л., Абая Э., Бейкер К., Болдуин Д., Кисть Дж., Чен Дж., Чоу Б., Чуи С., Кроули С., Керрелл Б., Деуэл Б., Дауд П., Итон Д., Фостер Дж., Гримальди К., Гу Q , Hass PE, Heldens S, Huang A, Kim HS, Klimowski L, Jin Y, Johnson S, Lee J, Lewis L, Liao D, Mark M, Robbie E, Sanchez C, Schoenfeld J, Seshagiri S, Simmons L, Singh Дж., Смит В., Стинсон Дж., Вагтс А., Вандлен Р., Ватанабе С., Вианд Д., Вудс К., Се М. Х., Янсура Д., Йи С, Ю Дж, Юань Дж, Чжан М, Чжан З, Годдард А., Вуд В. И., Годовски П., Грей А. (октябрь 2003 г.). «Инициатива по открытию секретных белков (SPDI), широкомасштабное усилие по идентификации новых секретируемых человеком и трансмембранных белков: оценка биоинформатики». Genome Res. 13 (10): 2265–70. Дои:10.1101 / гр.1293003. ЧВК 403697. PMID 12975309.
^ «Ген Entrez: PDZD11 PDZ домен, содержащий 11».

дальнейшее чтение

Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК 310948. PMID 11076863.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК 311072. PMID 11230166.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
Goellner GM, DeMarco SJ, Strehler EE (2003). «Характеристика PISP, нового белка с одним PDZ, который связывается со всеми вариантами b-сплайсинга Ca2 + -АТФазы плазматической мембраны». Анна. Акад. Наука. 986: 461–71. Дои:10.1111 / j.1749-6632.2003.tb07230.x. PMID 12763866.
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК 528930. PMID 15489336.
Росс М.Т., Графхэм Д.В., Коффи А.Дж. и др. (2005). «Последовательность ДНК Х-хромосомы человека». Природа. 434 (7031): 325–37. Дои:10.1038 / природа03440. ЧВК 2665286. PMID 15772651.
Стефенсон С.Е., Дубач Д., Лим С.М. и др. (2005). «Белок с одним доменом PDZ взаимодействует с медной АТФазой Менкеса, ATP7A. Новый белок, участвующий в гомеостазе меди». J. Biol. Chem. 280 (39): 33270–9. Дои:10.1074 / jbc.M505889200. PMID 16051599.
Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК 1356129. PMID 16344560.
Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК 1347501. PMID 16381901.

Эта статья о ген на человека Х хромосома и / или связанный с ним белок это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.