WikiDer > PMPCA

PMPCA
PMPCA
Идентификаторы
ПсевдонимыPMPCA, Альфа-MPP, INPP5E, P-55, SCAR2, пептидаза, альфа-субъединица митохондриального процессинга, CLA1, CPD3, пептидаза, альфа-субъединица митохондриального процессинга
Внешние идентификаторыOMIM: 613036 MGI: 1918568 ГомолоГен: 6078 Генные карты: PMPCA
Расположение гена (человек)
Хромосома 9 (человек)
Chr.Хромосома 9 (человек)[1]
Хромосома 9 (человек)
Геномное местоположение PMPCA
Геномное местоположение PMPCA
Группа9q34.3Начинать136,410,641 бп[1]
Конец136,423,761 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE PMPCA 212088 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001282944
NM_001282946
NM_015160

NM_173180

RefSeq (белок)

NP_001269873
NP_001269875
NP_055975

NP_775272

Расположение (UCSC)Chr 9: 136,41 - 136,42 МбChr 2: 26.39 - 26.4 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Субъединица альфа пептидазы митохондрий является фермент что у людей кодируется PMPCA ген.[5][6][7] Этот ген PMPCA кодирует белок, который является членом семейства пептидаз M16. Этот белок расположен в митохондриальном матриксе и катализирует расщепление лидерных пептидов белков-предшественников, вновь импортированных в митохондрии, хотя он функционирует только как часть гетеродимерного комплекса.


Структура

Белок-предшественник альфа субъединицы митохондриальной пептидазы имеет размер 58,2 кДа и состоит из 525 аминокислот. Белок-предшественник содержит N-концевой фрагмент из 33 аминокислот в качестве нацеленной на митохондрию последовательности. После расщепления созревший белок PMPCA имеет размер 54,6 кДа и теоретическую число Пи 5,88.

Функция

Пептидаза, обрабатывающая митохондрии (MPP), представляет собой металлоэндопептидазу, содержащую две структурно родственные субъединицы, субъединицу альфа и субъединица бета-пептидазы митохондрий, работая вместе для его каталитической функции.[8] Содержащий каталитический сайт белок бета-субъединицы PMPCB отщепляет пре-последовательности (транзитные пептиды) от предшественников митохондриальных белков и высвобождает N-концевые транзитные пептиды из белков-предшественников, импортированных в митохондрии, обычно с Arg в положении P2.

Взаимодействия

Как альфа-субъединица пептидазы, обрабатывающей митохондрии, PMPCA образует гетеродимер с субъединицей PMPCB.

Клиническое значение

Большинство митохондриальных белков кодируются ядром, что требует правильной транслокации митохондриальных белков-мишеней. Многие митохондриальные белки синтезируются в форме предшественника, которая содержит последовательность, направленную на митохондрии. Эти предшественники обычно расщепляются пептидазами и протеазами до того, как они попадут в свои суборганелларные места. Вероятно, что измененная активность митохондриальных процессинговых пептидаз важна для обеспечения правильного созревания митохондриальных белков, и что измененная активность этих протеаз будет иметь драматические последствия для активности, стабильности и сборки митохондриальных белков. Доказательства показали, что MPP участвует в протеолитическом созревании фратаксина, белка, ответственного за гомеостаз железа.[9] Соответственно, было показано, что дефицит МПП участвует в атаксии Фридрейха, аутосомно-рецессивном нейродегенеративном заболевании.[10][11]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000165688 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026926 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Нагасе Т., Секи Н., Танака А., Исикава К., Номура Н. (март 1996 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. IV. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0121-KIAA0160), полученные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1». ДНК Res. 2 (4): 167–74, 199–210. Дои:10.1093 / dnares / 2.4.167. PMID 8590280.
  6. ^ Нагасе Т., Миядзима Н., Танака А., Сазука Т., Секи Н., Сато С., Табата С., Исикава К., Каварабаяси И., Котани Н. и др. (Июль 1995 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. III. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0081-KIAA0120), полученные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1». ДНК Res. 2 (1): 37–43. Дои:10.1093 / dnares / 2.1.37. PMID 7788527.
  7. ^ «Ген Entrez: пептидаза PMPCA (митохондриальный процессинг) альфа».
  8. ^ Тейшейра П.Ф., Глейзер Э. (февраль 2013 г.). «Обработка пептидаз в митохондриях и хлоропластах». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Исследование молекулярных клеток. 1833 (2): 360–70. Дои:10.1016 / j.bbamcr.2012.03.012. PMID 22495024.
  9. ^ Бранда СС, Ян З.Й., Чу А., Исая Дж. (Июнь 1999 г.). «Митохондриальная промежуточная пептидаза и дрожжевой гомолог фратаксина вместе поддерживают митохондриальный гомеостаз железа в Saccharomyces cerevisiae». Молекулярная генетика человека. 8 (6): 1099–110. Дои:10.1093 / hmg / 8.6.1099. PMID 10332043.
  10. ^ Кавадини П., Адамек Дж., Тарони Ф., Гах О, Исая Дж. (Декабрь 2000 г.). «Двухэтапный процессинг человеческого фратаксина митохондриальной процессинговой пептидазой. Предшественники и промежуточные формы расщепляются с разной скоростью». Журнал биологической химии. 275 (52): 41469–75. Дои:10.1074 / jbc.M006539200. PMID 11020385.
  11. ^ Патель П.И., Исая Г. (июль 2001 г.). «Атаксия Фридрейха: от расширения триплетных повторов GAA до дефицита фратаксина». Американский журнал генетики человека. 69 (1): 15–24. Дои:10.1086/321283. ЧВК 1226030. PMID 11391483.

дальнейшее чтение