WikiDer > ПОЛЬГ

POLG
ПОЛЬГ
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыПОЛЬГ, MDP1, MIRAS, MTDPS4A, MTDPS4B, PEO, POLG1, POLGA, SANDO, SCAE, полимераза (ДНК) гамма, каталитическая субъединица, ДНК-полимераза гамма, каталитическая субъединица
Внешние идентификаторыOMIM: 174763 MGI: 1196389 ГомолоГен: 2016 Генные карты: ПОЛЬГ
Расположение гена (человек)
Хромосома 15 (человек)
Chr.Хромосома 15 (человек)[1]
Хромосома 15 (человек)
Геномное расположение POLG
Геномное расположение POLG
Группа15q26.1Начинать89,305,198 бп[1]
Конец89,334,861 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE POLG 203366 в формате fs.png

PBB GE POLG 217635 s на fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_002693
NM_001126131

NM_017462
NM_001360095
NM_001360096

RefSeq (белок)

NP_001119603
NP_002684

н / д

Расположение (UCSC)Chr 15: 89.31 - 89.33 МбChr 7: 79.45 - 79.47 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Субъединица ДНК-полимеразы гамма (POLG или POLG1) является фермент что у людей кодируется ПОЛЬГ ген.[5] Митохондриальный ДНК-полимераза является гетеротримером, состоящим из гомодимер дополнительных субъединиц плюс каталитическая субъединица. Белок, кодируемый этим геном, является каталитической субъединицей митохондриальной ДНК-полимеразы. Дефекты в этом гене являются причиной прогрессирующая наружная офтальмоплегия с делециями митохондриальной ДНК 1 (PEOA1), сенсорная атаксическая нейропатия дизартрия и офтальмопарез (САНДО), Синдром Альперса-Хаттенлохера (AHS) и синдром митохондриальной нейрогастроинтестинальной энцефалопатии (MNGIE).[6]

Структура

ПОЛЬГ расположен на q рука хромосомы 15 в положении 26.1 и имеет 23 экзоны. В ПОЛЬГ ген продуцирует белок 140 кДа, состоящий из 1239 аминокислоты.[7][8] ПОЛГ, белок кодируемый этим геном, является членом семейства ДНК-полимераз типа А. Это ядро ​​митохондрии с Mg2 + кофактор и 15 витков, 52 бета-нити, и 39 альфа-спирали.[9][10] POLG содержит полиглутаминовый тракт рядом с его N-конец что может быть полиморфным. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие один и тот же белок.[6]

Функция

POLG - это ген, кодирующий каталитическую субъединицу митохондриальной ДНК-полимераза, называемая ДНК-полимеразой гамма.[6] Человек ПОЛЬГ кДНК и ген были клонированы и картированы в полосе хромосомы 15q25.[11] В эукариотический клетки, митохондриальная ДНК реплицируется ДНК-полимеразой гамма, тримерным белковым комплексом, состоящим из каталитической субъединицы, POLG, и димерной дополнительной субъединицы 55 кДа, кодируемой POLG2 ген.[12] Каталитическая субъединица содержит три ферментативные активности, ДНК-полимеразную активность, 3’-5’-экзонуклеазную активность, которая проверяет неверное включение нуклеотиды, и 5’-dRP лиазе деятельность, необходимая для базовая эксцизионная пластика.

Каталитическая активность

Дезоксинуклеозидтрифосфат + ДНК (n) = дифосфат + ДНК (n + 1).[9][10]

Клиническое значение

Мутации в ПОЛЬГ ген связаны с несколькими митохондриальные заболевания, прогрессирующая наружная офтальмоплегия с делециями митохондриальной ДНК 1 (PEOA1), сенсорная атаксическая нейропатия дизартрия и офтальмопарез (САНДО), Синдром Альперса-Хаттенлохера (AHS) и синдром митохондриальной нейрогастроинтестинальной энцефалопатии (MNGIE).[6] Патогенные варианты также были связаны со смертельным исходом. миопатия желудочно-кишечная псевдообструкция и летальный исход печеночная недостаточность.[13][14] Список всех опубликованных мутаций в ПОЛЬГ кодирующая область и связанное с ними заболевание можно найти на База данных по гамма-мутациям ДНК-полимеразы человека.

Мыши, гетерозиготные по a Polg мутация могут только воспроизвести их митохондриальная ДНК неточно, так что они несут бремя мутаций в 500 раз больше, чем нормальные мыши. У этих мышей нет явных признаков быстро ускоренного старения, что указывает на то, что митохондриальные мутации не играют причинной роли в естественных условиях. старение.[15]

Взаимодействия

POLG имеет 50 двоичных белок-белковые взаимодействия в том числе 32 сопряженных взаимодействия. POLG, похоже, взаимодействует с POLG2, Dlg4, TP53, и Sod2.[16]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000140521 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000039176 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Зулло С.Дж., Батлер Л., Захорчак Р.Дж., Маквилл М., Уилкс С., Меррил С.Р. (март 1998 г.). «Локализация флуоресцентной гибридизацией in situ (FISH) человеческой митохондриальной полимеразы гамма (POLG) в полосе хромосомы человека 15q24 -> q26, и митохондриальной полимеразы гамма мыши (Polg) в полосе хромосомы мыши 7E, с подтверждением прямым анализом последовательности бактериальные искусственные хромосомы (БАХ) ". Цитогенетика и клеточная генетика. 78 (3–4): 281–4. Дои:10.1159/000134672. PMID 9465903.
  6. ^ а б c d Ген Entrez: полимераза POLG (направленная ДНК), гамма, каталитическая субъединица Эта статья включает текст из этого источника, который находится в всеобщее достояние.
  7. ^ Яо, Даниэль. «Атлас кардиоорганических белков» (COPaKB) - информация о белках ». amino.heartproteome.org. Получено 2018-08-28.
  8. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Дуан Х., Улен М., Йетс Дж. Р., Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии кардиального протеома и медицины посредством специализированной базы знаний». Циркуляционные исследования. 113 (9): 1043–53. Дои:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. ЧВК 4076475. PMID 23965338.
  9. ^ а б «POLG - субъединица ДНК-полимеразы гамма-1 - Homo sapiens (Человек) - ген и белок POLG». www.uniprot.org. Получено 2018-08-28. Эта статья включает текст, доступный под CC BY 4.0 лицензия.
  10. ^ а б «UniProt: универсальная база знаний о белках». Исследования нуклеиновых кислот. 45 (D1): D158 – D169. Январь 2017 г. Дои:10.1093 / нар / gkw1099. ЧВК 5210571. PMID 27899622.
  11. ^ Ропп, Пенсильвания, Коупленд, WC (сентябрь 1996 г.). «Клонирование и характеристика митохондриальной ДНК-полимеразы человека, ДНК-полимеразы гамма». Геномика. 36 (3): 449–58. Дои:10.1006 / geno.1996.0490. PMID 8884268.
  12. ^ Graziewicz MA, Longley MJ, Copeland WC (февраль 2006 г.). «Гамма-ДНК-полимераза в репликации и репарации митохондриальной ДНК». Химические обзоры. 106 (2): 383–405. Дои:10.1021 / cr040463d. PMID 16464011.
  13. ^ Джордано К., Пауэлл Х., Леопицци М., Де Кертис М., де Кертис М., Траваглини С., Себастьяни М., Галло П., Тейлор Р. У., д'Амати Дж. (Март 2009 г.). «Смертельная врожденная миопатия и желудочно-кишечная псевдообструкция из-за мутации POLG1». Неврология. 72 (12): 1103–5. Дои:10.1212 / 01.wnl.0000345002.47396.e1. ЧВК 2821839. PMID 19307547.
  14. ^ Müller-Höcker J, Horvath R, Schäfer S, Hessel H, Müller-Felber W., Kühr J, Copeland WC, Seibel P (февраль 2011 г.). «Истощение митохондриальной ДНК и смертельная детская печеночная недостаточность из-за мутаций в гене митохондриальной полимеразы γ (POLG): комбинированное морфологическое / ферментно-гистохимическое и иммуноцитохимическое / биохимическое и молекулярно-генетическое исследование». Журнал клеточной и молекулярной медицины. 15 (2): 445–56. Дои:10.1111 / j.1582-4934.2009.00819.x. ЧВК 3822808. PMID 19538466.
  15. ^ Vermulst M, Bielas JH, Kujoth GC, Ladiges WC, Rabinovitch PS, Prolla TA, Loeb LA (апрель 2007 г.). «Точечные мутации митохондрий не ограничивают естественную продолжительность жизни мышей». Природа Генетика. 39 (4): 540–3. Дои:10,1038 / ng1988. PMID 17334366.
  16. ^ «По запросу POLG найдено 50 бинарных взаимодействий». База данных по молекулярным взаимодействиям IntAct. EMBL-EBI. Получено 2018-08-29.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.