WikiDer > PUM1

PUM1
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1IB2, 1M8W, 1M8X, 1M8Y, 1М8З, 2YJY, 3BSB, 3BSX, 3Q0L, 3 квартал, 3 квартал, 3Q0O, 3К0П
Идентификаторы
Псевдонимы	PUM1, HSPUM, PUMH, PUMH1, PUML1, член 1 семейства связывания РНК pumilio, SCA47
Внешние идентификаторы	OMIM: 607204 MGI: 1931749 ГомолоГен: 22830 Генные карты: PUM1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 1 (человек)
Конец	31,065,991 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ; ; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• Связывание мРНК 3'-UTR; • GO: 0001948 связывание с белками; • Связывание РНК; • связывание miRNA;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • П-боди; • Гранула стресса; • ядро клетки; • нуклеоплазма; • цитозоль; • ядерное пятнышко;
Биологический процесс	• регуляция сайленсинга генов с помощью miRNA; • дифференциация клеток; • регуляция стабильности мРНК; • локомоторное поведение взрослых; • положительная регуляция сайленсинга генов с помощью miRNA; • дифференцировка стволовых клеток; • регуляция клеточного цикла; • посттранскрипционное молчание генов; • регулирование сегрегации хромосом; • положительная регуляция сигнального пути RIG-I; • дестабилизация мРНК; • сперматогенез; • регулирование перевода; • посттранскрипционная регуляция экспрессии генов; • производство miRNA, участвующих в подавлении генов с помощью miRNA;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	9698
	80912
	ENSG00000134644
	ENSMUSG00000028580
	Q14671
	Q80U78
	NM_014676; NM_001020658
	NM_001159603; NM_001159604; NM_001159605; NM_001159606; NM_030722
	NP_001018494; NP_055491
NP_001153075; NP_001153076; NP_001153077; NP_001153078; NP_109647;
	NP_001343493; NP_001343494; NP_001343495
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

PUM1

Pumilio гомолог 1 это белок что у людей кодируется PUM1 ген.^[4]

Функция

Этот ген кодирует члена семейства PUF, эволюционно сохраненный РНК-связывающие белки, относящиеся к белкам Pumilio Дрозофила и белки фактора связывания мРНК fem-3 C. elegans. Кодируемый белок содержит специфичный для последовательности РНК-связывающий домен, состоящий из восьми повторов и N- и C-концевых фланкирующих областей, и служит в качестве трансляционный регулятор специфических мРНК путем связывания с их 3'-нетранслируемыми областями. Эволюционно законсервированная функция кодируемого белка у беспозвоночных и низших позвоночных предполагает, что человеческий белок может участвовать в регуляции трансляции эмбриогенез, а также развитие и дифференциация клеток. Альтернативно сращивание Были описаны варианты транскриптов, кодирующие разные изоформы.^[4]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000134644 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ ^а ^б "Entrez Gene: PUM1 pumilio гомолог 1 (Drosophila)".

дальнейшее чтение

Спасов Д.С., Юречич Р. (2004). «Семейство РНК-связывающих белков PUF: соответствует ли эволюционно консервативная структура консервативной функции?». IUBMB Life. 55 (7): 359–66. Дои:10.1080/15216540310001603093. PMID 14584586.
Нагасе Т., Миядзима Н., Танака А. и др. (1995). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. III. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0081-KIAA0120), полученные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1». ДНК Res. 2 (1): 37–43. Дои:10.1093 / dnares / 2.1.37. PMID 7788527.
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Ван X, Заморе П.Д., Холл TM (2001). «Кристаллическая структура домена гомологии Pumilio». Мол. Ячейка. 7 (4): 855–65. Дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 00229-5. PMID 11336708.
Ван X, Маклахлан Дж, Замор П.Д., Холл TM (2002). «Модульное распознавание РНК человеческим доменом pumilio-гомологии». Ячейка. 110 (4): 501–12. Дои:10.1016 / S0092-8674 (02) 00873-5. PMID 12202039.
Спасов Д.С., Юречич Р. (2003). «Клонирование и сравнительный анализ последовательности генов PUM1 и PUM2, человеческих членов семейства РНК-связывающих белков Pumilio». Ген. 299 (1–2): 195–204. Дои:10.1016 / S0378-1119 (02) 01060-0. PMID 12459267.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
Дазард Дж. Э., Гал Х., Амариглио Н. и др. (2003). «Полногеномное сравнение реакции кератиноцитов и плоскоклеточной карциномы человека на облучение УФВ: последствия для рака кожи и эпителия». Онкоген. 22 (19): 2993–3006. Дои:10.1038 / sj.onc.1206537. PMID 12771951.
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID 14702039.
Бранденбергер Р., Вэй Х., Чжан С. и др. (2005). «Характеристика транскриптома проясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку ES-клеток человека». Nat. Биотехнология. 22 (6): 707–16. Дои:10.1038 / nbt971. PMID 15146197.
Колланд Ф., Жак Х, Труплин В. и др. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Genome Res. 14 (7): 1324–32. Дои:10.1101 / гр. 2334104. ЧВК 442148. PMID 15231748.
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514.
Джорданова А., Ироби Дж., Томас Ф. П. и др. (2006). «Нарушение функции и распределения аксонов мутантной тирозил-тРНК синтетазы при доминантной промежуточной нейропатии Шарко-Мари-Тута». Nat. Genet. 38 (2): 197–202. Дои:10,1038 / ng1727. PMID 16429158.
Грегори С.Г., Барлоу К.Ф., Маклей К.Э. и др. (2006). «Последовательность ДНК и биологическая аннотация хромосомы 1 человека». Природа. 441 (7091): 315–21. Дои:10.1038 / природа04727. PMID 16710414.
Лим Дж., Хао Т., Шоу С. и др. (2006). «Сеть белок-белкового взаимодействия для унаследованных атаксий человека и нарушений дегенерации клеток Пуркинье». Ячейка. 125 (4): 801–14. Дои:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569.
Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Ячейка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.